ကုန်ပစ္စည်းထုတ်လုပ်သူများနှင့် ပေးသွင်းသူများ - တရုတ်ထုတ်ကုန်စက်ရုံ

ကိရိယာအစုံ

BMKCloud သည် ဆေး၊ စိုက်ပျိုးရေး၊ သဘာဝပတ်ဝန်းကျင်စသည်ဖြင့် နယ်ပယ်အသီးသီးရှိ သုတေသီများက ကျယ်ပြန့်စွာ ယုံကြည်လက်ခံထားသည့် မျိုးဗီဇဆိုင်ရာ ပရိုဂရမ်များအတွက် တစ်ခုတည်းသော ရပ်တန့်ဖြေရှင်းချက်ပေးသည့် ထိပ်တန်း bioinformatic platform တစ်ခုဖြစ်သည်။ BMKCloud သည် bioinformatic analysis platforms နှင့် tools များအပါအဝင် ပေါင်းစည်းထားသော၊ ယုံကြည်စိတ်ချရပြီး ထိရောက်သော ဝန်ဆောင်မှုများကို ပံ့ပိုးပေးရန် ကတိပြုပါသည်။ ၊ ကွန်ပျူတာအရင်းအမြစ်များ၊ အများသူငှာဒေတာဘေ့စ်များ၊ ဇီဝနည်းပညာဆိုင်ရာအွန်လိုင်းသင်တန်းများ စသည်တို့ဖြစ်သည်။ BMKCloud တွင် မျိုးရိုးဗီဇဖော်ပြချက်များ၊ ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်များအပါအဝင် မကြာခဏအသုံးပြုလေ့ရှိသော bioinformatic tools များရှိသည်။ မျိုးရိုးဗီဇကိရိယာများ၊ ncRNA၊ ဒေတာအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု၊ စုဝေးမှု၊ ချိန်ညှိမှု၊ ဒေတာထုတ်ယူမှု၊ ပြောင်းလဲမှုများ၊ စာရင်းဇယားများ၊ ကိန်းဂဏန်းဂျင်နရေတာ၊

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
De novo ဘက်တီးရီးယားမျိုးရိုးဗီဇညီလာခံ

ကျွန်ုပ်တို့သည် ဘက်တီးရီးယား ဂျီနိုမ် တပ်ဆင်ခြင်း ၀န်ဆောင်မှုကို အပြည့်အ၀ အာမခံချက်ပေးပါသည်။ စုစည်းမှုနှင့် ONT ၏အမှားပြင်ဆင်မှုတို့အတွက် Nanopore နှင့် PacBio ကဲ့သို့သော long-read sequencing နည်းပညာများကို ပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့် Illumina နှင့် short-read sequencing ပြုလုပ်ခြင်းဖြင့် ဖြစ်နိုင်သည်။ ကျွန်ုပ်တို့၏ဝန်ဆောင်မှုသည် အစုအဝေး၊ လုပ်ဆောင်နိုင်သော မှတ်စာများနှင့် အဆင့်မြင့် bioinformatic ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုမှ ပြီးပြည့်စုံသော bioinformatic workflow ကို ထောက်ပံ့ပေးပြီး တိကျသောသုတေသနပန်းတိုင်များကို ဖြည့်ဆည်းပေးပါသည်။ ဤဝန်ဆောင်မှုသည် မျိုးရိုးဗီဇနှင့် မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာလေ့လာမှုအမျိုးမျိုးအတွက် တိကျသောရည်ညွှန်းဂျီနိုမ်များကို ဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်စေပါသည်။ ထို့အပြင်၊ ၎င်းသည် သိပ္ပံနည်းကျ ထိုးထွင်းသိမြင်မှုနှင့် ဇီဝနည်းပညာဆန်းသစ်တီထွင်မှုအတွက် ယုံကြည်စိတ်ချရပြီး ကွာဟမှုမရှိသော မျိုးရိုးဗီဇဒေတာကို သေချာစေမည့် strain optimization၊ မျိုးရိုးဗီဇအင်ဂျင်နီယာနှင့် အဏုဇီဝနည်းပညာများ ဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်မှုကဲ့သို့သော အသုံးချပရိုဂရမ်များအတွက် အခြေခံဖြစ်လာပါသည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
RNA အသေး

