BMKCLADAWADE लग इन
1

MRNA-SEQ (NGS) सन्दर्भ जीनोमको साथ

百迈客云网站-111

MRNA-SEQ (NGS) सन्दर्भ जीनोमको साथ

आरएनए-SEQ जीवन र क्रपर बालीनाली उपकरण हो, जीनोम र प्रोफेमिट बीचको अन्तरलाई चोट पुर्याउँछ। यसको शक्तिले नयाँ परिक्रमणहरू पत्ता लगाउन र एक अयोग्यमा तिनीहरूको अभिव्यक्तिमा सुधार ल्याउँछ। यो विकरल ट्रान्सक्रिप्टितिक अध्ययनहरूको लागि व्यापक रूपमा प्रयोग गरीन्छ, विभिन्न स्वभाव वा फेनिटाइपसँगको सम्बन्धमा प्रकाश पार्नु, जंगली-प्रकारका वा विशिष्ट सर्तहरूको आधारमा, विशिष्ट सर्तहरू अन्तर्गत। बीएमकेक्लाइट एमआरएनए (सन्दर्भ) अनुप्रयोगले अभिव्यक्तित्मक अभिव्यक्ति, बिभिन्न अभिव्यक्ति विश्लेषण (डिग्री) र अनुक्रम संरचना विश्लेषण गर्दछ र समान सफ्टवेयरको सामर्थ्यहरू। प्रयोगकर्ताहरूले क्लाउडमा उनीहरूको RNA-SEQ PRE डाटा अपलोड गर्न सक्दछ, जहाँ अनुप्रयोगले एक व्यापक, एक स्टप बायोनिनर-विश्लेषणकर्ताले विश्लेषण समाधान प्रदान गर्दछ। थप रूपमा, यसले ग्राहकहरूको अनुभवलाई प्राथमिकता दिन्छ, प्रयोगकर्ताहरूको विशिष्ट आवश्यकताहरूको लागि निजीकृत कार्यहरू प्रदान गर्दै। प्रयोगकर्ताहरूले प्यारामिटरहरू सेट गर्न सक्दछन् र आफैंले पाइपलाइन मिशन बुझाउन सक्छन्, अन्तर्क्रियात्मक रिपोर्ट जाँच गर्नुहोस्, डाटा / रेखाचित्र हेर्नुहोस्, लक्षित जीनल चयन, क्रियापद।

डेमो नतिजा
डाटा खानी
आयात आवश्यकता
मुख्य विश्लेषण
मध्यस्थ
डेमो नतिजा

डाटा खानी

आयात आवश्यकता

प्लेटफर्म:इलुमिना, MGI
रणनीति:Rna-seq
नक्शा: पेन, सफा डाटा।
पुस्तकालय प्रकार:फ्रि-अनस्ट्रेड, फ्रि-पहिलो वा फ्रेन्डस्ट्रान्ड
लम्बाई पढ्नुहोस्:1 1500 बीपी
फाईल प्रकार:*। प्रणाली हुनेछस्वचालित रूपमा थ्रीय फाईलहरूको नाम अनुसार सम्मिलित गर्नुहोस्,उदाहरण * _1.grava -_ 2._ 2.3._ 2.
नमूनाहरूको संख्या:संख्यामा कुनै प्रतिबन्धहरू छैनन्नमूनाहरूको, तर विश्लेषण समय को संख्या को रूप मा बढ्नेछनमूनाहरू बढ्छन्।
सिफारिश गरिएको डाटा रकम:6g प्रति नमूना

मुख्य विश्लेषण
MRNA-SAQ (सन्दर्भ) को मुख्य विश्लेषण र बायोनिनफार्मेटिक उपकरणहरूपाइपलाइन निम्नानुसार छ:
1 रावदाटा गुणस्तर नियन्त्रण:
• कम-गुणवत्ता अनुक्रमहरू, एडाप्टर अनुक्रमहरू हटाउने,आदि;
• उपकरणहरू: घरमा पाइपलाइन विकसित भयो;
2 सन्दर्भमा डाटाको प ign ्क्तिबद्धता:
• प ign ्क्तिबद्ध गर्दै एक स्क्सिस-सचेत एल्गोरिथ्म संगसन्दर्भ जेमोन
• उपकरणहरू:Byat2, सामूल्ली
। लाइब्रेरी गुणवत्ता विश्लेषण:
Gook लम्बाई विश्लेषण घुसाउनुहोस्, अनुक्रम संतृप्ति विश्लेषण, आदि;
• उपकरणहरू:सामूल्ली;
। अनुक्रम संरचना विश्लेषण:
• वैकल्पिक स्पिलिंग विश्लेषण, जीन संरचना अनुकूलन,उपन्यास ग्राहण भविष्यवाणी, आदि;
• उपकरणहरू:Cartry, gffecpepare, दौड,हीरा, इन्टरोस्केन, रहमर.
। भिन्न अभिव्यक्ति विश्लेषण:
• deg डिक्री, कम्पनी विश्लेषण, कार्यात्मकसंदर्भ
•Uविभिन्न दृश्यता परिणामहरू;
•URसितSegseq, DeeSeq2, ggplot2, Dexseq
मध्यस्थ
1 किम, डेहेवान एट अल। "ग्राफ-आधारित जीनोम प ign ्क्तिबद्धता रByat2 र orat-jorn-jornyype को साथ जेनोटिपिंग। "प्रकृतिBATECHECHOLLOLLY(37 (201)): 907 - 95 15।
2 Mcknkna, Aaron एट अल। "जीनो एपीआईसिस टुल्किट: Aकोप्ट्रेड टेरेशन फ्रेमवर्कको लागि विश्लेषणको लागि विश्लेषणको लागिshavening डाटा। "जेनम अनुसन्धान20 ((2010): 12 -7--3003।
। Li, Lang एट अल। "अनुक्रम प ign ्क्तिबद्धता / नक्शा ढाँचा रसामूल्स "Biolinronfortics2 ((200)): 207888 - 2079.
। Perţaa, myhaela एट अल। "स्ट्रिटडी सुधार सक्षम गर्दछRNA-SEQ बाट ट्रान्सक्रिप्टोम पुन: निर्माण गर्नुहोस्। "प्रकृतिBATECHECHOLLOLLY((201)): 2 90 0-295।
।। प्रेम, माइकल I. एट अल। "फोल्ड परिवर्तनको मध्यम अनुमान रdeneq2 को साथ RNA-Sext डाटाको लागि घृणित। "सुन्दरताजीव विज्ञान1 ((201)): एन। Pag।
। EDDY, SEN RI .. "त्वरित प्रोफाइल हम्म खोजीहरू।"स्वर कम्प्यूटर द्विज्ञानता((2011): n Pag।

एक उद्धरण प्राप्त गर्नुहोस्

तपाईंको सन्देश यहाँ लेख्नुहोस् र हामीलाई पठाउनुहोस्

हामीलाई तपाईंको सन्देश पठाउनुहोस्: