नानोपोर पूर्ण-लम्बाइ ट्रान्सक्रिप्टोम

नानोपोर ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिङ पूर्ण-लम्बाइको सीडीएनएहरू क्रमबद्ध गर्नको लागि एक शक्तिशाली विधि हो, सही रूपमा ट्रान्सक्रिप्ट आइसोफर्महरू पहिचान गर्न र मात्रा निर्धारण गर्न। BMKCloud नानोपोर पूर्ण-लम्बाइ ट्रान्सक्रिप्टोम पाइपलाइन नानोपोर प्लेटफर्ममा उत्पन्न गरिएको RNA-Seq डाटालाई उच्च गुणस्तरको राम्रो-एनोटेट सन्दर्भ जीनोम विरुद्ध विश्लेषण गर्न डिजाइन गरिएको छ, दुबै जीन र ट्रान्सक्रिप्ट स्तरमा गुणात्मक र मात्रात्मक विश्लेषण प्रदान गर्दछ। गुणस्तर नियन्त्रण पछि, पूर्ण-लम्बाइ गैर-काइमरिक (FLNC) अनुक्रमहरू प्राप्त गरिन्छ र अनावश्यक ट्रान्सक्रिप्टहरू हटाउनको लागि सन्दर्भ जीनोममा सहमति अनुक्रमहरू म्याप गरिन्छ। यस ट्रान्सक्रिप्ट सेटबाट, अभिव्यक्ति परिमाणबद्ध हुन्छ र भिन्न रूपमा व्यक्त जीनहरू र ट्रान्सक्रिप्टहरू पहिचान गरी कार्यात्मक रूपमा एनोटेट गरिन्छ। पाइपलाइनमा वैकल्पिक पोलीएडेनाइलेशन (एपीए) विश्लेषण, वैकल्पिक स्प्लिसिङ विश्लेषण, सरल अनुक्रम दोहोरिने (एसएसआर) विश्लेषण, lncRNA र सम्बन्धित लक्ष्यहरूको भविष्यवाणी, कोडिङ अनुक्रम (CDS) को भविष्यवाणी, जीन परिवार विश्लेषण, ट्रान्सक्रिप्शन कारक विश्लेषण, novel predigenes समावेश छ। र को कार्यात्मक एनोटेशन ट्रान्सक्रिप्टहरू।