သေးငယ်သော RNA များသည် miRNA၊ siRNA နှင့် piRNA အပါအဝင် ပျမ်းမျှအရှည် 18-30 nt ရှိသော အတိုကောက်မဟုတ်သော RNA အမျိုးအစားဖြစ်သည်။ ဤသေးငယ်သော RNA များသည် mRNA ပျက်စီးခြင်း၊ ဘာသာပြန်ခြင်းကို ဟန့်တားခြင်း၊ heterochromatin ဖွဲ့စည်းခြင်းစသည်ဖြင့် အမျိုးမျိုးသော ဇီဝဖြစ်စဉ်များတွင် အများအပြားပါဝင်ကြောင်း အစီရင်ခံထားပါသည်။ SmallRNA sequencing analysis ကို တိရစ္ဆာန်/အပင်ဖွံ့ဖြိုးမှု၊ ရောဂါ၊ ဗိုင်းရပ်စ်စသည်ဖြင့် လေ့လာမှုများတွင် ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် အသုံးချခဲ့သည်။ RNA အသေးများ၊ sequencing analysis platform တွင် စံခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းနှင့် အဆင့်မြင့်ဒေတာတူးဖော်ခြင်း ပါဝင်သည်။ RNA-seq ဒေတာကို အခြေခံ၍ စံခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုသည် miRNA ခွဲခြားသတ်မှတ်ခြင်းနှင့် ခန့်မှန်းခြင်း၊ miRNA ပစ်မှတ်မျိုးရိုးဗီဇခန့်မှန်းခြင်း၊ မှတ်ချက်ပေးခြင်းနှင့် စကားအသုံးအနှုန်းခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းတို့ကို ရရှိနိုင်သည်။ အဆင့်မြင့်ပိုင်းခြားစိတ်ဖြာချက်သည် စိတ်ကြိုက် miRNA ရှာဖွေခြင်းနှင့် ထုတ်ယူခြင်း၊ Venn ပုံကြမ်းထုတ်လုပ်ခြင်း၊ miRNA နှင့် ပစ်မှတ်မျိုးရိုးဗီဇကွန်ရက်တည်ဆောက်ခြင်းတို့ကို လုပ်ဆောင်ပေးပါသည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
NGS-WGS (Illumina/BGI)

NGS-WGS သည် Biomarker Technologies တွင် အတွေ့အကြုံကြွယ်ဝသော အတွေ့အကြုံများကို အခြေခံ၍ တီထွင်ထားသည့် ဂျီနိုမ်ပြန်လည် စီစစ်ခြင်းဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု ပလတ်ဖောင်းတစ်ခုလုံးဖြစ်သည်။ ဤအသုံးပြုရလွယ်ကူသောပလပ်ဖောင်းသည် Illumina ပလပ်ဖောင်းနှင့် BGI စီစစ်ခြင်းပလပ်ဖောင်းနှစ်ခုလုံးမှထုတ်ပေးသော DNA စီစစ်ခြင်းဒေတာအတွက် ကိုက်ညီသည့် အခြေခံဘောင်အနည်းငယ်ကို သတ်မှတ်ခြင်းဖြင့် ပေါင်းစပ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုလုပ်ငန်းအသွားအလာကို အမြန်တင်ပြနိုင်စေပါသည်။ ဤပလပ်ဖောင်းကို အချိန်အကန့်အသတ်အတွင်း အလွန်ထိရောက်သော ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုကို အားကောင်းစေသည့် စွမ်းဆောင်ရည်မြင့် ကွန်ပျူတာဆာဗာတွင် အသုံးပြုထားသည်။ မျိုးရိုးဗီဇမေးမြန်းမှု၊ PCR primer ဒီဇိုင်းစသည်ဖြင့် စံခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအပေါ် အခြေခံ၍ ပုဂ္ဂိုလ်ရေးသီးသန့် ဒေတာတူးဖော်ခြင်းကို ရနိုင်ပါသည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
mRNA(ကိုးကား)

