16S/18S/ITS एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङ-एनजीएस
सेवा सुविधाहरू
● क्रमबद्ध प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq।
● 16S, 18S र ITS को छोटो क्षेत्रहरूको प्रवर्धन, अन्य प्रवर्धन लक्ष्यहरू बीच।
● एम्प्लिकनको लचिलो छनोटहरू।
● धेरै प्रवर्द्धन लक्ष्यहरूको साथ अघिल्लो परियोजना अनुभव।
सेवा लाभहरू
●अलगाव-मुक्त:वातावरणीय नमूनाहरूमा माइक्रोबियल संरचनाको द्रुत पहिचान।
●उच्च संकल्प: वातावरणीय नमूनाहरूमा कम प्रचुर मात्रामा घटकहरूमा।
●व्यापक रूपमा लागू: विविध माइक्रोबियल समुदाय अध्ययन।
●व्यापक जैव सूचनात्मक विश्लेषण: नवीनतम QIIME2 प्याकेज (माइक्रोबियल इकोलोजीमा मात्रात्मक अन्तरदृष्टि) डाटाबेस, एनोटेसन, OTU/ASV को सन्दर्भमा विविध विश्लेषणहरू सहित।
●व्यापक विशेषज्ञता: वार्षिक रूपमा सञ्चालन हुने 150 हजार एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङ परियोजनाहरूसँग, BMKGENE ले एक दशकभन्दा बढीको अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछि समर्थन ल्याउँछ।
सेवा विशिष्टताहरू
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | Data सिफारिस गर्नुभयो |
| एम्प्लिकन | Illumina PE250 | 50/100/300K ट्यागहरू (जोडाहरू पढ्नुहोस्) |
सेवा आवश्यकताहरू
| एकाग्रता (ng/µL) | कुल रकम (एनजी) | भोल्युम (µL) |
| ≥१ | ≥२०० | ≥२० |
● माटो/चिलो: १-२ ग्राम
● आन्द्राको सामग्री-जनावर: ०.५-२ ग्राम
● आन्द्राको सामग्री-कीरा: ०.१-०.२५ ग्राम
● बिरुवाको सतह (समृद्ध तलछट): ०.१-०.५ ग्राम
● किण्वन ब्रोथ समृद्ध तलछट): ०.१-०.५ ग्राम
● मल (ठूला जनावरहरू): ०.५-२ ग्राम
● मल (मुसा): ३-५ दाना
● पल्मोनरी एल्भियोलर लभेज फ्लुइड: फिल्टर पेपर
● योनि स्वाब: 5-6 स्वाब
● छाला/जननांग स्वाब/लाल/मौखिक नरम तन्तु/फ्यारेन्जियल स्वाब/रेक्टल स्वाब: २-३ स्वाब
● सतह सूक्ष्मजीवहरू: फिल्टर पेपर
● वाटरबडी/एयर/बायोफिल्म: फिल्टर पेपर
● इन्डोफाइट: १-२ ग्राम
● डेन्टल प्लाक: ०.५-१ ग्राम
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रम
डाटा विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
निम्न विश्लेषण समावेश:
- कच्चा डाटा गुणस्तर नियन्त्रण
- OTU क्लस्टरिङ / De-noise (ASV)
- OTU एनोटेशन
- अल्फा विविधता विश्लेषण: शेनन, सिम्पसन र ACE सहित धेरै अनुक्रमणिकाहरू।
- बीटा विविधता विश्लेषण
- अन्तर-समूह विश्लेषण
- सहसंबंध विश्लेषण: वातावरणीय कारकहरू र आउट संरचना र विविधता बीच
- 16S कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी
वर्गीकरण वितरणको हिस्टोग्राम
वर्गीकरण प्रचुरता क्लस्टरिंग गर्मी नक्शा
अल्फा विविधता विश्लेषण: दुर्लभ वक्र
बीटा विविधता विश्लेषण: NMDS
अन्तरसमूह विश्लेषण: LEFSE बायोमार्कर खोज
प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत Illumina सँग BMKGene को एम्प्लिकन अनुक्रमण सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरू अन्वेषण गर्नुहोस्।
डोङ, सी. एट अल। (२०२२) 'एसेम्बली, कोर माइक्रोबायोटा, एन्ड फंक्शन अफ द राइजोस्फियर सोइल एण्ड बार्क माइक्रोबायोटा इन युकोमिया उल्मोइड्स', फ्रन्टियर्स इन माइक्रोबायोलोजी, १३. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317.
ली, वाई आदि। (2023) 'सिंथेटिक ब्याक्टेरियल कन्सोर्टिया प्रत्यारोपण फर द ट्रीटमेन्ट अफ गार्डनेरेला योनिलिस-इन्ड्युस्ड ब्याक्टेरियल भेगिनोसिस इन माइस', माइक्रोबायोम, 11(1), pp. 1-14। doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. र Liu, H. (2022) 'जमिनमा आधारित बन्द बायोरेजेनेरेटिभ लाइफ सपोर्ट प्रयोग "लुनर प्यालेस 365" को समयमा एकत्रित हावाको धुलोको माइक्रोबायोम्स, पर्यावरणीय माइक्रोबायोम्स, 17(1), pp। 1-20। doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
यिन, एस एट अल। (2022) 'नाइट्रोजन रूपान्तरणसँग सम्बन्धित कार्यात्मक जीनहरूको फिडस्टक-निर्भर प्रचुरता कम्पोस्टिङमा नाइट्रोजनको क्षति नियन्त्रण', बायोरिसोर्स टेक्नोलोजी, 361, पृ। 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678।
