इभोलुसनरी जेनेटिक्स
सेवा लाभहरू
Takagi et al.,प्लान्ट जर्नल, २०१३
●व्यापक जैव सूचनात्मक विश्लेषण:आनुवंशिक विविधताको अनुमानलाई सक्षम पार्दै, जसले प्रजातिहरूको विकासवादी सम्भावनालाई प्रतिबिम्बित गर्दछ, र अभिसरण विकास र समानान्तर विकासको न्यूनतम प्रभावको साथ प्रजातिहरू बीचको विश्वसनीय फाइलोजेनेटिक सम्बन्ध प्रकट गर्दछ।
●वैकल्पिक अनुकूलित विश्लेषण: जस्तै न्यूक्लियोटाइड र एमिनो एसिड स्तरमा भिन्नताहरूमा आधारित भिन्नता समय र गतिको अनुमान।
●विस्तृत विशेषज्ञता र प्रकाशन रेकर्ड: BMKGene ले 15 वर्ष भन्दा बढीको लागि जनसंख्या र विकासवादी आनुवंशिकी परियोजनाहरूमा ठूलो अनुभव सञ्चित गरेको छ, हजारौं प्रजातिहरू, इत्यादिलाई समेटेको छ र नेचर कम्युनिकेशन्स, मोलिक्युलर प्लान्ट्स, प्लान्ट बायोटेक्नोलजी जर्नल, इत्यादिमा प्रकाशित 1000 भन्दा बढी उच्च-स्तरीय परियोजनाहरूमा योगदान पुर्याएको छ।
● उच्च कुशल बायोइन्फर्मेटिक्स टोली र छोटो विश्लेषण चक्र: उन्नत जीनोमिक्स विश्लेषणमा उत्कृष्ट अनुभवको साथ, BMKGene को टोलीले द्रुत टर्नअराउन्ड समयको साथ व्यापक विश्लेषणहरू प्रदान गर्दछ।
● बिक्री पछि समर्थन:हाम्रो प्रतिबद्धता 3-महिना पछि-बिक्री सेवा अवधि संग परियोजना समाप्ति बाहिर विस्तार छ। यस समयमा, हामी परिणामहरूसँग सम्बन्धित कुनै पनि प्रश्नहरू सम्बोधन गर्न परियोजना फलो-अप, समस्या निवारण सहायता, र प्रश्नोत्तर सत्रहरू प्रस्ताव गर्दछौं।
सेवा निर्दिष्टीकरण र आवश्यकताहरू
| अनुक्रम को प्रकार | सिफारिस गरिएको जनसंख्या मापन | अनुक्रम रणनीति | न्यूक्लियोटाइड आवश्यकताहरू |
| सम्पूर्ण जीनोम अनुक्रमण | ≥ 30 व्यक्तिहरू, प्रत्येक उपसमूहबाट ≥ 10 व्यक्तिहरूसँग
| 10x | एकाग्रता: ≥ 1 एनजी / μL कुल रकम≥ 30ng सीमित वा कुनै गिरावट वा प्रदूषण |
| स्पेसिफिक-लोकस एम्प्लीफाइड फ्र्याग्मेन्ट (SLAF) | ट्याग गहिराई: 10x ट्याग संख्या: <400 Mb: WGS सिफारिस गरिएको छ <1Gb: 100K ट्यागहरू १ जीबी >2Gb: 300K ट्यागहरू अधिकतम 500k ट्यागहरू | एकाग्रता ≥ 5 ng/µL कुल रकम ≥ 80 एनजी Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Agarose जेल: कुनै वा सीमित गिरावट वा प्रदूषण
|
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिजाइन
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रम
डाटा विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
सेवामा जनसंख्या संरचना (फाइलोजेनेटिक रूख, PCA, जनसंख्या स्तरीकरण चार्ट), जनसंख्या विविधता, र जनसंख्या चयन (लिंकेज असन्तुलन, लाभदायक साइटहरूको चयनात्मक स्वीप-चयन) को विश्लेषण समावेश छ। सेवाले अनुकूलित विश्लेषण पनि समावेश गर्न सक्छ (जस्तै विचलन समय, जीन प्रवाह)।
