Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

သတင်း

မျိုးရိုးဗီဇပြန်လည်စုဆောင်း

6

SARS-Cov-2 ကို Genomics စောင့်ကြည့်လေ့လာခြင်းသည် NSP1 ဖျက်ခြင်းပုံစံကိုကျွန်ုပ် interferon response ကိုပြောင်းလဲစေသည့် NSP1 ဖျက်ခြင်းမူကွဲ

nanopore | LIKINA | မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာအခြေခံကျခြင်း | Metagenomics | RNA-SEQ | ကောင်းသော

Biomarker Technologies သည်ဤလေ့လာမှုတွင်နမူနာအစီအစဉ်များကိုနည်းပညာအထောက်အပံ့များပေးခဲ့သည်။

ပေါ်လွင်

1.SAS-Cov-2 မျိုးရိုးဗီဇအစီအစဉ်နှင့် Phynometic Consometsis) သည် SNPS နှင့် 4 အဒယ်လ် 43 အပါအ 0 င်ထပ်တလဲလဲဗီဇများကိုဖော်ထုတ်သည်။

2.47 လက်တွေ့ phenotypes နှင့်အတူ 2. sheassociation အလားအလာဖော်ပြသည်
အရေးကြီးသောဗီဇပြောင်းလဲခြင်း။

NSP1 CODING ဒေသတွင်δ500-532δ500-532သည်အနိမ့်ဗိုင်းရပ်စ်နှင့်ဆက်စပ်နေသည်
3. အိတ်နှင့်သွေးရည်ကြည် Ifn-β။

4.Viral သီးခြား on500-532 mutation နှင့်အတူ imolates နိမ့် ISN-I
ရောဂါကူးစက်ဆဲလ်များတွင်တုံ့ပြန်မှု။

စမ်းသပ်ဒီဇိုင်း

စမ်းသပ် - ဒီဇိုင်း

အောင်မြင်မှုများ

News11
News11

1 ။ Covid-19 ကူးစက်ရောဂါနှင့်မျိုးရိုးဗီဇစောင့်ကြည့်ခြင်း

ဇန်နဝါရီလ 22 ရက်, 2020 မှဖေဖော်ဝါရီလ 20 ရက်အထိတရုတ်နိုင်ငံ, ဇန်နဝါရီလ 22 ရက်, 2020 အထိတရုတ်နိုင်ငံ, စီချွမ်ပြည်နယ် Sichuan ပြည်နယ်တွင်လက်တွေ့အချက်အလက်များကိုကောက်ယူခဲ့သည်။ စုစုပေါင်း Sichuan ရှိ QPCR စမ်းသပ်မှုများက Covid-19 ဖြစ်ပွားမှုကိုအတည်ပြုခဲ့သည် အရင်းအနှီး။ စီချွမ်ရှိအတည်ပြုထားသောအမှုပေါင်းသည်ဇန်နဝါရီလ 30 ရက်နေ့တွင်အဆတိုးမြှင့်ကိုတိုးပွားလာသည်။ ထို့အပြင်ဒေတာများသည်လူမှုဆက်ဆံရေးကိုပျံ့နှံ့စေရန်အဓိကအချက်တစ်ခုဖြစ်နိုင်ကြောင်းထောက်ခံသည်။

ပုံ 1 ။ တရုတ်နိုင်ငံ, စီချွမ်ပြည်နယ်ရှိ C Covid-19 ၏ကူးစက်ရောဂါဖြစ်ပွားမှု

2 ။ SARS-cov-2 မျိုးရိုးဗီဇဆောက်လုပ်ရေးနှင့်မျိုးကွဲဖော်ထုတ်ခြင်း

Multiplex PCR Amplification နှင့်အတူနောက်ပိုင်း Nanopore အစီအစဉ်များနှင့်အတူနောက်ပိုင်းတွင်လူနာ 248 ဦး မှစုစုပေါင်းအနီးအနားသို့မဟုတ်တစ်စိတ်တစ်ပိုင်းအပြည့်အဝမပါ 0 င်သည်။ 10 ယောက်ကိုဖတ်ရှုခြင်းဖြင့် 80% ကိုဖတ်ရှုခြင်းများ (အတိမ်အနက် - နမူနာနှုန်း 0.39 မီတာ) ။

