युकेरियोटिक mRNA अनुक्रमण-NGS
सुविधाहरू
● पुस्तकालय तयारी गर्नु अघि पोली mRNA को क्याप्चर
● स्ट्र्यान्ड-विशिष्ट अनुक्रमण डेटा प्राप्त गर्न सक्षम गर्न वैकल्पिक दिशात्मक mRNA पुस्तकालय तयारी
● जीन अभिव्यक्ति र ट्रान्सक्रिप्ट संरचनाको जैव सूचनात्मक विश्लेषण
फाइदाहरू
●व्यापक विशेषज्ञता: हाम्रो टोलीले BMKgene मा 600,000 नमूनाहरू प्रशोधन गरेको छ, विभिन्न नमूना प्रकारहरू जस्तै सेल कल्चरहरू, टिस्युहरू र शरीरको तरल पदार्थहरू फैलिएको छ। हामीले प्रत्येक परियोजनामा धेरै अनुभवहरू ल्याउँछौं र विभिन्न अनुसन्धान डोमेनहरूमा 100,000 mRNA-Seq परियोजनाहरू सफलतापूर्वक पूरा गरेका छौं।
●कडा गुणस्तर नियन्त्रण: हामी नमूना र पुस्तकालयको तयारीदेखि अनुक्रमण र बायोइन्फर्मेटिक्ससम्म सबै चरणहरूमा कोर नियन्त्रण बिन्दुहरू लागू गर्छौं। यो सावधानीपूर्वक अनुगमनले लगातार उच्च-गुणस्तरको नतिजाहरूको डेलिभरी सुनिश्चित गर्दछ, तपाइँलाई तपाइँको परियोजना विश्वसनीय हातमा छ भनेर सुनिश्चित गर्दछ।
●व्यापक एनोटेशन: हामी कार्यात्मक रूपमा भिन्न अभिव्यक्त जीनहरू (DEGs) एनोटेट गर्न र सम्बन्धित संवर्धन विश्लेषणहरू प्रदर्शन गर्न धेरै डाटाबेसहरू प्रयोग गर्छौं। यो व्यापक दृष्टिकोणले ट्रान्सक्रिप्टोम प्रतिक्रिया अन्तर्निहित सेलुलर र आणविक प्रक्रियाहरूमा अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ, तपाइँलाई तपाइँको परियोजनाको नतिजाहरूको बारेमा पूर्ण रूपमा सूचित गरिएको छ भन्ने सुनिश्चित गर्दै।
●पोस्ट-बिक्री समर्थन: हाम्रो प्रतिबद्धता 3-महिना पछि-बिक्री सेवा अवधि संग परियोजना समाप्ति बाहिर विस्तार छ। यस समयमा, हामी परिणामहरूसँग सम्बन्धित कुनै पनि प्रश्नहरू सम्बोधन गर्न परियोजना फलो-अप, समस्या निवारण सहायता, र प्रश्नोत्तर सत्रहरू प्रस्ताव गर्दछौं।
नमूना आवश्यकताहरू र डेलिभरी
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | Data सिफारिस गर्नुभयो | गुणस्तर नियन्त्रण |
| पोली ए समृद्ध | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 Gb | Q30≥85% |
नमूना आवश्यकताहरू:
न्यूक्लियोटाइड्स:
| Conc.(ng/μl) | रकम (μg) | शुद्धता | निष्ठा | |
| मानक पुस्तकालय | ≥ १० | ≥ ०.२ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 जेलमा देखाइएको सीमित वा कुनै प्रोटीन वा डीएनए प्रदूषण। | बिरुवाहरूको लागि: RIN≥4.0; जनावरहरूको लागि: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; सीमित वा कुनै आधार रेखा उचाइ |
| दिशात्मक पुस्तकालय | ≥ १० | ≥ ०.२ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 जेलमा देखाइएको सीमित वा कुनै प्रोटीन वा डीएनए प्रदूषण। | बिरुवाहरूको लागि: RIN≥4.0; जनावरहरूको लागि: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; सीमित वा कुनै आधार रेखा उचाइ |
● बिरुवाहरू:
जरा, स्टेम वा पंखुडी: 450 मिलीग्राम
पात वा बीउ: 300 मिलीग्राम
फल: 1.2 ग्राम
●जनावर:
हृदय वा आन्द्रा: 300 मिलीग्राम
भिसेरा वा मस्तिष्क: 240 मिलीग्राम
मांसपेशी: 450 मिलीग्राम
हड्डी, कपाल वा छाला: 1 ग्राम
● आर्थ्रोपोडहरू:
कीराहरू: 6 ग्राम
क्रस्टेसिया: 300 मिलीग्राम
● सम्पूर्ण रगत: १ ट्यूब
● कक्षहरू: १०6 कक्षहरू
सिफारिस गरिएको नमूना वितरण
कन्टेनर: 2 एमएल सेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन पन्नी सिफारिस गरिएको छैन)
नमूना लेबलिंग: समूह + प्रतिकृति जस्तै A1, A2, A3; B1, B2, B3...
