Pacbio पूर्ण-लम्बाइ ट्रान्सक्रिप्टोम

PacBio पूर्ण-लम्बाइ ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिङ, Isoseq ले ट्रान्सक्रिप्ट आइसोफर्महरूको सही पहिचान, वैकल्पिक पोलीएडेनिलेसन र स्प्लिसिङमा प्रकाश पार्ने, र थप सटीक जीन अभिव्यक्ति विश्लेषणको लागि नेतृत्व गर्न सक्षम बनाउँछ। BMKCloud PacBio पूर्ण-लम्बाइ ट्रान्सक्रिप्टोम पाइपलाइन सर्कुलर कन्सेन्सस सिक्वेन्सिङ (CCS) मोडमा अनुक्रमित cDNA पुस्तकालयहरूको विश्लेषण गर्न र पूर्ण-लम्बाइको गैर-चिमरिक (FLNC) अनुक्रमहरू पहिचान गर्न डिजाइन गरिएको हो, जुन त्यसपछि गैर-अनावश्यक transcript मा क्लस्टर गरिन्छ। त्यसपछिको BUSCO विश्लेषणले ट्रान्सक्रिप्टोम एसेम्बलीको पूर्णताको मूल्याङ्कन गर्दछ। एसेम्बल ट्रान्सक्रिप्टोमबाट, बहुविध विश्लेषणहरू गरिन्छ: वैकल्पिक विभाजन, सरल अनुक्रम दोहोरिने (SSR), lncRNA र सम्बन्धित लक्ष्य जीनको भविष्यवाणी, उपन्यास जीनहरूको भविष्यवाणी, जीन परिवार विश्लेषण, ट्रान्सक्रिप्शन कारक विश्लेषण, र ट्रान्सक्रिप्टहरूको कार्यात्मक एनोटेशन।