News11

ပုံ 2 ။ စီငှာရာရဲတပ်ဖွဲ့အတွင်းမူကွဲတစ်ခုစီ၏ကြိမ်နှုန်း

SARS-Cov-2 Genomes များမှစုစုပေါင်း SNPS နှင့် 184 အမိန့် 18 ခုကိုဖော်ထုတ်နိုင်ခဲ့သည်။ Wuhan မှ 169 နမူနာ 169 ခုနှင့်နှိုင်းယှဉ်ခြင်းနှင့် Gisaid တွင်အရည်အသွေးမြင့် Publicome Genome ပာနှင့်နှိုင်းယှဉ်ခြင်းဖြင့်အခြားတိုက်ကြီး 35 ခုအနက်မှ 29 ခုရှိသည်။ အထူးသဖြင့်δ500-532, ACC18108AN နှင့် T13243C အပါအ 0 င်မျိုးကွဲ 4 ခုကိုသီရိလင်္်ရန်နှင့် Wuhan တို့တွင်သာတွေ့ရပြီး GISAID အချက်အလက်များတွင်မရှိခဲ့ပါ, လူနာများ၏ခရီးသွားမှတ်တမ်းများ။

အများဆုံးဖြစ်နိုင်ခြေ (ML) နည်းလမ်းနှင့် Bayesian မော်လီကျူးနာရီချဉ်းကပ်မှုနှင့်အတူဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်ဆိုင်ရာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းနှင့် Bayesian မော်လီကျူးနာရီချဉ်းကပ်မှု 88 ခုနှင့်အခြားဒေသများမှကုသသောဂရင်း 250 တွင်ပြုလုပ်ခဲ့သည်။ δ500-532 (NSP1 coding ဒေသရှိဖျက်ခြင်း) နှင့်အတူ Genomes (NSP1 Coding ဒေသရှိဖျက်ခြင်း) ကိုဖြန့်ဝေခဲ့သည်တွေ့ရှိခဲ့ပါတယ်။ NSP1 တွင် Haplotype ဆန်းစစ်လေ့လာခြင်း NSP1 မျိုးကွဲမျိုးကွဲများကိုမြို့ကြီးများမှ 5 ခုကိုဖော်ထုတ်ခဲ့သည်။ ဤရလဒ်များအရδ500-532သည်မြို့ကြီးများတွင်ဖြစ်ပွားခဲ့ပြီး Wuhan မှအကြိမ်များစွာတင်သွင်းနိုင်သည်ဟုအကြံပြုသည်။

2-1-1024x709

ပုံ 2 ။ ထပ်တူထပ်မျှမျိုးရိုးဗီဇမျိုးကွဲများနှင့် SARS-Cov-2 Genomes တွင် Phylogenetic ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း

3 ။ ထပ်တလဲလဲမျိုးရိုးဗီဇမျိုးရိုးမျိုးစိတ်များ၏အသင်း

117 လက်တွေ့ phenotypes သည် Covid-19 ပြင်းထန်မှုနှင့်ဆက်စပ်မှုရှိပြီးပြင်းထန်မှုဆိုင်ရာပြင်းထန်မှု phenotypes များကိုပြင်းထန်ပြီးပြင်းထန်သောစရိုက်များသို့ခွဲခြားထားသည်။ ဤစရိုက်များနှင့်ထပ်တလဲလဲမျိုးရိုးဗီဇမျိုးမျိုးရိုးဗီဇမျိုးမျိုးကွဲ 35 ခုအနက်ဆက်ဆံရေးသည် Bi-Cluster Heatmap တွင်ရရှိခဲ့သည်။ GSEA နှင့်တူသောအဆင့်သတ်မှတ်ထားမှုအသစ်ကိုဆန်းစစ်ခြင်းသည်δ500-532သည် ESR, Serum IFN-and andcd3 + cd8 + CD8 + tD8 + ​​t sec8 + t ကိုဆဲလ်အရေအတွက်နှင့်ဆက်စပ်နေသည်ဟုပြသခဲ့သည်။ ထို့အပြင် QPCR စမ်းသပ်မှုများအရဗိုင်းရပ်စ်ပိုးကူးစက်ခံထားရသောလူနာများမှာδ500-532တွင်ရှိသောလူနာများမှာအမြင့်ဆုံး CT တန်ဖိုးရှိသည်ဟု IE အနိမ့်ဆုံးဗိုင်းရပ်စ်ပိုးဖြစ်သည်။

