-
DNBSEQ ကြိုတင်ပြုလုပ်ထားသော စာကြည့်တိုက်များ
MGI မှတီထွင်ထုတ်လုပ်သော DNBSEQ သည် sequencing ကုန်ကျစရိတ်များကိုပိုမိုလျှော့ချရန်နှင့်ဖြတ်သန်းနိုင်မှုကိုတိုးမြှင့်ရန်အတွက်တီထွင်ဆန်းသစ်သော NGS နည်းပညာတစ်ခုဖြစ်သည်။ DNBSEQ စာကြည့်တိုက်များ ပြင်ဆင်ခြင်းတွင် DNA နာနိုဘောများ (DNB) ရရှိရန် စက်ဝိုင်းပုံစံ ကွဲထွက်ခြင်း၊ ssDNA ပြင်ဆင်ခြင်းနှင့် စက်ဝိုင်းချဲ့ခြင်းတို့ ပါဝင်ပါသည်။ ထို့နောက် ၎င်းတို့ကို အစိုင်အခဲမျက်နှာပြင်ပေါ်သို့ တင်ဆောင်ကာ ပေါင်းစပ်မှုဆိုင်ရာ Probe-Anchor Synthesis (cPAS) ဖြင့် နောက်ဆက်တွဲလုပ်ဆောင်သည်။ DNBSEQ နည်းပညာသည် မြင့်မားသောသိပ်သည်းဆ အမှားအယွင်းပုံစံများကို nanoballs များဖြင့် အသုံးပြုခြင်းနှင့် ချဲ့ထွင်မှုနည်းသော အမှားအယွင်းနှုန်းရှိခြင်း၏ အားသာချက်များကို ပေါင်းစပ်ပြီး ပိုမိုမြင့်မားသော ဖြတ်သန်းမှုနှင့် တိကျမှုတို့ဖြင့် စီစီခြင်းကို ဖြစ်ပေါ်စေသည်။
ကျွန်ုပ်တို့၏ကြိုတင်လုပ်ထားသော စာကြည့်တိုက်များကို စီစစ်ခြင်းဝန်ဆောင်မှုသည် သုံးစွဲသူများအား မတူကွဲပြားသောအရင်းအမြစ်များ (mRNA၊ ဂျီနိုမ်တစ်ခုလုံး၊ amplicon၊ 10x စာကြည့်တိုက်များအပါအဝင်) မှ သုံးစွဲသူများအား DNBSEQ-T7 တွင် စီစစ်ထားသော ဓာတ်ခွဲခန်းများရှိ MGI စာကြည့်တိုက်များအဖြစ်သို့ ပြောင်းလဲသွားသော၊ မြင့်မားသောဒေတာပမာဏသည် ကုန်ကျစရိတ်သက်သာသည်။
-
Illumina ကြိုတင်လုပ်ထားသောစာကြည့်တိုက်များ
Illumina sequencing နည်းပညာသည် Sequencing by Synthesis (SBS) ကိုအခြေခံ၍ ကမ္ဘာတစ်ဝှမ်းလုံးလက်ခံထားသော NGS ဆန်းသစ်တီထွင်မှုဖြစ်ပြီး၊ ကမ္ဘာ့ sequencing data ၏ 90% ကျော်ကိုထုတ်ပေးရန်တာဝန်ရှိသည်။ SBS ၏ နိယာမတွင် dNTP တစ်ခုစီကို ပေါင်းထည့်ထားသောကြောင့် နောက်ပြန်အုတ်မြစ်ကို ပေါင်းစပ်ထည့်သွင်းထားသောကြောင့် အလင်းတန်းဖြင့် ပြောင်းပြန်လှန်နိုင်သော terminator များကို ဓါတ်ပုံရိုက်ခြင်းတွင် ပါဝင်ပြီး နောက်အခြေခံတစ်ခု၏ပေါင်းစပ်မှုကို ခွင့်ပြုရန် နောက်ပိုင်းတွင် ပိုင်းခြားထားသည်။ နောက်ပြန်လှည့်နိုင်သော terminator-bound dNTP လေးခုလုံးသည် ဆက်တိုက်လည်ပတ်မှုတစ်ခုစီတွင် ရှိနေသဖြင့်၊ သဘာဝပြိုင်ဆိုင်မှုသည် ပေါင်းစည်းခြင်းဆိုင်ရာ ဘက်လိုက်မှုကို လျော့နည်းစေသည်။ ဤစွယ်စုံရနည်းပညာသည် တစ်ခုတည်း-ဖတ်ပြီး တွဲစပ်ပြီးသည့် စာကြည့်တိုက်များကို ပံ့ပိုးပေးကာ မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ အပလီကေးရှင်းများစွာကို ပံ့ပိုးပေးသည်။ Illumina sequencing ၏ high-throughput စွမ်းရည်များနှင့် တိကျမှုတို့က ၎င်းအား မျိုးရိုးဗီဇသုတေသနတွင် အုတ်မြစ်တစ်ခုအဖြစ် သတ်မှတ်ပေးကာ သိပ္ပံပညာရှင်များအား ဂျီနိုမ်များ၏ ရှုပ်ထွေးနက်နဲမှုများကို လိုက်လျောညီထွေမရှိသော အသေးစိတ်နှင့် ထိရောက်မှုတို့ဖြင့် ဖော်ထုတ်နိုင်စေရန် စွမ်းဆောင်ပေးပါသည်။
ကျွန်ုပ်တို့၏ကြိုတင်ပြုလုပ်ထားသော စာကြည့်တိုက်ကို စီစစ်ခြင်းဝန်ဆောင်မှုသည် သုံးစွဲသူများအား မတူကွဲပြားသောရင်းမြစ်များ (mRNA၊ ဂျီနိုမီ၊ အမ်ပလီကွန်၊ 10x စာကြည့်တိုက်များ၊ အခြားအရာများ) မှ အတွဲလိုက်စာကြည့်တိုက်များကို ပြင်ဆင်နိုင်စေပါသည်။ နောက်ပိုင်းတွင်၊ ဤစာကြည့်တိုက်များကို Illumina ပလပ်ဖောင်းများတွင် အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုနှင့် စီတန်းခြင်းအတွက် ကျွန်ုပ်တို့၏ sequencing စင်တာများသို့ ပေးပို့နိုင်ပါသည်။