DNBSEQ ကြိုတင်ပြုလုပ်ထားသော စာကြည့်တိုက်များ
အင်္ဂါရပ်များ
●ပလပ်ဖောင်း-MGI-DNBSEQ-T7
●ဆက်တိုက်မုဒ်များ-PE150
●Illumina စာကြည့်တိုက်များသို့ လွှဲပြောင်းခြင်း။MGI:စျေးနှုန်းချိုသာစွာဖြင့် မြင့်မားသောဒေတာပမာဏများကို စီတန်းနိုင်စေခြင်း။
●အတွဲလိုက်မလုပ်မီ စာကြည့်တိုက်များ၏ အရည်အသွေးကို ထိန်းချုပ်ပါ။
●ဒေတာ QC နှင့် ပေးပို့ခြင်းတို့ကို စီစစ်ခြင်း-QC အစီရင်ခံစာနှင့် ကုန်ကြမ်းဒေတာကို demultiplexing နှင့် filtering Q30 ဖတ်ပြီးနောက် fastq ဖော်မတ်ဖြင့် ပေးပို့ခြင်း။
အားသာချက်များ
●Sequencing ဝန်ဆောင်မှုများ၏ ဘက်စုံသုံးနိုင်မှု-သုံးစွဲသူသည် လမ်းကြော သို့မဟုတ် ဒေတာပမာဏအလိုက် စီရန်ရွေးချယ်နိုင်သည်။
●မြင့်မားသောဒေတာအထွက်-1500 Gb/လမ်းသွား
●ဆက်တိုက် QC အစီရင်ခံစာပေးပို့ခြင်း-အရည်အသွေးတိုင်းတာမှုများ၊ ဒေတာတိကျမှုနှင့် စီစစ်ခြင်းပရောဂျက်၏ အလုံးစုံစွမ်းဆောင်ရည်တို့နှင့်အတူ။
●အရွယ်ရောက်ပြီးသော စီတန်းခြင်းလုပ်ငန်းစဉ်-အလှည့်ကျအချိန်တိုဖြင့်။
●တင်းကျပ်သောအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု: ကျွန်ုပ်တို့သည် အရည်အသွေးမြင့်မားသောရလဒ်များကို တစ်သမတ်တည်းပေးဆောင်ရန် အာမခံရန် တင်းကျပ်သော QC လိုအပ်ချက်များကို အကောင်အထည်ဖော်ပါသည်။
နမူနာလိုအပ်ချက်များ
| ဒေတာပမာဏ (X) | အာရုံစူးစိုက်မှု (qPCR/nM) | အတွဲ | |
| တပိုင်းတစ လမ်းသွယ်
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| တစ်ကြောင်းလမ်း | လမ်းသွယ်အလိုက် | ≥ 1.5 nM / Library pool | ≥ 25 μl / စာကြည့်တိုက်ရေကန် |
အာရုံစူးစိုက်မှုနှင့် စုစုပေါင်းပမာဏအပြင် သင့်လျော်သော အမြင့်ဆုံးပုံစံတစ်ခုလည်း လိုအပ်ပါသည်။
မှတ်ချက်- ကွဲပြားမှုနည်းပါးသော ဒစ်ဂျစ်တိုက်များ၏ လမ်းကြောများကို စီစစ်ခြင်းသည် ခိုင်မာသောအခြေခံခေါ်ဆိုမှုကိုသေချာစေရန် PhiX spike-in လိုအပ်သည်။
နမူနာများအဖြစ် စုစည်းထားသော စာကြည့်တိုက်များကို နမူနာအဖြစ် တင်ပြရန် အကြံပြုအပ်ပါသည်။ စာကြည့်တိုက်ပေါင်းကူးခြင်းလုပ်ဆောင်ရန် BMKGENE ကို လိုအပ်ပါက၊ ကျေးဇူးပြု၍ ဖတ်ရှုပါ။
တစ်စိတ်တစ်ပိုင်းလမ်းကြော စီစစ်ခြင်းအတွက် စာကြည့်တိုက်လိုအပ်ချက်များ။
စာကြည့်တိုက်အရွယ်အစား (အမြင့်ဆုံးမြေပုံ)
ပင်မအထွတ်အထိပ်သည် 300-450 bp အတွင်းဖြစ်သင့်သည်။
စာကြည့်တိုက်များသည် ပင်မအထွတ်အထိပ်တစ်ခုသာ ရှိသင့်သည်၊ အဒက်တာ ညစ်ညမ်းမှုမရှိစေဘဲ primer dimers မရှိသင့်ပါ။
ဝန်ဆောင်မှုလုပ်ငန်းအသွားအလာ
စာကြည့်တိုက် QC အစီရင်ခံစာ
အတွဲလိုက်၊ စာကြည့်တိုက် ပမာဏကို အကဲဖြတ်ခြင်းနှင့် အပိုင်းပိုင်းခွဲခြင်းမပြုမီ စာကြည့်တိုက်၏ အရည်အသွေးဆိုင်ရာ အစီရင်ခံစာကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။
QC အစီရင်ခံစာကို စီစစ်ခြင်း။
ဇယား 1. ကိန်းဂဏာန်းများ စီစစ်ခြင်းဆိုင်ရာ ကိန်းဂဏန်းများ။
| နမူနာ ID | BMKID | အကြမ်းဖတ်တယ်။ | ဒေတာအကြမ်း (bp) | သန့်ရှင်းသောဖတ်ခြင်း (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | ၂၂,၈၇၀,၁၂၀ | ၆,၈၆၁,၀၃၆,၀၀၀ | ၉၆.၄၈ | ၉၉.၁၄ | ၉၄.၈၅ | ၃၆.၆၇ |
| C_02 | BMK_02 | ၁၄၊၇၁၇၊၈၆၇ | ၄၊၄၁၅၊၃၆၀၊၁၀၀ | ၉၆.၀၀ | ၉၈.၉၅ | ၉၃.၈၉ | ၃၇.၀၈ |
ပုံ 1။ နမူနာတစ်ခုစီတွင် ဖတ်ရှုထားသော အရည်အသွေးများ ဖြန့်ဝေခြင်း။
ပုံ 2။ အခြေခံအကြောင်းအရာ ဖြန့်ဖြူးခြင်း။
ပုံ 3။ အချက်အလက် စီတန်းခြင်းတွင် ဖတ်ထားသော အကြောင်းအရာများကို ဖြန့်ဝေခြင်း။
