条形banner-၀၃

ထုတ်ကုန်များ

Illumina ကြိုတင်လုပ်ထားသောစာကြည့်တိုက်များ

Illumina sequencing နည်းပညာသည် Sequencing by Synthesis (SBS) ကိုအခြေခံ၍ ကမ္ဘာတစ်ဝှမ်းလုံးလက်ခံထားသော NGS ဆန်းသစ်တီထွင်မှုဖြစ်ပြီး၊ ကမ္ဘာ့ sequencing data ၏ 90% ကျော်ကိုထုတ်ပေးရန်တာဝန်ရှိသည်။ SBS ၏ နိယာမတွင် dNTP တစ်ခုစီကို ပေါင်းထည့်ထားသောကြောင့် နောက်ပြန်အုတ်မြစ်ကို ပေါင်းစပ်ထည့်သွင်းထားသောကြောင့် အလင်းတန်းဖြင့် ပြောင်းပြန်လှန်နိုင်သော terminator များကို ဓါတ်ပုံရိုက်ခြင်းတွင် ပါဝင်ပြီး နောက်အခြေခံတစ်ခု၏ပေါင်းစပ်မှုကို ခွင့်ပြုရန် နောက်ပိုင်းတွင် ပိုင်းခြားထားသည်။ နောက်ပြန်လှည့်နိုင်သော terminator-bound dNTP လေးခုလုံးသည် ဆက်တိုက်လည်ပတ်မှုတစ်ခုစီတွင် ရှိနေသဖြင့်၊ သဘာဝပြိုင်ဆိုင်မှုသည် ပေါင်းစည်းခြင်းဆိုင်ရာ ဘက်လိုက်မှုကို လျော့နည်းစေသည်။ ဤစွယ်စုံရနည်းပညာသည် တစ်ခုတည်း-ဖတ်ပြီး တွဲစပ်ပြီးသည့် စာကြည့်တိုက်များကို ပံ့ပိုးပေးကာ မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ အပလီကေးရှင်းများစွာကို ပံ့ပိုးပေးသည်။ Illumina sequencing ၏ high-throughput စွမ်းရည်များနှင့် တိကျမှုတို့က ၎င်းအား မျိုးရိုးဗီဇသုတေသနတွင် အုတ်မြစ်တစ်ခုအဖြစ် သတ်မှတ်ပေးကာ သိပ္ပံပညာရှင်များအား ဂျီနိုမ်များ၏ ရှုပ်ထွေးနက်နဲမှုများကို လိုက်လျောညီထွေမရှိသော အသေးစိတ်နှင့် ထိရောက်မှုတို့ဖြင့် ဖော်ထုတ်နိုင်စေရန် စွမ်းဆောင်ပေးပါသည်။

ကျွန်ုပ်တို့၏ကြိုတင်ပြုလုပ်ထားသော စာကြည့်တိုက်ကို စီစစ်ခြင်းဝန်ဆောင်မှုသည် သုံးစွဲသူများအား မတူကွဲပြားသောရင်းမြစ်များ (mRNA၊ ဂျီနိုမီ၊ အမ်ပလီကွန်၊ 10x စာကြည့်တိုက်များ၊ အခြားအရာများ) မှ အတွဲလိုက်စာကြည့်တိုက်များကို ပြင်ဆင်နိုင်စေပါသည်။ နောက်ပိုင်းတွင်၊ ဤစာကြည့်တိုက်များကို Illumina ပလပ်ဖောင်းများတွင် အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုနှင့် စီတန်းခြင်းအတွက် ကျွန်ုပ်တို့၏ sequencing စင်တာများသို့ ပေးပို့နိုင်ပါသည်။


ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်

သရုပ်ပြရလဒ်

အင်္ဂါရပ်များ

ပလပ်ဖောင်းများ-Illumina NovaSeq 6000 နှင့် NovaSeq X Plus

ဆက်တိုက်မုဒ်များ-PE150 နှင့် PE250

အတွဲလိုက်မလုပ်မီ စာကြည့်တိုက်များ၏ အရည်အသွေးကို ထိန်းချုပ်ပါ။

ဒေတာ QC နှင့် ပေးပို့ခြင်းတို့ကို စီစစ်ခြင်း-QC အစီရင်ခံစာနှင့် ကုန်ကြမ်းဒေတာကို demultiplexing နှင့် filtering Q30 ဖတ်ပြီးနောက် fastq ဖော်မတ်ဖြင့် ပေးပို့ခြင်း။

 

 

ဝန်ဆောင်မှု အားသာချက်များ

Sequencing ဝန်ဆောင်မှုများ၏ ဘက်စုံသုံးနိုင်မှု-ဖောက်သည်သည် လမ်းကြောအလိုက်၊ စီးဆင်းမှုဆဲလ် သို့မဟုတ် လိုအပ်သော ဒေတာပမာဏအလိုက် (တစ်စိတ်တစ်ပိုင်းလမ်းကြော စီစစ်ခြင်း) ကို ရွေးချယ်နိုင်သည်။

Illumina sequencing platform တွင် ကျယ်ပြန့်သော အတွေ့အကြုံ။မျိုးစိတ်အမျိုးမျိုးဖြင့် ပိတ်ထားသော ပရောဂျက်ပေါင်း ထောင်နှင့်ချီ၍ 

ဆက်တိုက် QC အစီရင်ခံစာပေးပို့ခြင်း-အရည်အသွေးတိုင်းတာမှုများ၊ ဒေတာတိကျမှုနှင့် စီစစ်ခြင်းပရောဂျက်၏ အလုံးစုံစွမ်းဆောင်ရည်တို့နှင့်အတူ။

အရွယ်ရောက်ပြီးသော စီတန်းခြင်းလုပ်ငန်းစဉ်-အလှည့်ကျအချိန်တိုဖြင့်။

တင်းကျပ်သောအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု: ကျွန်ုပ်တို့သည် အရည်အသွေးမြင့်မားသောရလဒ်များကို တစ်သမတ်တည်းပေးဆောင်ရန် အာမခံရန် တင်းကျပ်သော QC လိုအပ်ချက်များကို အကောင်အထည်ဖော်ပါသည်။

 

 

နမူနာပလပ်ဖောင်းများ

ပလပ်ဖောင်း

Flow Cell

Sequencing မုဒ်

ယူနစ်

ခန့်မှန်းထွက်ရှိမှု

NovaSeq X

10B (၈လမ်းသွား)၊

PE150

တစ်ကြောင်းလမ်း

တပိုင်းတစ လမ်းသွယ်

375Gb/လမ်းသွယ်

25B (၈လမ်းသွား)၊

PE150

တစ်ကြောင်းလမ်း

တပိုင်းတစ လမ်းသွယ်

1000 Gb/လမ်းသွား

NovaSeq 6000

SP Flow cell (2 လမ်းသွား)

PE250

Flow Cell

တစ်ကြောင်းလမ်း

တပိုင်းတစ လမ်းသွယ်

325-400 M reads/လမ်းသွယ်

S4 Flow cell (4 လမ်းသွား)

PE150

Flow Cell

တစ်ကြောင်းလမ်း

တပိုင်းတစ လမ်းသွယ်

~800 Gb/လမ်းသွယ်

နမူနာလိုအပ်ချက်များ

 

ဒေတာပမာဏ (X)

အာရုံစူးစိုက်မှု (qPCR/nM)

အတွဲ

Partial Lane Sequencing

 

 

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 μl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 Gb < X ≤ 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 25 μl

လမ်းကြောကို စီစစ်ခြင်း။

လမ်းသွယ်အလိုက်

≥ 1.5 nM / Library pool

≥ 25 μl / စာကြည့်တိုက်ရေကန်

အာရုံစူးစိုက်မှုနှင့် စုစုပေါင်းပမာဏအပြင် သင့်လျော်သော အမြင့်ဆုံးပုံစံတစ်ခုလည်း လိုအပ်ပါသည်။