ढुवानी:
1. ड्राई-बरफ: नमूनाहरू झोलाहरूमा प्याक गरी ड्राई-बरफमा गाडिनु पर्छ।
2. RNAs तालिका ट्यूबहरू: RNA नमूनाहरू RNA स्थिरीकरण ट्यूब (जस्तै RNAstable®) मा सुकाउन सकिन्छ र कोठाको तापक्रममा पठाउन सकिन्छ।
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिजाइन
नमूना वितरण
आरएनए निकासी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रम
डाटा विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
बायोइन्फर्मेटिक्स
युकेरियोटिक mRNA अनुक्रम विश्लेषण कार्यप्रवाह
बायोइन्फर्मेटिक्स
Øकच्चा डाटा गुणस्तर नियन्त्रण
Øसन्दर्भ जीनोम पङ्क्तिबद्धता
Øट्रान्सक्रिप्ट संरचना विश्लेषण
Øअभिव्यक्ति परिमाणीकरण
Øभिन्न अभिव्यक्ति विश्लेषण
Øप्रकार्य एनोटेशन र संवर्धन
सन्दर्भ जीनोम पङ्क्तिबद्धता
डाटा संतृप्ति
जैविक प्रतिकृतिहरूको नमूना सहसंबंध र मूल्याङ्कन
भिन्न अभिव्यक्त जीन्स (DEGs)
DEGs को कार्यात्मक एनोटेशन
DEGs को कार्यात्मक संवर्धन
प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत BMKGene को युकेरियोटिक NGS mRNA अनुक्रमण सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरू अन्वेषण गर्नुहोस्।
Huang, L. et al। (2023) 'ट्राइक्लोसन र ट्राइक्लोकार्बनले गन्धको पहिचानमा बाधा पुर्याएर, घ्राण संकेत ट्रान्सडक्सनमा बाधा पुर्याएर, र घ्राण सूचना प्रशोधनमा बाधा पुर्याएर सुनको माछाको घ्राण क्षमतालाई कमजोर बनाउँछ', वाटर रिसर्च, 233, p। 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736।
जिया, एलजे एट अल। (2023) 'एस्परगिलस फ्युमिगाटसले मानव p11 लाई फङ्गल युक्त फागोसोमहरूलाई गैर-डिग्रेडेटिभ मार्गमा रिडिरेक्ट गर्न अपहरण गर्दछ', सेल होस्ट र माइक्रोब, 31(3), pp. 373-388.e10। doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002।
जिन, के एट अल। (२०२२) 'टीसीपी ट्रान्सक्रिप्शन फ्याक्टर्स इन्भल्ड इन शूट डेभलपमेन्ट अफ मा बाँम्बो (डेन्ड्रोकालामस ल्याटिफ्लोरस मुनरो)', फ्रन्टियर्स इन प्लान्ट साइन्स, १३, पृ। 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX।
वेन, एक्स एट अल। (2022) 'द क्रिसेन्थेमम ल्याभान्डुलिफोलियम जीनोम एन्ड द मोलेक्युलर मेकानिज्म अन्तर्निहित विविध क्यापिटुलम प्रकारहरू', बागवानी अनुसन्धान, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022।
Zhang, Yujie et al। (२०२३) 'सिनेर्जिस्टिक आरओएस अगमेन्ट र अटोफेजी ब्लकेज मार्फत कोलोरेक्टल क्यान्सरमा सोनोडायनामिक थेरापी बढाउनका लागि क्यास्केड न्यानोरेक्टर', नानो टुडे, ४९, पृ। 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798।
