●ကျယ်ပြန့်ကျွမ်းကျင်မှုနှင့်ထုတ်ဝေမှတ်တမ်းများ- BMKGENE သည်နှိုင်းယှဉ်တတ်သော Genomics စီမံကိန်း 90 ကျော်နှင့်နှိုင်းယှဉ်လျှင်နှိုင်းယှဉ်တတ်သော Genomics Project 90 ကျော်ကိုပြီးစီးခဲ့သည်။
●ပြည့်စုံသောဇီဝလောင်စာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း: ဆန်းစစ်လေ့လာသူအစီအစဉ်တွင်အသုံးအများဆုံးခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုရှစ်ခုပါ 0 င်သည်
●အထူးကျွမ်းကျင်သောဇီဝလောင်စာအဖွဲ့နှင့်တိုတောင်းသောခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာသံသရာ- နှိုင်းယှဉ် genomics ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းတွင်အတွေ့အကြုံများစွာရှိသော BMKGENE အဖွဲ့၏အဖွဲ့သည်ကွဲပြားခြားနားသောအလှည့်တစ်ဝှမ်းတွင်ကွဲပြားခြားနားသောကိုယ်ပိုင်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတောင်းဆိုမှုများကိုပြည့်စုံစေသည်
●အရောင်းအ 0 င် Post ပံ့ပိုးမှု -ကျွန်ုပ်တို့၏ကတိက 0 တ်သည်စီမံကိန်းပြီးစီးခြင်းထက် 3 လအကြာရောင်း 0 ယ်သည့် 0 န်ဆောင်မှုကာလနှင့်အတူစီမံကိန်းပြီးဆုံးသည်။ ဤအချိန်အတောအတွင်းရလဒ်များနှင့်သက်ဆိုင်သောမေးမြန်းချက်များကိုဖြေရှင်းရန်စီမံကိန်းနောက်ဆက်တွဲ, မေးခွန်းများနှင့်မေးခွန်းများအတွက်စီမံကိန်းများအတွက်စီမံကိန်းများအတွက်စီမံကိန်းများပြုလုပ်ရန်,
ခန့်မှန်းအလှည့် - န်းကျင်အချိန် | မျိုးစိတ်အရေအတွက် | သုံးသပ်ခြင်း |
အသက် 30 အလုပ်လုပ်ရက် | 6 - 12 | မျိုးရိုးဗီဇမိသားစု Clustering Gene မိသားစုချဲ့ထွင်ခြင်းနှင့်ကျုံ့ခြင်း Phylogenetic သစ်ပင်ဆောက်လုပ်ရေး မတူကွဲပြားသောအချိန်ခန့်မှန်းချက် (ကျောက်ဖြစ်ကြ၏) LTR ထည့်သွင်းချိန် (အပင်များအတွက်) မျိုးမျိုးမျိုးဗီဇမိတ္တူပွားခြင်း (အပင်များအတွက်) ရွေးချယ်ဖိအား Synteny ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ |
●မျိုးရိုးဗီဇမိသားစု
● phylogenetics
●မတူကွဲပြားအချိန်
●ရွေးချယ်မှုဖိအား
● synteny ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ
တစ်သျှူးများအတွက်
အမျိုးခဲှမျိုး | ရေစက်ဏူ | သုံးသပ်ခြင်း | pacbio ccs |
တိရစာ္ဆန် | visceral တစ်ရှူး | 0.5 ~ 1 ဂရမ် | ≥ 3.5 ဂရမ် |
ကြွက်သားတစ်သျှူး | |||
≥ 5.0 ဂရမ် | |||
≥ 5.0 ml | |||
နို့တိုက်သတ္တဝါများ | |||
≥ 0.5 ml | |||
ကြက်, ငါးသွေး | |||