*यहाँ देखाइएका डेमो परिणामहरू सबै BMKGENE सँग प्रकाशित जीनोमहरूका हुन्
1. इभोलुसन विश्लेषणले आनुवंशिक भिन्नताहरूमा आधारित फाइलोजेनेटिक रूख, जनसंख्या संरचना र PCA को निर्माण समावेश गर्दछ।
फाइलोजेनेटिक रूखले सामान्य पुर्खाको साथ प्रजातिहरू बीच वर्गीकरण र विकास सम्बन्धलाई प्रतिनिधित्व गर्दछ।
PCA ले उप-जनसंख्याहरू बीचको निकटताको कल्पना गर्ने लक्ष्य राख्छ।
जनसंख्या संरचनाले एलेल फ्रिक्वेन्सीको सन्दर्भमा आनुवंशिक रूपमा फरक उप-जनसंख्याको उपस्थिति देखाउँछ।
चेन, आदि। al.,PNAS, २०२०
2. चयनात्मक स्वीप
चयनात्मक स्वीपले एक प्रक्रियालाई बुझाउँछ जसद्वारा एक लाभदायक साइट चयन गरिन्छ र लिङ्क गरिएका तटस्थ साइटहरूको फ्रिक्वेन्सी बढाइन्छ र अनलिङ्क गरिएका साइटहरूको कमी हुन्छ, परिणामस्वरूप क्षेत्रीय घटाइन्छ।
चयनात्मक स्वीप क्षेत्रहरूमा जीनोम-वाइड पत्ता लगाउने कार्य निश्चित चरण (10 Kb) मा स्लाइडिङ विन्डो (100 Kb) भित्र सबै SNPs को जनसंख्या आनुवंशिक सूचकांक (π，Fst, Tajima's D) गणना गरेर प्रशोधन गरिन्छ।
न्यूक्लियोटाइड विविधता (π)
ताजिमाको डी
फिक्सेशन इन्डेक्स (Fst)
वू, आदि। al.,आणविक बिरुवा, 2018
3. जीन प्रवाह
वू, आदि। al.,आणविक बिरुवा, 2018
4. जनसांख्यिकीय इतिहास
झाङ, आदि। al.,प्रकृति पारिस्थितिकी र विकास, २०२१
5. विचलन समय
झाङ, आदि। al.,प्रकृति पारिस्थितिकी र विकास, २०२१
प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत BMKGene को इभोलुसनरी आनुवंशिकी सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरू अन्वेषण गर्नुहोस्:
हसन्यार, एके र अन्य। (2023) 'SNP आणविक मार्करहरू र उम्मेदवार जीनहरूको खोज Apis cerana cerana Larvae in Sacbrood भाइरस प्रतिरोधसँग सम्बद्ध सम्पूर्ण-Genome Resequences',आणविक विज्ञान को अन्तर्राष्ट्रिय जर्नल, २४(७)। doi: 10.3390/IJMS24076238।
चाई, जे एट अल। (2022) 'जङ्गली, आनुवंशिक रूपमा शुद्ध चिनियाँ विशाल सालामन्डरको खोजले नयाँ संरक्षण अवसरहरू सिर्जना गर्दछ',प्राणी अनुसन्धान, २०२२, भोल्युम। ४३, अंक ३, पृष्ठ: ४६९-४८०, ४३(३), पृष्ठ ४६९–४८०। doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101।
हान, एम. एट अल। (२०२२) 'फिलोजियोग्राफिकल ढाँचा र जनसंख्या विकास इतिहास छिन्घाई-तिब्बत पठारमा आदिवासी एलिमस सिबिरिकस एल।',वनस्पति विज्ञान मा फ्रंटियर्स, १३, पृ। 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX।
वाङ, जे एट अल। (2022) 'क्रोमोजोम-स्तर जीनोम एसेम्बली र लाङ्गन एक्सेसिन्सको जनसंख्या जीनोमिक्सबाट लांगन इभोलुसनमा जीनोमिक इनसाइट्स',बागवानी अनुसन्धान, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021।
