-
तुलनात्मक जीनोमिक्स
तुलनात्मक जीनोमिक्सले विभिन्न प्रजातिहरू बीचको सम्पूर्ण जीनोम अनुक्रम र संरचनाहरूको परीक्षण र तुलना समावेश गर्दछ। यस क्षेत्रले प्रजातिहरूको विकास, डिकोड जीन कार्यहरू, र विभिन्न जीवहरूमा संरक्षित वा भिन्न अनुक्रम संरचनाहरू र तत्वहरू पहिचान गरेर आनुवंशिक नियामक संयन्त्रहरू स्पष्ट पार्न खोज्छ। एक व्यापक तुलनात्मक जीनोमिक्स अध्ययनले जीन परिवार, विकासवादी विकास, सम्पूर्ण-जीनोम डुप्लिकेशन घटनाहरू, र चयनात्मक दबाबहरूको प्रभाव जस्ता विश्लेषणहरू समावेश गर्दछ।
-
इभोलुसनरी जेनेटिक्स
जनसंख्या र विकासवादी आनुवंशिक विश्लेषण प्लेटफर्म BMK आर एन्ड डी टोली भित्र वर्षौं को लागी संचित विशाल अनुभव को आधार मा स्थापित छ। यो विशेष गरी बायोइन्फर्मेटिक्समा प्रमुख नभएका अनुसन्धानकर्ताहरूका लागि प्रयोगकर्ता मैत्री उपकरण हो। यस प्लेटफर्मले फाइलोजेनेटिक रूख निर्माण, लिङ्केज असमानता विश्लेषण, आनुवंशिक विविधता मूल्याङ्कन, चयनात्मक स्वीप विश्लेषण, नाता विश्लेषण, PCA, जनसंख्या संरचना विश्लेषण, आदि सहित आधारभूत विकासवादी आनुवंशिकी सम्बन्धित आधारभूत विश्लेषण सक्षम गर्दछ।
-
हाई-सी आधारित जीनोम असेंबली
हाई-सी प्रोबिङ प्रोक्सिमिटी-आधारित अन्तरक्रिया र उच्च-थ्रुपुट अनुक्रम संयोजन गरेर क्रोमोजोम कन्फिगरेसन क्याप्चर गर्न डिजाइन गरिएको विधि हो। यी अन्तरक्रियाहरूको तीव्रता क्रोमोजोमहरूमा भौतिक दूरीसँग नकारात्मक रूपमा सहसंबद्ध मानिन्छ। तसर्थ, हाइ-सी डाटा ड्राफ्ट जीनोममा जम्मा गरिएका अनुक्रमहरूको क्लस्टरिङ, क्रमबद्ध र अभिमुखीकरण गर्न र क्रोमोजोमहरूको निश्चित संख्यामा एंकरिङ गर्न प्रयोग गरिन्छ। यो प्रविधिले जनसंख्या-आधारित आनुवंशिक नक्साको अनुपस्थितिमा क्रोमोजोम-स्तर जीनोम एसेम्बलीलाई सशक्त बनाउँछ। प्रत्येक एकल जीनोमलाई हाई-सी चाहिन्छ।
-
प्लान्ट/एनिमल डे नोवो जीनोम सिक्वेन्सिङ
डे नोवोअनुक्रमणले सन्दर्भ जीनोमको अनुपस्थितिमा अनुक्रमण प्रविधिहरू प्रयोग गरेर प्रजातिको सम्पूर्ण जीनोमको निर्माणलाई जनाउँछ। तेस्रो-पुस्ताको अनुक्रमणको परिचय र व्यापक रूपमा अपनाउने, लामो पढाइको विशेषताले, पढाइहरू बीचको ओभरल्याप बढाएर जीनोम असेंबलीलाई उल्लेखनीय रूपमा बढाएको छ। यो वृद्धि विशेष गरी सान्दर्भिक हुन्छ जब चुनौतीपूर्ण जीनोमहरू, जस्तै उच्च हेटरोजाइगोसिटी प्रदर्शन गर्ने, दोहोरिने क्षेत्रहरूको उच्च अनुपात, पोलिप्लोइडहरू, र दोहोरिने तत्वहरू भएका क्षेत्रहरू, असामान्य GC सामग्रीहरू, वा उच्च जटिलता जुन सामान्यतया छोटो-पढ्ने अनुक्रम प्रयोग गरेर खराब रूपमा भेला हुन्छन्। एक्लै।
