सम्पूर्ण जेनमेन समाप्त
सॉर्स-COV-2 Enchoochers को अनुगमन अनुपादक एक NSP1 मेटेशन संस्करण एक संक्षिप्त छ कि मोडफेनर प्रतिक्रिया
Nanopore | इलुमिना | सम्पूर्ण जेनमेन हटाइयो मेटाग्राम | RNA-SEQ | सिद्ध दल
बायोमाकर टेक्नोलोजीहरू यस अध्ययनमा नमूना सिटीमा प्राविधिक समर्थन प्रदान गर्दै।
हाइलाइटहरू
1. वर्क-COV-22 GUMENTING र Phylognetic विश्लेषण 35 35 स्मारक संधुसले scts 35 स्क्रू र plance हल समावेश गर्दछ।
2. 117 क्लिनिकल phenotyysps को साथ सम्पर्क क्षमताले प्रकट गर्दछ
महत्त्वपूर्ण उत्परिवर्तन।
N.00-5332222 अवधिमा NSP1 कोडिंग क्षेत्र कम भाइरलको साथ सहकार्य गर्दछ
Old। डाउनलोड र सीरम IFN-β।
I.VALLALLESSSSSESSSSSESSSES δ500-5322 माथीको साथ कम
संक्रमित कक्षहरूमा प्रतिक्रिया।
प्रयोगात्मक डिजाइन
ग्रहण
1। Coviod-19 Emidmiolic र जूनोमिक निगरानी
सिचुआज प्रान्तमा क्लिनिकल डाटा स collected ्कलन गरिएको थियो, चीनदेखि 2020 देखि 2020 देखि QPCR मा Q238 काविड परीक्षणको आधारमा QPCR को परीक्षणबाट पुष्टि भयो। पूंजी सिचुनमा पुष्टि गरिएको अवस्थामा तत्काल बढ्यो, जनवरी 30 मा। साथै, सामाजिक कष्टदाताको भाइरस फैलाउन रोक्ने कुञ्जी कारक हुन सक्छ भनेर पनि जोड दियो।
चित्र 1। सिचुड्स 1 of को EMEDMIOLOLOLOLOLY अध्ययन, चीन
2 SERS-COV-2 2 Genome निर्माण र भेरियन्टहरू पहिचान
GLALEX PCRR Emplication को साथ Nanopore seque encence द्वारा, कुल 3110 वा आंशिक-पूर्ण जीनोमहरू करीव 2 preass1 बिरामीहरु को साथ उत्पन्न गरिएको थियो। % 0% जनसंख्या 10 पढ्नुहोस् (यसको मतलब गहिराई: 0.39 m मिटर प्रति नमूना पढ्नुहोस्)।
चित्र 2। सिचुन कोहोर्टमा प्रत्येक भेरियन्टहरूको फ्रिक्वेन्सी
कूल 104 स्निएप्स र 1 Endjects हीलहरू सार-कोव -2 जीभबाट पहिचान गरियो, जसमा 311 स्क्रूहरू र 4 ईन्डेरेटहरू पहिचान गरिएको आनुवंशिक भेरियन्टहरूको रूपमा पहिचान गरिएको थियो। तिनीहरूलाई wauon बाट 1 169 pliests नमूनाहरूको तुलना गरेर र give1,391 उच्च गुणवत्ता प्रकाशन राइच रायक्युनिंग जीवाइचहरू, अन्य महादेशहरूमा 35 35 वटा प्रकारका थिए। नम्बरको, चार -5332, acc1832, AC12-73737 र T132433 मा चार प्रकारका सिस्टुआन डेटामा मात्र प्रस्तुत गरिएको थियो, जुन भेट्टाउँदछ जुन भेट्टाउँदछ, जुन भेट्टाउँदछ बिरामीहरूको यात्रा रेकर्ड।
अधिकतम संभावना (ML) विधिका साथ विकासशील विश्लेषणको साथ र Baysianianal आणविक घडी सिंड 11 88 नयाँ भाइरस SFRUAN र BE0 अन्य क्षेत्रहरूबाट विनन्ज गर्न विनियोजन गरिएको थियो। Δ5500-5332222 को साथ जीनोमहरू (नेस्प्लो कोडिंग क्षेत्र मा मेट्रिसन फेला परेका phylogetic रूख मा विरलै वितरित गरिएको थियो। NSP1 भेरियन्टहरूमा हपलटाइप विश्लेषणले ती बहु शहरहरूबाट 5 जनाएको छ। यी परिणामहरूले सुझाव दियो कि बहु शहरहरूमा δ 500--5322 जनाले देखाए र वाउहानबाट धेरै पटक आयात गर्न सकिन्छ।