မှတ်ချက်- ကွဲပြားမှုနည်းပါးသော ဒစ်ဂျစ်တိုက်များ၏ လမ်းကြောများကို စီစစ်ခြင်းသည် ခိုင်မာသောအခြေခံခေါ်ဆိုမှုကိုသေချာစေရန် PhiX spike-in လိုအပ်သည်။

နမူနာများအဖြစ် စုစည်းထားသော စာကြည့်တိုက်များကို နမူနာအဖြစ် တင်ပြရန် အကြံပြုအပ်ပါသည်။ စာကြည့်တိုက်ပေါင်းကူးခြင်းလုပ်ဆောင်ရန် BMKGENE လိုအပ်ပါက၊ ကျေးဇူးပြု၍ ကိုးကားပါ။

partial lane sequence အတွက် စာကြည့်တိုက်လိုအပ်ချက်များ။

စာကြည့်တိုက်အရွယ်အစား (အမြင့်ဆုံးမြေပုံ)

ပင်မအထွတ်အထိပ်သည် 300-450 bp အတွင်းဖြစ်သင့်သည်။
စာကြည့်တိုက်များသည် ပင်မအထွတ်အထိပ်တစ်ခုသာ ရှိသင့်သည်၊ အဒက်တာ ညစ်ညမ်းမှုမရှိစေဘဲ primer dimers မရှိသင့်ပါ။

သင်၏နမူနာများသည် စတင်သည့်ပစ္စည်းလိုအပ်ချက်များနှင့် မကိုက်ညီပါက ကျွန်ုပ်တို့ထံ ဆက်သွယ်ပါ။

ဝန်ဆောင်မှုလုပ်ငန်းအသွားအလာ

နမူနာပြင်ဆင်မှု

စာကြည့်တိုက်အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု

Sequencing

Sequencing

ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ

ဒေတာအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု

နမူနာ QC

စီမံကိန်းပေးပို့ခြင်း။


  • ယခင်-
  • နောက်တစ်ခု:

  • စာကြည့်တိုက် QC အစီရင်ခံစာ

    အတွဲလိုက်၊ စာကြည့်တိုက် ပမာဏကို အကဲဖြတ်ခြင်းနှင့် အပိုင်းပိုင်းခွဲခြင်းမပြုမီ စာကြည့်တိုက်၏ အရည်အသွေးဆိုင်ရာ အစီရင်ခံစာကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။

     

    QC အစီရင်ခံစာကို စီစစ်ခြင်း။

     

    ဇယား 1. ကိန်းဂဏာန်းများ စီစစ်ခြင်းဆိုင်ရာ ကိန်းဂဏန်းများ။

    နမူနာ ID

    BMKID

    အကြမ်းဖတ်တယ်။

    ဒေတာအကြမ်း (bp)

    သန့်ရှင်းသောဖတ်ခြင်း (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    ၂၂,၈၇၀,၁၂၀

    ၆,၈၆၁,၀၃၆,၀၀၀

    ၉၆.၄၈

    ၉၉.၁၄

    ၉၄.၈၅

    ၃၆.၆၇

    C_02

    BMK_02

    ၁၄၊၇၁၇၊၈၆၇

    ၄၊၄၁၅၊၃၆၀၊၁၀၀

    ၉၆.၀၀

    ၉၈.၉၅

    ၉၃.၈၉

    ၃၇.၀၈

    ပုံ 1။ နမူနာတစ်ခုစီတွင် ဖတ်ရှုထားသော အရည်အသွေးများ ဖြန့်ဝေခြင်း။

    A9

    ပုံ 2။ အခြေခံအကြောင်းအရာ ဖြန့်ဖြူးခြင်း။

    A10

    ပုံ 3။ အချက်အလက် စီတန်းခြင်းတွင် ဖတ်ထားသော အကြောင်းအရာများကို ဖြန့်ဝေခြင်း။

    A11

     

    ကိုးကားရယူပါ။

    သင့်စာကို ဤနေရာတွင် ရေးပြီး ကျွန်ုပ်တို့ထံ ပေးပို့ပါ။

    သင့်ထံ မက်ဆေ့ချ်ပို့ပါ-