Transcriptome သည် မျိုးရိုးဗီဇအချက်အလက်နှင့် ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာလုပ်ဆောင်မှု၏ proteome အကြားချိတ်ဆက်မှုဖြစ်သည်။ ကူးယူဖော်ပြမှုအဆင့် စည်းမျဉ်းသည် အရေးကြီးဆုံးနှင့် သက်ရှိများ၏ အကျယ်ပြန့်ဆုံး လေ့လာထားသော စည်းမျဉ်းပုံစံဖြစ်သည်။ စာသားမှတ်တမ်းများ စီစစ်ခြင်းသည် အချိန်အခါ သို့မဟုတ် အခြေအနေတစ်ရပ်ရပ်တွင် တိကျပြတ်သားသော တိကျပြတ်သားမှုတစ်ခုဖြင့် စာသားမှတ်တမ်းကို စီစဥ်နိုင်သည်။ ၎င်းသည် မျိုးရိုးဗီဇမှတ်တမ်း၏အဆင့်ကို ဒိုင်းနမစ်ရောင်ပြန်ဟပ်နိုင်ပြီး ရှားပါးပြီး ပုံမှန်စာသားမှတ်တမ်းများကို တစ်ပြိုင်နက်တည်း ခွဲခြားသတ်မှတ်ကာ ဖွဲ့စည်းတည်ဆောက်ပုံဆိုင်ရာ အချက်အလက်များကို ပံ့ပိုးပေးသည်။ နမူနာ သီးသန့် မှတ်တမ်းများ။

လက်ရှိတွင်၊ တိရိစ္ဆာန်နှင့် အပင်ဖွံ့ဖြိုးမှုဆိုင်ရာ စည်းမျဉ်း၊ ပတ်ဝန်းကျင်လိုက်လျောညီထွေဖြစ်အောင်၊ ကိုယ်ခံအားဆိုင်ရာ အပြန်အလှန်တုံ့ပြန်မှု၊ မျိုးရိုးဗီဇဒေသသတ်မှတ်မှု၊ မျိုးရိုးဗီဇဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်နှင့် အကျိတ်နှင့် မျိုးရိုးဗီဇရောဂါရှာဖွေခြင်းအပါအဝင် အခြားသုတေသနနယ်ပယ်များတွင် မှတ်တမ်းတင်ခြင်းနည်းပညာကို ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့်အသုံးပြုခဲ့သည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
Metagenomics (NGS)

ဤခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုပလပ်ဖောင်းသည် အတွေ့အကြုံနှစ်ပေါင်းများစွာကို အခြေခံ၍ သေနတ်ပစ်ဂွန်၏ မက်ဂနို ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအတွက် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသည်။ ၎င်းတွင် ဒေတာလုပ်ဆောင်ခြင်း၊ မျိုးစိတ်အဆင့်လေ့လာမှုများ၊ ဗီဇလုပ်ဆောင်မှုအဆင့်လေ့လာမှုများ၊ metagenome binning စသည်တို့အပါအဝင် အများအားဖြင့် လိုအပ်သော metagenomics ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအမျိုးမျိုးပါဝင်သော ပေါင်းစပ်လုပ်ငန်းအသွားအလာတွင် ပါဝင်ပါသည်။ ထို့အပြင်၊ မျိုးရိုးဗီဇနှင့် မျိုးစိတ်မေးမြန်းမှုအပါအဝင် စံခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုဆိုင်ရာ လုပ်ငန်းစဉ်များတွင် စိတ်ကြိုက်ဒေတာတူးဖော်ခြင်းကိရိယာများကို ရရှိနိုင်ပါသည်။ ကန့်သတ်ချက် ဆက်တင်၊ စိတ်ကြိုက် ပုံထုတ်ပေးခြင်း စသည်