चित्र 2। आवर्ती आनुवंशिक भेरियन्टहरू र सॉलीजेटनेटिक विश्लेषणहरू सार-कोभ -2 Genomes
। क्लिनिकल प्रभावहरूको साथ बारम्बार ईन्टरेटिक भेरियन्टहरूको संघ
117 क्लिनिकल फेनोटाइपहरू Covide-19 तीव्रता संग सम्बन्धित थिए जहाँ 1 sever स्थायी-सम्बन्धित फेनोटाइपहरू गम्भीर र गैर-गम्भीर लक्षणहरूमा वर्गीकृत गरिएको थियो। यी लक्षणहरू र sub 35 दोहोरिने आनुवंशिक भेरियन्टहरू द्वि-क्लस्टर हीटम्यापमा विसंगत भएका थिए। एक gsea-whance rancehation विश्लेषण विश्लेषणले देखाइएको छ कि δ500--532 मा नकारात्मक संगै, सीनम ird-+ + CD8 + T सेल गणना गर्दछ। यसबाहेक, QPCR परीक्षणहरूले भाइरसबाट संक्रमित बिरामीहरू देखाईयो कि भाइरसको बिरामीहरू छन् δ5500-53322 को उच्चतम सीटी मान, अर्थात् सब भन्दा कम भाइरल लोड।
चित्र 35 35 tronserrengrent आनुवंशन आर्मीटिनिक भेरियटाहरू क्लिनिकल PENOTYPES को साथ
।
NSP1 प्रकार्यहरूमा δ500-5332 को असर बुझ्नको लागि हेक 233999T सेलहरू प्लाद्जिडहरू पूर्ण लम्बाई, wt nps1 र Morstens को साथ संक्रमण भयो। प्रत्येक उपचार गरिएको हेक 23999T को ट्रान्सस्क्रिप्ट प्रोफाइलहरू PCCO विश्लेषणको लागि प्रशोधन गरिएको थियो, देखाउँदै कि नाइट्स विश्लेषणहरू अपेक्षा गर्दै डब्ल्यूपी एनसीपीआईबाट भिन्नै थिए। जीनहरू जुन उत्परिवनमा आधारित थिए म्यूप्टर बायोस्लेक्टेटिक / मेटाबोल्टन प्रक्रिया "," रिम्ब्रानिन स्टेशनस "," प्रोटीनले wte.templation बाकता देखायो।
चित्र 4. HOK239999T सेलहरूमा ट्रान्सस्क्रिप्टोमिशन विश्लेषण र WT NPSTISER द्वारा फैलियो र यो मेटाउनेको साथ
ITN-1 प्रतिक्रियामा मेटाउने असर प्रभाव पनि ओभरक्टोड गरिएको अध्ययनमा परीक्षण गरिएको थियो। सबै परीक्षण गरिएको मेट्रिसनहरू संक्रमण भएको हेक 2399T र प्रोटीन स्तरमा रूपान्तरित HAK239TESTES र प्रोटीन स्तरमा A549 coms सेलहरू कम गर्न देखाईयो। चाखलाग्दो कुरा के छ भने, "मेटाउनको लागि महत्त्वपूर्ण तल-विनियमित जीन" भाइरसको रक्षात्मक सम्बन्ध "मा समृद्ध भएको छ", Rnale Polymese II "द्वारा ट्रान्सक्रिप्शन" र म Interferon टाइप गर्न को लागी अनुवाद "।
चित्र।
यस अध्ययनमा, यी हटाइएका भाइरसमा भाइरसमा भाइरल संक्रमणको अध्ययनलाई थप पुष्टि गरियो। केहि उत्कट उत्कट उत्कटताका साथ चिकित्सक क्लिनिकल नमूनाहरूबाट अलग थिए र क्याल-coms कक्षहरूमा संक्रमित थिए। भाइरल संक्रमण अध्ययनमा विस्तृत परिणामहरू कागजमा पढ्न सकिन्छ।
डोरी:10.1016 / J.chom.2021.01.01।
मध्यस्थ
लिन जे, टा ang सी, Wei h, एट अल। सॉर्स-COV-2 Enchoose unovers एक NSP1 मेटेशन संस्करण को एक NSP1 मेटाउने संस्करण एक प्रकारको मोडेड प्रकारहरू # j]। सेल होस्ट र मीरोब, 2021।
समाचार र हाइलाइटहरू बायोमाकर टेक्नोलोजीहरूको साथ भर्खरको सफल केसहरू साझेदारी गर्ने लक्ष्य राख्दछ, उपन्यास वैज्ञानिक उपलब्धिहरू कब्जा गरिएको साथै अध्ययनको क्रममा प्रख्यात प्रविधिहरू।
पोष्ट समय: जनवरी-06-2022