စက်တန်းဆာကိရိယာ | သစ်ရွက်သစ် | 1 ~ 2 ဂရမ် | ≥ 5.0 ဂရမ် |
Petal / ပင်စည် | 1 ~ 2 ဂရမ် | ≥ 10.0 ဂရမ် | |
အမြစ် / မျိုးစေ့ | 1 ~ 2 ဂရမ် | ≥ 20.0 ဂရမ် | |
ဆဲလ် | ယဉ်ကျေးမှုဆဲလ် | - | ≥ 1 x 108 |
အနီးကပ်ဆက်စပ်မျိုးစိတ်များ၏မျိုးရိုးဗီဇဖိုင်များ (။ ဖိသfိညာဉ်) နှင့်မှတ်စုဖိုင်များ (.Gff3)
*ဒီနေရာမှာပြသထားတဲ့သရုပ်ပြရလဒ်တွေဟာ Biomarker Technologies နဲ့ထုတ်ဝေတဲ့မျိုးရိုးဗီဇတွေပါ
1.ltr ထည့်သွင်းအချိန်ကိုထည့်သွင်းပါ - တခြားမျိုးစိတ်များနှင့်နှိုင်းယှဉ်လျှင် Rye Genome တွင် LTR-RTS Cashry Times တွင် LTR-RTS ထည့်သွင်းသည့်အချိန်များတွင်ထူးခြားသောဘ 0 ကိုဖြန့်ဖြူးခဲ့သည်။ လွန်ခဲ့သောနှစ်ပေါင်း 0.5 သန်းကလတ်တလောအထွတ်အထိပ်သို့ရောက်ရှိလာခဲ့သည်။
li guang et al ။ ,သဘာဝမျိုးရိုးဗီဇ2021
2. Chayote (SEMHIAITY EDULE) အပေါ်လက်ကိုင်မိသားစုခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းနှင့်မျိုးရိုးဗီဇမိသားစုရှိအခြားဆက်စပ်မျိုးစိတ်များကိုခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းအားဖြင့် Chayote သည်မြွေမိသားစု (Trichosanthes Anguina) နှင့်နီးကပ်စွာဆက်နွယ်မှုအရှိဆုံးဖြစ်သည်။ CUBUIBTACEEE တွင်တတိယ WGD ဖြစ်သည့်တတိယ WGD ဖြစ်ရပ်ဖြစ်သော Geneouse Procake (WGD) တွင်မျိုးရိုးဗီဇပုံတူပွားခြင်း (WGD) ကို Chayote တွင်ရရှိခဲ့သည်။
fu a et al ။ ,ဟော်ရီကာချာသုတေသန2021
3.ynteny analysis: သစ်သီးဖြည့်ဆည်းတိုးတက်မှုရှိ Phytohormones နှင့်သက်ဆိုင်သောမျိုးဗီဇများကို Chayote, မြွေသဟဇာနှင့် squash တို့တွင်တွေ့ရသည်။ Chayote နှင့် Squash အကြားဆက်စပ်မှုသည် Chayote နှင့်မြွေသွပ်ရည်ကြားတွင်အနည်းငယ်ပိုမိုမြင့်မားသည်။
fu a et al ။ ,ဟော်ရီကာချာသုတေသန2021
4. ဂျော့ခ်ျမိသားစုခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု - G.Thurberi နှင့် G.Davidsonii တို့တွင်မျိုးရိုးဗီဇမိသားစုတိုးချဲ့ခြင်းနှင့်ကျုံ့ခြင်းတို့တွင် Geegg ကြွယ်ဝမှုကို G.Thurberi နှင့် G.DavidSonii တို့တွင် Steroid Biosynthesis နှင့်BrassinàOSTOTION BIOSynthesis နှင့်ဆက်စပ်နေသည်ဟုပြသခဲ့သည်။
ယန် et al ။ ,BMC BIOOLY2021