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
LncRNA

ရှည်လျားသော coding မဟုတ်သော RNAs (lncRNA) သည် ပရိုတင်းများကို ကုဒ်လုပ်၍မရသော အရှည် 200 nt ထက် ပိုရှည်သော စာသားမှတ်တမ်းများဖြစ်သည်။ စုဆောင်းအထောက်အထားများအရ lncRNAs အများစုသည် လုပ်ဆောင်နိုင်ဖွယ်ရှိကြောင်း သက်သေပြနေသည်။ မြင့်မားသောဆင့်ကဲဆင့်ကဲနည်းပညာများနှင့် ဇီဝနည်းပညာဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းကိရိယာများသည် lncRNA အတွဲလိုက်များနှင့် သတင်းအချက်အလက်များကို ပိုမိုထိရောက်စွာဖော်ထုတ်နိုင်စေရန်နှင့် အရေးကြီးသောစည်းမျဉ်းဆိုင်ရာလုပ်ဆောင်ချက်များဖြင့် lncRNA များကို ရှာဖွေတွေ့ရှိရန် ကျွန်ုပ်တို့အား ပို့ဆောင်ပေးပါသည်။ BMKCloud သည် ကျွန်ုပ်တို့၏ဖောက်သည်များအား lncRNA ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု ပလပ်ဖောင်းကို မြန်ဆန်စွာ၊ ယုံကြည်စိတ်ချရပြီး လိုက်လျောညီထွေရှိသော lncRNA ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုကို ရရှိရန်အတွက် ဂုဏ်ယူပါသည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
GWAS

မျိုးရိုးဗီဇကျယ်ပြန့်သောအသင်းအဖွဲ့လေ့လာမှု (GWAS) သည် တိကျသောလက္ခဏာများ (phenotype) နှင့်ဆက်စပ်နေသော မျိုးရိုးဗီဇမျိုးကွဲများ (genotype) ကို ဖော်ထုတ်ရန် ရည်ရွယ်သည်။ GWA လေ့လာမှုများသည် လူအများအပြား၏ ဂျီနိုမ်တစ်ခုလုံးကို ဖြတ်ကျော်ကာ မျိုးရိုးဗီဇအမှတ်အသားများကို စုံစမ်းပြီး လူဦးရေအဆင့်တွင် စာရင်းအင်းခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းဖြင့် genotype-phenotype ဆက်စပ်မှုများကို ခန့်မှန်းပေးသည်။ ဂျီနိုမ်တစ်ခုလုံးကို ပြန်ဆက်ခြင်းသည် မျိုးရိုးဗီဇမျိုးကွဲအားလုံးကို ရှာဖွေတွေ့ရှိနိုင်ချေရှိသည်။ phenotypic data နှင့် ပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့်၊ GWAS သည် ခေတ်မီတိရိစ္ဆာန်/အပင်များ မွေးမြူခြင်းကို ခိုင်ခိုင်မာမာ ကျောထောက်နောက်ခံပေးသည့် ဖီနိုအမျိုးအစား ဆက်စပ်သော SNPs၊ QTLs နှင့် ကိုယ်စားလှယ် genes များကို ခွဲခြားသတ်မှတ်ရန် လုပ်ဆောင်နိုင်သည်။ SLAF သည် ဂျီနိုမ်ကျယ်ပြန့်သော ဖြန့်ဝေမှုအမှတ်အသားများ၊ SNP ကို ရှာဖွေတွေ့ရှိသည့် ရိုးရှင်းသော ဂျီနိုမ် စီစစ်ခြင်းဗျူဟာတစ်ခုဖြစ်သည်။ ဤ SNPs များကို မော်လီကျူးမျိုးရိုးဗီဇ အမှတ်အသားများအဖြစ် ပစ်မှတ်ထားသော စရိုက်လက္ခဏာများနှင့် ဆက်စပ်လေ့လာမှုများအတွက် လုပ်ဆောင်နိုင်ပါသည်။ ၎င်းသည် မျိုးရိုးဗီဇ ကွဲပြားမှုများနှင့် ဆက်စပ်နေသော ရှုပ်ထွေးသော စရိုက်လက္ခဏာများကို ဖော်ထုတ်ရာတွင် စရိတ်သက်သာသော နည်းဗျူဟာတစ်ခုဖြစ်သည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
Nanopore အပြည့်အစုံ စာသားမှတ်တမ်း

