Exclusive Agency for Korea

उत्पादनहरू

16S/18S/ITS एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङ-PacBio

16S/18S/ITS Amplicon अनुक्रमण-PacBio विशेष छवि

16S र 18S rRNA जीनहरू, इन्टरनल ट्रान्सक्राइब्ड स्पेसर (ITS) क्षेत्रको साथमा, उच्च संरक्षित र हाइपर-भेरिएबल क्षेत्रहरूको संयोजनको कारणले निर्णायक आणविक फिंगरप्रिन्टिङ मार्करहरूको रूपमा सेवा गर्दछ, तिनीहरूलाई प्रोकारियोटिक र युकेरियोटिक जीवहरूको विशेषताको लागि अमूल्य उपकरण बनाउँछ। यी क्षेत्रहरूको प्रवर्धन र अनुक्रमणले विभिन्न इकोसिस्टमहरूमा माइक्रोबियल संरचना र विविधताको अनुसन्धानको लागि अलगाव-मुक्त दृष्टिकोण प्रदान गर्दछ। जबकि Illumina अनुक्रमणिले सामान्यतया छोटो हाइपरभेरिएबल क्षेत्रहरू जस्तै 16S र ITS1 को V3-V4 लाई लक्षित गर्दछ, यो प्रदर्शन गरिएको छ कि उत्कृष्ट वर्गीकरण एनोटेसन 16S, 18S, र ITS को पूर्ण लम्बाइ अनुक्रम गरेर प्राप्त गर्न सकिन्छ। यो व्यापक दृष्टिकोणले सही वर्गीकृत अनुक्रमहरूको उच्च प्रतिशतमा परिणाम दिन्छ, प्रजाति पहिचानमा विस्तारित संकल्पको स्तर प्राप्त गर्दछ। PacBio को सिंगल-मोलिक्युल रियल-टाइम (SMRT) सिक्वेन्सिङ प्लेटफर्म इलुमिना सिक्वेन्सिङको परिशुद्धतालाई प्रतिद्वन्द्वी गर्दै पूर्ण-लम्बाइ एम्प्लिकनहरू कभर गर्ने उच्च सटीक लामो पढाइ (HiFi) प्रदान गरेर बाहिर खडा छ। यो क्षमताले अन्वेषकहरूलाई बेजोड फाइदा प्राप्त गर्न अनुमति दिन्छ - आनुवंशिक परिदृश्यको मनोरम दृश्य। विस्तारित कभरेजले प्रजाति एनोटेसनमा विशेष गरी ब्याक्टेरिया वा फंगल समुदायहरू भित्र, माइक्रोबियल जनसंख्याको जटिलताहरूको गहिरो बुझाइलाई सक्षम पार्छ।

हामीलाई सम्पर्क गर्नुहोस्

सेवा विवरण

बायोइन्फर्मेटिक्स

डेमो परिणामहरू

विशेष प्रकाशनहरू

सेवा सुविधाहरू

● सिक्वेन्सिङ प्लेटफर्म: PacBio Revio

● अनुक्रमण मोड: CCS (HiFi पढ्ने)

● HiFi SMRT घण्टी पुस्तकालयको तयारी अघि एम्प्लिकनहरूको ट्यान्डम लिङ्किङद्वारा लक्षित क्षेत्रको प्रवर्धन

सेवा लाभहरू

●उच्च वर्गीकरण संकल्प: टीहान छोटो एम्पलिकन अनुक्रम,प्रजाति स्तरमा उच्च OTU वर्गीकरण दरहरू सक्षम गर्दै।

●उच्च सटीक आधार कलिंग: PacBio CCS मोड अनुक्रमण (HiFi पढ्ने)।

●अलगाव-मुक्त: वातावरणीय नमूनाहरूमा माइक्रोबियल संरचनाको द्रुत पहिचान।

●व्यापक रूपमा लागू: विविध माइक्रोबियल समुदाय अध्ययन।

●व्यापक जैव सूचनात्मक विश्लेषण: नवीनतम QIIME2 प्याकेज (माइक्रोबियल इकोलोजीमा मात्रात्मक अन्तरदृष्टि) डाटाबेस, एनोटेसन, OTU/ASV को सन्दर्भमा विविध विश्लेषणहरू सहित।

●व्यापक विशेषज्ञता: वार्षिक रूपमा सञ्चालन हुने हजारौं एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङ परियोजनाहरूसँग, BMKGENE ले एक दशकभन्दा बढीको अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछि समर्थन ल्याउँछ।