5. ဒီမျိုးရိုးဗီဇမိတ္တူပွားခြင်းခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု - 4DTV နှင့် Ks ဖြန့်ဖြူးခြင်းခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတစ်ခုလုံးမျိုးမျိုးမျိုးမျိုးရိုးဗီဇပုံတူပွားမှုဖြစ်ရပ်ကိုပြသခဲ့သည်။ intraspecies ၏ထိပ် Spealiaties ဖြစ်ရပ်များကိုပြသထားသော interspecies ၏ထိပ်။ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းကအခြားအနီးကပ်ဆက်စပ်မျိုးစိတ်သုံးမျိုးနှင့်နှိုင်းယှဉ်ခြင်းအားဖြင့် O. EURECHAEA သည်မကြာသေးမီကအကြီးစားဗီဇပုံစံကိုဖြတ်သန်းခဲ့ရသည်။
rao g et al ။ ,ဟော်ရီကာချာသုတေသန2021
BMK ကိစ္စ
Prickle မပါဘဲနှင်းဆီ - အစိုဓာတ်လိုက်လျောညီထွေဖြစ်အောင်ဆက်စပ်
ထုတ်ဝေသည် အမျိုးသားသိပ္ပံပြန်လည်ဆန်းစစ်ခြင်း2021
မဟာဗျူဟာအစီအစဉ်
'Basye ရဲ့ဆူးပင်သော'(R.Wichurainan) မျိုးရိုးဗီဇ:
ခန့်။ 93 x pacbio + ခန့်။ 90 x nanopore + 267 x illumina
အဓိကရလဒ်များ
1. ight အရည်အသွေး r.wichuraianaa မျိုးရိုးဗီဇသည် 530.07 MB (ခန့်မှန်းသောမျိုးရိုးဗီဇအရွယ်အစားခန့်မှန်းခြေအားဖြင့် 525.9 MB (ခန့်မှန်းခြေ MB) သည် 525.9 MB (525.9 MB) တွင် 525.9 MB အထိဖြစ်သည်။ ဘတ်စ်ကားခန့်မှန်းရမှတ် 93.9% ရှိသည်။ "ဟောင်းသောမျက်နှာ" (Haploob) နှင့်နှိုင်းယှဉ်ခြင်းနှင့်နှိုင်းယှဉ်ခြင်းဖြင့်ဤမျိုးရိုးဗီဇ၏အရည်အသွေးနှင့်ပြည့်စုံမှုကို Single-base တိကျမှုနှင့် LTR တပ်ဆင်ခြင်းအညွှန်းကိန်း (LAI = 20.03) မှအတည်ပြုခဲ့သည်။ r.wichuraiaiana မျိုးရိုးဗီဇတွင်ပရိုတင်းများမျိုးဗီဇတွင် 32,674 ခုပါ 0 င်သည်။
2 ။ ထို့အပြင် QTL ရှိဆက်နွယ်သောမျိုးဗီဇဆိုင်ရာစကားရပ်အမျိုးမျိုးကို stem prickle perting နှင့်ဆက်စပ်မှုရှိဖွယ်ရှိသည်။
Synteny Analysis ၏ synteny ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း, မျိုးရိုးဗီဇမိသားစုစပျစ်သီးပြွတ်များအပါအ 0 င်မျိုးရိုးဗီဇမိသားစုစပျစ်သီးပြွတ်များ, NAC နှင့် FRS GRS GRS Gene မိသားစုများတွင်ထူးခြားသောတိုးချဲ့မှုသည်အနက်ရောင်အစက်အပြောက်ကိုခုခံနိုင်မှုနှင့်ဆက်စပ်နေဖွယ်ရှိသည်။
BT နှင့် Haploob မျိုးစပ်ကြားနှိုင်းယှဉ် genomics ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ။
Zhong, အမ်, et al ။ "Prickle မပါဘဲနှင်းဆီ - အစိုဓာတ်လိုက်လျောညီထွေဖြစ်အောင်ဆက်စပ်သောမျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာထိုးထွင်းသိမြင်မှု"အမျိုးသားသိပ္ပံပြန်လည်ဆန်းစစ်ခြင်း, 2021 ;, NWab092;