သက်ရှိများတွင် ရှုပ်ထွေးပြီး ပြောင်းလဲနိုင်သော အခြား isoforms များသည် မျိုးဗီဇဖော်ပြမှုနှင့် ပရိုတင်းကွဲပြားမှုကို ထိန်းညှိရန်အတွက် အရေးကြီးသော မျိုးဗီဇယန္တရားများဖြစ်သည်။ စာသားမှတ်တမ်းဖွဲ့စည်းပုံများကို တိကျစွာဖော်ထုတ်ခြင်းသည် မျိုးရိုးဗီဇဖော်ပြခြင်းဆိုင်ရာ စည်းမျဉ်းပုံစံများကို အတွင်းကျကျလေ့လာမှုအတွက် အခြေခံဖြစ်သည်။ Nanopore sequencing platform သည် transcriptomic study ကို isoform-level သို့ အောင်မြင်စွာ ယူဆောင်လာခဲ့ပါသည်။ ဤခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုပလပ်ဖောင်းသည် ဗီဇအဆင့်နှင့် စာသားမှတ်တမ်းအဆင့်နှစ်ခုစလုံးတွင် အရည်အသွေးနှင့် အရေအတွက်ပိုင်းခြားစိတ်ဖြာမှုကို ရရှိသည့် ကိုးကားဂျီနိုမ်အခြေခံပေါ်အခြေခံ၍ Nanopore ပလပ်ဖောင်းပေါ်တွင် ထုတ်လုပ်သည့် RNA-Seq ဒေတာကို ပိုင်းခြားစိတ်ဖြာရန် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
circ-RNA

Circular RNA(circRNA) သည် မကြာသေးမီက တွေ့ရှိခဲ့သော ကုဒ်မဟုတ်သော RNA အမျိုးအစားတစ်ခုဖြစ်ပြီး၊ ဖွံ့ဖြိုးဆဲ၊ ပတ်ဝန်းကျင် ခုခံမှုစသဖြင့် ပါဝင်သည့် စည်းကမ်းကွန်ရက်များတွင် အရေးပါသော အခန်းကဏ္ဍမှ ပါဝင်နေပါသည်။ linear RNA မော်လီကျူးများ ဥပမာ mRNA၊ lncRNA၊ 3′ နှင့် 5′ တို့နှင့် ကွဲပြားပါသည်။ circRNA ၏ အဆုံးစွန်းများသည် exonuclease ၏ အစာခြေခြင်းမှ ကယ်တင်ပြီး အများစုထက် ပိုမိုတည်ငြိမ်သော စက်ဝိုင်းပုံသဏ္ဍာန်အဖြစ် ပေါင်းစပ်ထားသည်။ linear RNA CircRNA သည် မျိုးရိုးဗီဇဖော်ပြမှုကို ထိန်းညှိရာတွင် ကွဲပြားသောလုပ်ဆောင်ချက်များရှိကြောင်း တွေ့ရှိခဲ့သည်။ CircRNA သည် miRNA sponge ဟုခေါ်သော miRNA ကို အပြိုင်အဆိုင် ချိတ်ဆက်ပေးသော ceRNA အဖြစ် လုပ်ဆောင်နိုင်သည်။ CircRNA ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု ပလပ်ဖောင်းသည် circRNA ဖွဲ့စည်းပုံနှင့် ထုတ်ဖော်ပြောဆိုမှု ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၊ ပစ်မှတ်ခန့်မှန်းခြင်းနှင့် အခြား RNA မော်လီကျူးအမျိုးအစားများနှင့် ပူးတွဲခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုကို အားကောင်းစေသည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
BSA