हाम्रो एक-स्टप समाधानले एकीकृत अनुक्रमण सेवाहरू र जैव सूचनात्मक विश्लेषण प्रदान गर्दछ जसले उच्च-गुणस्तरको डे नोवो एसेम्बल गरिएको जीनोम प्रदान गर्दछ। Illumina को साथ एक प्रारम्भिक जीनोम सर्वेक्षणले जीनोम आकार र जटिलता को अनुमान प्रदान गर्दछ, र यो जानकारी PacBio HiFi संग लामो-पढ्ने अनुक्रम को अर्को चरण मार्गदर्शन गर्न को लागी प्रयोग गरिन्छ, पछिनयाँcontigs को विधानसभा। HiC असेंबलीको पछिल्ला प्रयोगले क्रोमोजोम-स्तर असेंबली प्राप्त गर्दै, जीनोममा कन्टिग्सको एङ्करिङलाई सक्षम बनाउँछ। अन्तमा, जीनोम जीन भविष्यवाणी द्वारा एनोटेट गरिएको छ र व्यक्त जीनहरू क्रमबद्ध गरेर, छोटो र लामो पढाइको साथ ट्रान्सक्रिप्टोमहरूको सहारा लिएर।
-
मानव सम्पूर्ण एक्सोम अनुक्रमण
ह्युमन होल एक्सोम सिक्वेन्सिङ (hWES) लाई रोग-सम्पादन गर्ने उत्परिवर्तनहरू पत्ता लगाउनको लागि लागत-प्रभावी र शक्तिशाली अनुक्रमण दृष्टिकोणको रूपमा व्यापक रूपमा स्वीकार गरिन्छ। सम्पूर्ण जीनोमको लगभग 1.7% मात्र गठन भए तापनि, एक्सोनहरूले कुल प्रोटीन प्रकार्यहरूको प्रोफाइललाई प्रत्यक्ष रूपमा प्रतिबिम्बित गरेर महत्त्वपूर्ण भूमिका खेल्छन्। उल्लेखनीय रूपमा, मानव जीनोममा, रोगहरूसँग सम्बन्धित 85% भन्दा बढी उत्परिवर्तनहरू प्रोटीन कोडिङ क्षेत्रहरूमा प्रकट हुन्छन्। BMKGENE ले विभिन्न अनुसन्धान लक्ष्यहरू पूरा गर्न उपलब्ध दुई फरक एक्सोन क्याप्चरिङ रणनीतिहरूको साथ एक व्यापक र लचिलो मानव पूर्ण एक्सोम अनुक्रमण सेवा प्रदान गर्दछ।
-
स्पेसिफिक-लोकस एम्प्लीफाइड फ्र्याग्मेन्ट सिक्वेन्सिङ (SLAF-Seq)
उच्च-थ्रुपुट जीनोटाइपिङ, विशेष गरी ठूला-ठूला जनसंख्याहरूमा, आनुवंशिक एसोसिएशन अध्ययनको आधारभूत चरण हो र यसले कार्यात्मक जीन खोज, विकासवादी विश्लेषण, इत्यादिको लागि आनुवंशिक आधार प्रदान गर्दछ। गहिरो सम्पूर्ण जीनोम पुन: अनुक्रमणको सट्टा,कम प्रतिनिधित्व जीनोम अनुक्रमण (RRGS)आनुवंशिक मार्कर खोजमा उचित दक्षता कायम राख्दै