10x जेनोमिक्स भिजियम स्पेसियल ट्रान्सक्रिप्टोम
प्राविधिक योजना
सुविधाहरू
● संकल्प: 100 μM
● स्पट व्यास: 55 µM
● ठाउँहरूको संख्या: 4992
● कब्जा क्षेत्र: 6.5 x 6.5 मिमी
● प्रत्येक बारकोड गरिएको स्थान 4 खण्डहरू मिलेर बनेको प्राइमरहरूले भरिएको हुन्छ:
- mRNA प्राइमिङ र cDNA संश्लेषणको लागि पाली(dT) टेल
- प्रवर्धन पूर्वाग्रह सुधार गर्न अद्वितीय आणविक पहिचानकर्ता (UMI)
- स्थानिय बारकोड
- आंशिक पढिएको 1 अनुक्रम प्राइमरको बाइन्डिङ अनुक्रम
● H&E खण्डहरूको दाग
फाइदाहरू
●एक-स्टप सेवा: क्रायो-सेक्शनिङ, स्टेनिङ, टिस्यु अप्टिमाइजेसन, स्पेसियल बारकोडिङ, लाइब्रेरी तयारी, सिक्वेन्सिङ र बायोइन्फर्मेटिक्स सहित सबै अनुभव र सीप-आधारित चरणहरू एकीकृत गर्दछ।
● उच्च-दक्ष प्राविधिक टोली: मानव, मुसा, स्तनपायी, माछा र बिरुवाहरू सहित 250 भन्दा बढी टिश्यू प्रकारहरू र 100+ प्रजातिहरूमा अनुभवको साथ।
●सम्पूर्ण परियोजनामा वास्तविक-समय अद्यावधिक: प्रयोगात्मक प्रगतिको पूर्ण नियन्त्रणको साथ।
●व्यापक मानक जैव सूचना विज्ञान:प्याकेजले 29 विश्लेषणहरू र 100+ उच्च-गुणस्तरका आंकडाहरू समावेश गर्दछ।
●अनुकूलित डाटा विश्लेषण र दृश्य: विभिन्न अनुसन्धान अनुरोधहरूको लागि उपलब्ध।
●एकल-सेल mRNA अनुक्रमको साथ वैकल्पिक संयुक्त विश्लेषण
निर्दिष्टीकरणहरू
| नमूना आवश्यकताहरू | पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | Data सिफारिस गर्नुभयो | गुणस्तर नियन्त्रण |
| OCT- एम्बेडेड क्रायो नमूनाहरू (इष्टतम व्यास: लगभग 6x6x6 मिमी³) प्रति नमूना २ ब्लकहरू | 10X Visium cDNA पुस्तकालय | Illumina PE150 | 50K PE प्रति स्थान पढ्छ (६० जीबी) | RIN > 7 |
नमूना तयारी मार्गदर्शन र सेवा कार्यप्रवाहको बारेमा थप विवरणहरूको लागि, कृपया एकसँग कुरा गर्न नहिचकिचाउनुहोस्BMKGENE विशेषज्ञ
सेवा कार्यप्रवाह
नमूना तयारी चरणमा, उच्च गुणस्तरको आरएनए प्राप्त गर्न सकिने सुनिश्चित गर्न प्रारम्भिक बल्क आरएनए निकासी परीक्षण गरिन्छ। टिस्यु अप्टिमाइजेसन चरणमा खण्डहरू दाग र दृश्यात्मक हुन्छन् र टिश्यूबाट एमआरएनए रिलिजको लागि पारगम्यीकरण अवस्थाहरू अनुकूलित हुन्छन्। अनुकूलित प्रोटोकल त्यसपछि पुस्तकालय निर्माण समयमा लागू हुन्छ, अनुक्रम र डेटा विश्लेषण पछि।
पूर्ण सेवा कार्यप्रवाहमा वास्तविक-समय अद्यावधिकहरू र क्लाइन्ट पुष्टिकरणहरू समावेश छन् उत्तरदायी प्रतिक्रिया लूप कायम राख्न, सहज परियोजना कार्यान्वयन सुनिश्चित गर्दै।
निम्न विश्लेषण समावेश:
डाटा गुणस्तर नियन्त्रण:
o डाटा आउटपुट र गुणस्तर स्कोर वितरण
o प्रति स्थान जीन पत्ता लगाउने
o टिश्यु कभरेज
भित्री-नमूना विश्लेषण:
o जीन समृद्धि
o स्पट क्लस्टरिङ, घटाइएको आयाम विश्लेषण सहित
o क्लस्टरहरू बीचको भिन्न अभिव्यक्ति विश्लेषण: मार्कर जीनहरूको पहिचान
o कार्यात्मक एनोटेशन र मार्कर जीनको संवर्धन
अन्तर-समूह विश्लेषण
o दुबै नमूनाहरू (जस्तै रोगग्रस्त र नियन्त्रण) र पुन: क्लस्टरबाट स्पटहरूको पुन: संयोजन
o प्रत्येक क्लस्टरको लागि मार्कर जीनहरूको पहिचान
o कार्यात्मक एनोटेशन र मार्कर जीनको संवर्धन
o समूहहरू बीच एउटै क्लस्टरको भिन्न अभिव्यक्ति
भित्री-नमूना विश्लेषण
स्पट क्लस्टरिङ
मार्कर जीन पहिचान र स्थानिय वितरण
अन्तर-समूह विश्लेषण
दुबै समूह र पुन: क्लस्टरबाट डेटा संयोजन
नयाँ क्लस्टरहरूको मार्कर जीन
यी विशेष प्रकाशनहरूमा 10X Visium द्वारा BMKGene को स्पेसियल ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स सेवाद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरू अन्वेषण गर्नुहोस्:
चेन, D. et al। (2023) 'mthl1, स्तनधारी आसंजन GPCRs को एक सम्भावित ड्रोसोफिला होमोलोग, फ्लाईहरूमा इन्जेक्टेड ओन्कोजेनिक कोशिकाहरूमा एन्टिट्यूमर प्रतिक्रियाहरूमा संलग्न छ',संयुक्त राज्य अमेरिका को विज्ञान को राष्ट्रीय एकेडेमी को कार्यवाही, 120(30), p। e2303462120। doi: /10.1073/pnas.2303462120
चेन, वाई एट अल। (2023) 'STEEL ले स्प्याटियोटेम्पोरल ट्रान्सक्रिप्टोमिक डेटाको उच्च-रिजोल्युसन रेखाचित्र सक्षम गर्दछ',जैव सूचना विज्ञान मा ब्रीफिंग, 24(2), pp. 1-10। doi: 10.1093/BIB/BBAD068।
लिउ, सी. एट अल। (2022) 'अर्किड फूलहरूको विकासमा अर्गानोजेनेसिसको स्पेसियोटेम्पोरल एटलस',न्यूक्लिक एसिड अनुसन्धान, ५०(१७), पृष्ठ ९७२४–९७३७। doi: 10.1093/NAR/GKAC773।
वाङ, जे एट अल। (2023) 'स्थानीय ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स र एकल-न्युक्लियस आरएनए अनुक्रमणले गर्भाशय लेयोमायोमाका लागि सम्भावित चिकित्सकीय रणनीतिहरू प्रकट गर्दछ',जैविक विज्ञान को अन्तर्राष्ट्रिय जर्नल, १९(८), पृ. २५१५–२५३०। doi: 10.7150/IJBS.83510।