Bulked Segregant ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု ပလပ်ဖောင်းတွင် စိတ်ကြိုက် ကန့်သတ်ဘောင်ဆက်တင်ဖြင့် အဆင့်တစ်ဆင့် စံခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုနှင့် အဆင့်မြင့် ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုများ ပါဝင်ပါသည်။ BSA သည် phenotype နှင့်ဆက်စပ်သော မျိုးရိုးဗီဇ အမှတ်အသားများကို အမြန်ဖော်ထုတ်ရန် အသုံးပြုသည့် နည်းပညာတစ်ခုဖြစ်သည်။ BSA ၏ အဓိကလုပ်ငန်းအသွားအလာတွင်- 1. အလွန်ဆန့်ကျင်ဘက်ဖြစ်သော ဖီနိုအမျိုးအစားများပါရှိသော လူအုပ်စုနှစ်ခုကို ရွေးချယ်ခြင်း၊ 2. လူတစ်ဦးချင်းစီ၏ DNA၊ RNA သို့မဟုတ် SLAF-seq (Biomarker မှ တီထွင်ထားသည့်) DNA အစုအဝေးနှစ်ခုကို ဖွဲ့စည်းရန်၊ 3. ရည်ညွှန်းဂျီနိုမ် သို့မဟုတ် အကြားရှိ ကွဲပြားသော sequence များကို ခွဲခြားသတ်မှတ်ခြင်း၊ 4. ED နှင့် SNP-index algorithm ဖြင့် ကိုယ်စားလှယ်လောင်းချိတ်ဆက်ထားသော ဒေသများကို ခန့်မှန်းခြင်း၊ 5. ကိုယ်စားလှယ်လောင်းဒေသများရှိ မျိုးဗီဇဆိုင်ရာ လုပ်ဆောင်ချက်ဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုနှင့် ကြွယ်ဝမှု စသည်တို့။ မျိုးရိုးဗီဇ အမှတ်အသား စစ်ဆေးခြင်း နှင့် primer ဒီဇိုင်း အပါအဝင် ဒေတာများတွင် ပိုမိုအဆင့်မြင့်သော တူးဖော်မှုများကိုလည်း ရရှိနိုင်ပါသည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
Amplicon (16S/18S/ITS)

Amplicon (16S/18S/ITS) ပလပ်ဖောင်းသည် စံပြုအခြေခံခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းနှင့် ပုဂ္ဂိုလ်ရေးသီးသန့်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုပါ၀င်သည့် အဏုဇီဝကွဲပြားမှုဆိုင်ရာ ပရောဂျက်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် အတွေ့အကြုံနှစ်ပေါင်းများစွာဖြင့် တီထွင်ထားခြင်းဖြစ်သည်- အခြေခံခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် လက်ရှိအဏုဇီဝသုတေသန၏ ပင်မခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအကြောင်းအရာကို အကျုံးဝင်သည်၊ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအကြောင်းအရာသည် ကြွယ်ဝပြီး ပြည့်စုံသည်၊ နှင့် ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုရလဒ်များကို စီမံကိန်းအစီရင်ခံစာပုံစံဖြင့် တင်ပြပါသည်။ ပုဂ္ဂိုလ်ရေးသီးသန့်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၏ အကြောင်းအရာသည် ကွဲပြားသည်။ နမူနာများကို ရွေးချယ်နိုင်ပြီး ကန့်သတ်ချက်များကို အခြေခံခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာချက်အစီရင်ခံစာနှင့် သုတေသနရည်ရွယ်ချက်အရ၊ ပုဂ္ဂိုလ်ရေးသီးသန့်လိုအပ်ချက်များကို သိရှိနိုင်ရန် ဘောင်များကို လိုက်လျောညီထွေဖြစ်စေနိုင်သည်။ Windows လည်ပတ်မှုစနစ်သည် ရိုးရှင်းပြီး မြန်ဆန်သည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်
Evolutionary မျိုးရိုးဗီဇ