सेवा विशिष्टताहरू

पुस्तकालय	अनुक्रम रणनीति	Data सिफारिस गर्नुभयो
एम्प्लिकन	PacBio Revio	10/30/50 K ट्यागहरू (CCS)

नमूना आवश्यकताहरू

एकाग्रता (ng/µL)	कुल रकम (µg)	भोल्युम (µL)
≥५	≥०.३	≥२०

सिफारिस गरिएको नमूना वितरण

नमूनाहरूलाई तरल नाइट्रोजनमा 3-4 घण्टाको लागि फ्रिज गर्नुहोस् र तरल नाइट्रोजन वा -80 डिग्री लामो अवधिको आरक्षणमा भण्डार गर्नुहोस्। ड्राई-बरफको साथ नमूना ढुवानी आवश्यक छ।

सेवा कार्य प्रवाह

नमूना वितरण

पुस्तकालय निर्माण

अनुक्रम

डाटा विश्लेषण

बिक्री पछि सेवाहरू

अघिल्लो: 16S/18S/ITS एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङ-एनजीएस

अर्को: उच्च थ्रुपुट अनुक्रम (ATAC-seq) को साथ ट्रान्सपोसेस-पहुँचयोग्य क्रोमाटिनको लागि परख

निम्न विश्लेषण समावेश:

● कच्चा डाटा गुणस्तर नियन्त्रण

●OTU क्लस्टरिङ/डि-आवाज (ASV)

●OTU एनोटेसन

● अल्फा विविधता विश्लेषण: शेनन, सिम्पसन र ACE सहित धेरै अनुक्रमणिकाहरू।

● बिटा विविधता विश्लेषण

● अन्तर-समूह विश्लेषण

● सहसंबंध विश्लेषण: वातावरणीय कारकहरू र OUT संरचना र विविधता बीच

●16S कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी

वर्गीकरण वितरणको हिस्टोग्राम

सामुदायिक वितरण फाइलोजेनेटिक रूख

अल्फा विविधता विश्लेषण: ACE

अनुक्रमणिका

बीटा विविधता विश्लेषण: PCoA

अन्तरसमूह विश्लेषण: ANOVA

प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत PacBio सँग BMKGene को एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङ सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरू अन्वेषण गर्नुहोस्।

गाओ, एक्स र वाङ, एच. (२०२३) 'अल्पाइन मेरिनो भेडामा दुई बढ्दो चरणहरूमा अल्पाइन मेरिनो भेडामा भिन्न फिनोलोजी (रेग्रीन बनाम घाँसे) अनुकूलनको क्रममा रुमेन ब्याक्टेरियल प्रोफाइल र कार्यहरूको तुलनात्मक विश्लेषण', किण्वन, 9( १), पृ। 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1।

ली, एस एट अल। (2023) 'कल्चरोमिक्स-आधारित मेटाजेनोमिक्स र उच्च-रिजोल्युसन विश्लेषण प्रयोग गरेर मरुभूमिको माटोमा माइक्रोबियल डार्क मेटर क्याप्चरिङ', एनपीजे बायोफिल्म्स र माइक्रोबायोम्स 2023 9:1, 9(1), pp. 1-14। doi: 10.1038/s41522-023-00439-8।

Mu, L. et al। (2022) 'फ्याटी एसिड लवणको किण्वन विशेषताहरूमा प्रभाव, ब्याक्टेरियल विविधता र अल्फाल्फा, चामलको पराल र गहुँको चोकरसँग तयार गरिएको मिश्रित साइलेजको एरोबिक स्थिरता', खाद्य र कृषिको विज्ञानको जर्नल, 102(4), pp. 1475- १४८७। doi: 10.1002/JSFA.11482।

याङ, जे एट अल। (2023) 'Sonchus brachyotus DC बाट निकाल्ने एन्टिअक्सिडेन्ट प्रभावहरूमा अक्सिडेटिभ तनाव बायोमार्करहरू र पेट माइक्रोबायोटा बीचको अन्तरक्रिया। वयस्क Zebrafish मा Oxazolone-प्रेरित आंत्र अक्सिडेटिव तनाव मा', एन्टिअक्सिडेन्ट 2023, खण्ड। १२, पृष्ठ १९२, १२(१), पृ। 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192।