3-1
3-1-1

ပုံ 3 ။ 35 ထပ်တလဲလဲမျိုးရိုးဗီဇအမျိုးအစားများကိုလက်တွေ့ phenotypes နှင့်အတူ

4 ။ ဗိုင်းရပ်စ် mutation နှင့်ဆက်စပ်သောလက်တွေ့ phenotypes အပေါ်အတည်ပြုခြင်း

NSP1 လုပ်ဆောင်ချက်များတွင်δ500-532၏အကျိုးသက်ရောက်မှုများကိုနားလည်ရန် hek239t ဆဲလ်များကို Elek239t ဆဲလ်များဖြင့်အပြည့်အ 0 အရှည်, ကုသထားသော hek239t ဆဲလ်တစ်ခုချင်းစီ၏ transcre239t ဆဲလ်တစ်ခုစီ၏ transcription profile များကို PCA ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းအတွက်ပြုလုပ်ခဲ့သည်။ Mutant တွင်သိသိသာသာအကောင်အထည်ဖော်သည့်မျိုးဗီဇသည် "Peptide Biosynthetic / Metabolic / Metabolic Process" တွင် "Ribonucleoprotein Completious Biogenesis", "Protonuclerome Miogenesis", "Protein membrane / er" အတွက်

4

ပုံ 4 ။ hek239t ဆဲလ်များပေါ်တွင် transcriptome ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ WT NSP1 ဖြင့်ပြောင်းရွှေ့ခြင်းနှင့်ဖျက်ခြင်းဖြင့်ပြောင်းခြင်း

IFN-1 တုန့်ပြန်မှုအပေါ်ဖျက်ခြင်း၏အကျိုးသက်ရောက်မှုများကိုအလွန်အကျွံလေ့လာမှုတွင်လည်းစမ်းသပ်ခံခဲ့ရသည်။ စမ်းသပ်ထားသောဖျက်ခြင်းအားလုံးသည် IFN-1 repsonse ကို Transk239t နှင့် A549 ဆဲလ်နှစ်ခုစလုံးတွင် transiriptome အဆင့်နှင့်ပရိုတိန်းအဆင့်တွင်ပြောင်းရွှေ့ခံရသည်။ စိတ်ဝင်စားစရာမှာ "Deletion ရှိဗိုင်းရပ်စ်ပိုး၏ဗိုင်းရပ်စ်ပွားခြင်း" ဖြစ်သော "RNA ကူးယူခြင်းစည်းမျဉ်းစည်းကမ်း" နှင့် "I Interveron on Polymerge II" နှင့် "Polymerge II" နှင့် "Polymeron မှတုန့်ပြန်ခြင်း) နှင့်" Typrestion typrester type "နှင့်" Typrester Typrestion type "နှင့်" Typrestion type and Typrestion ")

5

ပုံ 5 ။ δ500-532 mutant တွင် interferon အချက်ပြအချက်ပြမှုလမ်းကြောင်း၏စည်းမျဉ်းစည်းကမ်းများပြပုံ

ဤလေ့လာမှုတွင်ဤဖျက်ခြင်းများ၏ဗိုင်းရပ်စ်ပိုးကူးစက်မှုဆိုင်ရာလေ့လာမှုများကထပ်မံအတည်ပြုခဲ့သည်။ အချို့သော Mutant နှင့်အတူဗိုင်းရပ်စ်များကိုလက်တွေ့နမူနာများမှခွဲထုတ်ပြီး Calu-3 ဆဲလ်များနှင့်ကူးစက်သည်။ ဗိုင်းရပ်စ်ကူးစက်မှုလေ့လာမှုအပေါ်အသေးစိတ်ရလဒ်များကိုစာရွက်တွင်ဖတ်ရှုနိုင်သည်။
DOI:10.1016 / J.Chom.Chom.21.015

တိုးကားခြင်း

လင်း J, Tang C, Wei H, et al ။ SARS-Cov-2 ကို Genomic စောင့်ကြည့်လေ့လာခြင်းသည် NSP1 ဖျက်ခြင်းပုံစံကို Modulates အမျိုးအစား I Interveron Response [J] ဆဲလ်အိမ်ရှင်နှင့်ပိုးမွှား 2021 ။

သတင်းနှင့်ပေါ်လွင်ချက်များ Biomarker Technololies နှင့်နောက်ဆုံးအကြိမ်အောင်မြင်သောကိစ္စများကိုမျှဝေရန်ရည်ရွယ်သည်။ သိပ္ပံနည်းကျအောင်မြင်မှုများနှင့်လေ့လာမှုအတွင်းအသုံးချသည့်ထင်ရှားသောနည်းစနစ်များကိုဖမ်းယူခြင်းနှင့်ထင်ရှားသောနည်းစနစ်များကိုဖမ်းယူခြင်း။


Post Time: Jan-06-2022

သင်၏စာကိုကျွန်ုပ်တို့ထံပေးပို့ပါ။