Evolutionary Genetics သည် SNPs၊ InDels၊ SVs နှင့် CNVs အပါအဝင် မျိုးရိုးဗီဇကွဲပြားမှုများအပေါ် အခြေခံ၍ လူတစ်ဦးချင်းစီ၏အုပ်စုကြီးအတွင်း ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်ကို ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် အဓိပ္ပာယ်ဖွင့်ဆိုနိုင်ရန် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသော ပြည့်စုံသော sequencing ဝန်ဆောင်မှုတစ်ခုဖြစ်သည်။ ဤဝန်ဆောင်မှုသည် လူဦးရေဖွဲ့စည်းပုံ၊ မျိုးရိုးဗီဇကွဲပြားမှုနှင့် ဇီဝမျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ ဆက်ဆံရေးများအပါအဝင် လူဦးရေ၏ဆင့်ကဲပြောင်းလဲမှုများနှင့် မျိုးရိုးဗီဇလက္ခဏာများကို ရှင်းရှင်းလင်းလင်းဖော်ပြရန် လိုအပ်သော မရှိမဖြစ်လိုအပ်သော ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုများအားလုံးကို လွှမ်းခြုံထားသည်။ ထို့အပြင်၊ ၎င်းသည် ထိရောက်သော လူဦးရေအရွယ်အစားနှင့် ကွဲပြားချိန်ကို ခန့်မှန်းနိုင်စေမည့် မျိုးဗီဇစီးဆင်းမှုဆိုင်ရာ လေ့လာမှုများတွင် ထည့်သွင်းစဉ်းစားသည်။ ဆင့်ကဲပြောင်းလဲလာသော မျိုးရိုးဗီဇလေ့လာမှုများသည် မျိုးစိတ်များ၏ မူလအစနှင့် လိုက်လျောညီထွေဖြစ်စေသော တန်ဖိုးရှိသော ထိုးထွင်းသိမြင်မှုကို ပေးသည်။

BMKGENE တွင်၊ ကျွန်ုပ်တို့သည် ကြီးမားသောလူဦးရေအပေါ် ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်မျိုးရိုးဗီဇလေ့လာမှုများပြုလုပ်ရန် နည်းလမ်းနှစ်သွယ်ကို ပေးဆောင်သည်- ဂျီနိုမ်ပေါင်းစပ်ခြင်း (WGS) ကို အသုံးချခြင်း သို့မဟုတ် အိမ်တွင်းမှ တီထွင်ထားသော Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) ကို အသုံးပြုခြင်း သို့မဟုတ် လျှော့ချထားသော ဂျီနိုမ်ဆက်ခြင်းနည်းလမ်းကို ရွေးချယ်ခြင်း။ WGS သည် သေးငယ်သော ဂျီနိုမ်များနှင့် ကိုက်ညီသော်လည်း၊ SLAF သည် ရှည်လျားသော ဂျီနိုမ်များနှင့် ပိုကြီးသော လူဦးရေများကို လေ့လာရန်အတွက် ကုန်ကျစရိတ်သက်သာသော အစားထိုးတစ်ခုအဖြစ် ပေါ်ထွက်လာကာ စီတန်းခြင်းကုန်ကျစရိတ်များကို ထိရောက်စွာ လျှော့ချပေးသည်။

စုံစမ်းရေး အသေးစိတ်