एम्प्लिकन अनुक्रमण (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) Illumina सँग अनुक्रमण भनेको माइक्रोबियल प्रोफाइलहरूलाई तिनीहरूको अनुक्रम अनुसार पहिचान गरेर र त्यसपछि प्रत्येक नमूना भित्र र नमूनाहरू बीचको सामुदायिक समृद्धि र विविधता बुझ्ने प्रयास गरेर माइक्रोबियल विविधताको विश्लेषण गर्ने विधि हो। BMKCloud Amplicon (NGS) पाइपलाइनले 16S, 18S, ITS र बहु कार्यात्मक जीनहरूको विश्लेषण गर्न अनुमति दिन्छ। यो रिड ट्रिमिङ, पेयर-एन्ड रिड एसेम्बली र गुणस्तर मूल्याङ्कनबाट सुरु हुन्छ, त्यसपछि छवटा फरक विश्लेषण खण्डहरूमा प्रयोग गरिने अपरेशनल ट्याक्सोनोमिक एकाइहरू (OTUs) उत्पन्न गर्न समान रिडहरूको क्लस्टरिङद्वारा। वर्गीकरण एनोटेशनले प्रत्येक नमूनाको सापेक्षिक प्रशस्तता र संरचनाको बारेमा जानकारी प्रदान गर्दछ, जबकि अल्फा र बीटा विविधताले क्रमशः नमूनाहरू भित्र र बीचमा माइक्रोबियल विविधतामा फोकस गर्दछ। समूहहरू बीचको भिन्नता विश्लेषणले OTUs फेला पार्छ जुन प्यारामेट्रिक र गैर-पैरामीट्रिक परीक्षणहरू प्रयोग गरेर फरक हुन्छ, जबकि सहसंबंध विश्लेषणले यी भिन्नताहरूलाई वातावरणीय कारकहरूसँग सम्बन्धित गर्दछ। अन्तमा, कार्यात्मक जीन प्रचुरता मार्कर जीन प्रचुरताको आधारमा भविष्यवाणी गरिन्छ, प्रत्येक नमूनामा कार्य र पारिस्थितिकीमा अन्तरदृष्टि प्रदान गर्दछ।
