mRNA-seq (NGS) - नयाँ

mRNA अनुक्रमणले विशेष परिस्थितिहरूमा कक्षहरूमा सबै mRNA ट्रान्सक्रिप्टहरूको प्रोफाइलिङलाई अनुमति दिन्छ र विभिन्न अनुसन्धान क्षेत्रहरूमा व्यापक रूपमा प्रयोग गरिएको प्रविधि हो। BMKCloud De novo mRNA-seq पाइपलाइन कुनै सन्दर्भ जीनोम उपलब्ध नभएको बेला पोली-ए समृद्ध अनुक्रम पुस्तकालयहरूको विश्लेषण गर्न डिजाइन गरिएको हो। पाइपलाइन गुणस्तर नियन्त्रणको साथ सुरु हुन्छ, त्यसपछिनयाँट्रान्सक्रिप्ट असेंबली र युनिजीन सेट चयन। युनिजीन संरचना विश्लेषणले कोडिङ अनुक्रम (CDS) र सरल अनुक्रम दोहोरिने (SSR) भविष्यवाणी गर्दछ। पछि, विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषणले परीक्षण गरिएका अवस्थाहरू बीच भिन्नता व्यक्त गरिएको जीनहरू (DEGs) फेला पार्छ, त्यसपछि जैविक अन्तर्दृष्टिहरू निकाल्न DEGs को कार्यात्मक एनोटेशन र समृद्धि।