डे नोवो ब्याक्टेरियल जीनोम असेंबली
हामी 0 अंतराल ग्यारेन्टी गर्दै, पूर्ण ब्याक्टेरियल जीनोम असेंबली सेवा प्रदान गर्दछौं। यो लामो-पढ्ने क्रमबद्ध प्रविधिहरू एकीकृत गरेर सम्भव छ, जस्तै नानोपोर र PacBio असेम्ब्लीको लागि र छोटो-पढ्ने अनुक्रमलाई Illumina सँग एसेम्बली प्रमाणीकरण र ONT रिडहरूको त्रुटि सुधारको लागि। हाम्रो सेवाले विशेष अनुसन्धान लक्ष्यहरू पूरा गर्दै विधानसभा, कार्यात्मक एनोटेशन, र उन्नत जैव सूचनात्मक विश्लेषणबाट पूर्ण बायोइन्फर्मेटिक कार्यप्रवाह प्रदान गर्दछ। यो सेवाले विभिन्न आनुवंशिक र जीनोमिक अध्ययनहरूको लागि सटीक सन्दर्भ जीनोमहरूको विकासलाई सक्षम बनाउँछ। थप रूपमा, यसले स्ट्रेन अप्टिमाइजेसन, आनुवंशिक ईन्जिनियरिङ्, र माइक्रोबियल टेक्नोलोजी विकास जस्ता अनुप्रयोगहरूको लागि आधार बनाउँछ, वैज्ञानिक अन्तरदृष्टि र बायोटेक्नोलोजिकल नवाचारलाई अगाडि बढाउनको लागि विश्वसनीय र अन्तर-रहित जीनोमिक डेटा सुनिश्चित गर्दै।
सेवा सुविधाहरू
● जीनोम पूर्णताको वांछित डिग्रीको आधारमा छनौट गर्न दुई सम्भावित विकल्पहरू।
● ड्राफ्ट जिनोम विकल्प: Illumina NovaSeq PE150 सँग छोटो-पढ्ने अनुक्रम।
● ० ग्याप जीनोम पूरा गर्नुहोस्।
● जीनोम एसेम्बलीका लागि Nanopore PromethION 48 वा PacBio Revio मा लामो-पढ्ने अनुक्रम।
● Illumina NovaSeq मा जीनोम प्रमाणीकरण र त्रुटि सुधार (नानोपोर) वा मस्यौदा जीनोम उत्पन्न गर्नको लागि छोटो-पढ्ने अनुक्रम।
सेवा लाभहरू
●शून्य-ग्याप जीनोम ग्यारेन्टी: यो लामो पढ्ने अनुक्रम (Nanopore वा PacBio) संग Illumina अनुक्रम को एकीकरण को कारण हो।
●बायोइन्फर्मेटिक्स कार्यप्रवाह पूरा गर्नुहोस्:यसमा जीनोम असेंबली र बहु जीनोमिक तत्वहरूको भविष्यवाणी, कार्यात्मक जीन एनोटेसन, र जीनोम दृश्यहरू जस्तै सर्कस प्लट समावेश छ।
●व्यापक विशेषज्ञता: २०,००० भन्दा बढी माइक्रोबियल जीनोमहरू भेला भएकाले, BMKGENE ले एक दशकभन्दा बढीको अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछि समर्थन ल्याउँछ।
●पोस्ट-बिक्री समर्थन:हाम्रो प्रतिबद्धता 3-महिना पछि-बिक्री सेवा अवधि संग परियोजना समाप्ति बाहिर विस्तार छ। यस समयमा, हामी परिणामहरूसँग सम्बन्धित कुनै पनि प्रश्नहरू सम्बोधन गर्न परियोजना फलो-अप, समस्या निवारण सहायता, र प्रश्नोत्तर सत्रहरू प्रस्ताव गर्दछौं।
●बहु अनुक्रमिक रणनीतिहरू उपलब्ध छन्:विभिन्न अनुसन्धान लक्ष्य र जीनोम पूर्णता को आवश्यकताहरु को लागी।
सेवा विशिष्टताहरू
| सेवा | अनुक्रम रणनीति |
| ड्राफ्ट जीनोम | Illumina PE150 100x |
| ० ग्याप जीनोम | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (वैकल्पिक) |
नमूना आवश्यकताहरू:
| एकाग्रता (ng/µL) | कुल रकम (µg) | भोल्युम (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥२० | ≥१.२ | ≥२० | १.७-२.२ | ≥१.० |
| नानोपोर | ≥४० | ≥२ | ≥२० | १.७-२.२ | १.०-३.० |
| इल्युमिना | ≥१ | ≥०.०६ | ≥२० | - | - |
ब्याक्टेरिया: ≥3.5x1010 कक्षहरू
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रम
डाटा विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:
● क्रमबद्ध डेटा गुणस्तर नियन्त्रण
● जीनोम असेंबली
● जीनोम कम्पोनेन्ट विश्लेषण: सीडीएस र बहु जीनोमिक तत्वहरूको भविष्यवाणी
● बहु सामान्य डाटाबेसहरू (GO, KEGG, आदि) र उन्नत डाटाबेसहरू (CARD, VFDB, आदि) सँग कार्यात्मक एनोटेसन
● जीनोम भिजुअलाइजेशन
हामी सजिलै पहुँचयोग्य फास्टा ढाँचा र जीनोम एनोटेसन फाइल (gff) मा जीनोम प्रदान गर्दछौं।
जीन एनोटेशन - जानुहोस्
जीन एनोटेशन - CAZY कार्बोहाइड्रेट
जीनोम दृश्यावलोकन - सर्कस प्लट
प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत BMKGene को ब्याक्टेरियल जीनोम एसेम्बली सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरू अन्वेषण गर्नुहोस्।
Dai, W. et al। (2023) 'स्वस्थ मानव कोलोनबाट अल्सरेटिभ कोलाइटिसको उपचारका लागि सुरक्षित र उपन्यास प्रोबायोटिक ब्याक्टेरियमको रूपमा ब्याक्टेरोइड युनिफॉर्मिस F18-22 को खोज',आणविक विज्ञान को अन्तर्राष्ट्रिय जर्नल, 24(19), p। 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1।
काङ, क्यू एट अल। (२०२१) 'बहु औषधि प्रतिरोधी प्रोटियस मिराबिलिसले चीनमा वन्यजन्तुबाट ब्लाओक्सा-१ र ब्लाएनडीएम-१ बोक्ने आइसोलेट्स: बढ्दो जनस्वास्थ्य जोखिम',एकीकृत प्राणीशास्त्र, 16(6), pp. 798-809। doi: 10.1111/1749-4877.12510।
वाङ, टीटी एट अल। (2017) 'एन्डोफाइट ब्यासिलस फ्लेक्सस KLBMP 4941 को पूर्ण जीनोम अनुक्रमले यसको बिरुवा वृद्धि प्रवर्द्धन संयन्त्र र नुन सहनशीलताको लागि आनुवंशिक आधार प्रकट गर्दछ',बायोटेक्नोलोजी को जर्नल, 260, पृ। 38-41। doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001।
वाङ, एक्स एट अल। (2021) 'क्लेब्सिएलाको बहु-प्रतिकृति प्रतिरोधी प्लाज्मिडहरू एन्टिमाइक्रोबियल जीन्सको व्यापक प्रसार मध्यस्थता',माइक्रोबायोलोजी मा फ्रंटियर्स, १२, पृ। 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX।