प्रति नमूना अनुक्रम लागत कम गर्न प्रायः यी अध्ययनहरूमा प्रयोग गरिन्छ। RRGS ले प्रतिबन्ध इन्जाइमहरूको साथ DNA पचाउन र एक विशिष्ट टुक्रा साइज दायरामा ध्यान केन्द्रित गरेर यो प्राप्त गर्दछ, यसैले जीनोमको एक अंश मात्र अनुक्रमण गर्दछ। विभिन्न RRGS विधिहरू मध्ये, विशिष्ट-लोकस एम्प्लीफाइड फ्र्याग्मेन्ट सिक्वेन्सिङ (SLAF) एक अनुकूलन योग्य र उच्च-गुणस्तरको दृष्टिकोण हो। BMKGene द्वारा स्वतन्त्र रूपमा विकसित गरिएको यो विधिले प्रत्येक परियोजनाको लागि सेट गरिएको प्रतिबन्ध इन्जाइमलाई अनुकूलन गर्छ। यसले पर्याप्त संख्यामा SLAF ट्यागहरू (जीनोमको 400-500 bps क्षेत्रहरू क्रमबद्ध गरिँदैछ) को उत्पादन सुनिश्चित गर्दछ जुन प्रभावकारी रूपमा दोहोरिने क्षेत्रहरूलाई बेवास्ता गर्दै, सबै भन्दा राम्रो आनुवंशिक मार्कर खोज सुनिश्चित गर्दै जीनोममा समान रूपमा वितरण गरिन्छ।
-
Illumina पूर्व-निर्मित पुस्तकालयहरू
इलुमिना सिक्वेन्सिङ टेक्नोलोजी, सिक्वेन्सिङ बाई सिन्थेसिस (SBS) मा आधारित, विश्वव्यापी रूपमा ग्रहण गरिएको NGS नवाचार हो, जसले विश्वको 90% भन्दा बढी अनुक्रम डेटा उत्पन्न गर्न जिम्मेवार छ। SBS को सिद्धान्तमा इमेजिङ फ्लोरोसेन्टली लेबल गरिएको रिभर्सिबल टर्मिनेटरहरू समावेश छन् किनकि प्रत्येक dNTP थपिएको छ, र पछि अर्को आधारको समावेश गर्न अनुमति दिन क्लीभ गरिएको छ। प्रत्येक अनुक्रम चक्रमा उपस्थित सबै चार रिभर्सिबल टर्मिनेटर-बाउन्ड dNTPs संग, प्राकृतिक प्रतिस्पर्धाले निगमन पूर्वाग्रहलाई कम गर्छ। यो बहुमुखी प्रविधिले एकल-पढ्ने र जोडी-अन्त पुस्तकालयहरूलाई समर्थन गर्दछ, जीनोमिक अनुप्रयोगहरूको दायरालाई पूरा गर्दै। इल्युमिना सिक्वेन्सिङको उच्च-थ्रुपुट क्षमताहरू र सटीकताले यसलाई जीनोमिक्स अनुसन्धानमा आधारशिलाको रूपमा राख्छ, वैज्ञानिकहरूलाई बेजोड विवरण र दक्षताका साथ जीनोमहरूको जटिलताहरू खोल्न सशक्त बनाउँछ।
हाम्रो पूर्व-निर्मित पुस्तकालय अनुक्रमण सेवाले ग्राहकहरूलाई विभिन्न स्रोतहरू (mRNA, सम्पूर्ण जीनोम, एम्प्लिकन, 10x पुस्तकालयहरू, अन्यहरू बीच) बाट अनुक्रमण पुस्तकालयहरू तयार गर्न सक्षम बनाउँछ। पछि, यी पुस्तकालयहरूलाई Illumina प्लेटफर्महरूमा गुणस्तर नियन्त्रण र अनुक्रमणिका लागि हाम्रो अनुक्रमण केन्द्रहरूमा पठाउन सकिन्छ।
