cirgna sequencing- illumina
အင်္ဂါရပ်များ
●လမ်းခရီးစာကြည့်တိုက်ကြိုတင်ပြင်ဆင်မှုဖြင့်နောက်သို့ လိုက်. RRNA depletion သည်လမ်းလွဲချော်သောစာတန်းရေးအစီအစဉ်များကိုဖွင့်ထားသည်။
# ဇီဝဖာဂူဆန်လုပ်ငန်းခွင်ဖန် 0 င်စီးဆင်းမှုသည် Circna ခန့်မှန်းချက်နှင့်အသုံးအနှုန်းအရေအတွက်ကိုဖွင့်ပေးသည်
ဝန်ဆောင်မှုအားသာချက်များ
●ပိုမိုပြည့်စုံသော RNA စာကြည့်တိုက်များ:ကျွန်ုပ်တို့၏စာကြည့်တိုက်ကြိုတင်ပြင်ဆင်မှုတွင် Linear Rna ပျောက်ကွယ်သွားမည့်အစား RRNA ပျောက်ခြင်းအစား Sequencning data များသာမက MRNNNA နှင့် LNNNA နှင့် LNNNA တွင်ပါ 0 င်သည်
●ယှဉ်ပြိုင်နိုင်သည့် endogenous RNA (Cerna) ကွန်ယက်များကို optional ကိုခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း- လူလာစည်းမျဉ်းစည်းကမ်းများဖြစ်စေရန်ပိုမိုနက်ရှိုင်းသောထိုးထွင်းသိမြင်မှုကိုပေး
●ကျယ်ပြန့်ကျွမ်းကျင်မှု: BMKGENEN တွင်နမူနာ 20,000 ကျော်နမူနာ 20,000 ကျော်ကိုလမ်းကြောင်းပြောင်းခြင်းနှင့်အတူကွဲပြားခြားနားသောနမူနာအမျိုးအစားများနှင့် LNCNNA စီမံကိန်းများအတွက် spanning spanning spanning tries စီမံကိန်းများနှင့် LNCNNA စီမံကိန်းများအတွက်အတွေ့အကြုံကြွယ်ဝမှုကိုရရှိစေသည်။
●တိကျခိုင်မာသည့်အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုဖြေ - နမူနာနှင့်စာကြည့်တိုက်ကြိုတင်ပြင်ဆင်မှုများအနေဖြင့်အဆင့်ဆင့်နှင့်ဇီဝလောင်စာဆီမှအဆင့်ဆင့်တွင်အဓိကထိန်းချုပ်မှုများကိုကျွန်ုပ်တို့အကောင်အထည်ဖော်သည်။ ဤစေ့စပ်စောင့်ကြည့်လေ့လာခြင်းသည်အရည်အသွေးမြင့်မားသောရလဒ်များကိုပေးပို့ခြင်းကိုသေချာစေသည်။
●အရောင်းအ 0 ယ်ဖြေ - ကျွန်တော်တို့ရဲ့ကတိကဝတ်တွေကစီမံကိန်းပြီးစီးခဲ့တယ်။ ဤအချိန်အတောအတွင်းရလဒ်များနှင့်သက်ဆိုင်သောမေးမြန်းချက်များကိုဖြေရှင်းရန်စီမံကိန်းနောက်ဆက်တွဲ, မေးခွန်းများနှင့်မေးခွန်းများအတွက်စီမံကိန်းများအတွက်စီမံကိန်းများအတွက်စီမံကိန်းများပြုလုပ်ရန်,
နမူနာလိုအပ်ချက်များနှင့်ပေးပို့
| စာကြည့်တိုက် | ဇါတ်စင် | အကြံပြုဒေတာ | ဒေတာ QC |
| rrna deptleted direpleted directed စာကြည့်တိုက် | illumina pe150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
နမူနာလိုအပ်ချက်များ:
Nucleotides:
| အံဝင်။ (Ng / μl) | ပမာဏ (μg) | သန့်ရှင်းြရဲ | ပြည့်စုံခြင်း |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 ဂယ်လ်တွင်ပြသသည့်ကန့်သတ်ချက်သို့မဟုတ် DNA ညစ်ညမ်းမှုကိုပြသသည်။ | rin≥6.0; 5.0≥28s / 18s≥.0; ကန့်သတ်သို့မဟုတ်အဘယ်သူမျှမ baseline မြင့် |
●အပင်များ -
အမြစ်, stem သို့မဟုတ် petal: 450 မီလီဂရမ်
အရွက်သို့မဟုတ်မျိုးစေ့: 300 မီလီဂရမ်
သစ်သီး - 1.2 ဂရမ်
●တိရိစ္ဆာန်
နှလုံးသို့မဟုတ်အူ: 450 မီလီဂရမ်
viscera သို့မဟုတ် ဦး နှောက်: 240 မီလီဂရမ်
ကြွက်သား - 600 မီလီဂရမ်
အရိုး, ဆံပင်သို့မဟုတ်အရေပြား: 1.5G
● arropods:
အင်းဆက်ပိုးမွှားများ: 9g
Crustacea: 450 မီလီဂရမ်
●သွေးလုံး2 ပြွန်
●ဆဲလ်များ - 106 ဆဲလ်
●သွေးရည်ကြည်နှင့်ပလာစမာ: 6 ml
အကြံပြုနမူနာပေးပို့
ကွန်တိန်နာ - 2 ML Centrifuge Tube (Tin Fouls ကိုမထောက်ခံပါ)
နမူနာတံဆိပ်ကပ်ခြင်း - Group + Group + Supplicate ဥပမာ A1, A2, A3; B1, B2, B3 ။
တင်ပို့ခြင်း
1 ။ ခြောက်သွေ့သောရေခဲ - နမူနာများကိုအိတ်များဖြင့်ထုပ်ပိုးပြီးခြောက်သွေ့သောရေခဲများဖြင့်မြှုပ်နှံရန်လိုအပ်သည်။
2 ။ RNASTACE TUBES: RNA နမူနာများကို RNA နမူနာများ (ဥပမာ, rnastable®) တွင်ခြောက်သွေ့စေပြီးအခန်းအပူချိန်တွင်တင်ပို့နိုင်သည်။
ဝန်ဆောင်မှုအလုပ်စီးဆင်းမှု
စမ်းသပ်မှုဒီဇိုင်း
နမူနာပေးပို့
RNA ထုတ်ယူခြင်း
စာကြည့်တိုက်ဆောက်လုပ်ရေး
အစီအစဉ်
ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ
ရောင်းပြီးနောက် 0 န်ဆောင်မှုများ
ဇီဝလောင်စာ
Cirgna ခန့်မှန်းချက် - ခရိုမိုဆုန်းဖြန့်ဖြူးခြင်း
ကွဲပြားခြားနားသော CirCrnas - မီးတောင်ကြံစည်မှု
ကွဲပြားခြားနားသော CirCnas - အဆင့်ဆင့်စပျစ်သီးပြွတ်
Cirgna ၏အိမ်ရှင်ဗီဇကိုအလုပ်လုပ်တဲ့ကြွယ်ဝမှု
BMKGENE '' Cirgna 'Circrana sequencing 0 န်ဆောင်မှုများကိုကုသပေးသည့်စာပေများမှတစ်ဆင့် BMKGENENE's circrencing 0 န်ဆောင်မှုများကိုလေ့လာပါ။
ဝမ်, X. et al ။ (2021) 'CirCna ဖွဲ့စည်းရေးနှင့် Microsorna Mediated Gene Solcing) hepatocellular carcinoma တွင် mediorna mediated gene တိတ်ဆိတ်မှု', Oncogene 2021 40:25, 40 (25), PP ။ DOI: 10.1038 / S413888-021-01867-0-01867-0-01867-0-01867-0-01867-0-01867-0-01867-01-01867-0-01867-0-01867-01-01867-01-01867-01-01867-0-01867-01-01867-0
Xia, K. ET al ။ (2023) '' Oo-Retord Transcription သည် Phytopathology သုတေသန, 5 (1), PP တို့တွင်ရောဂါခံနိုင်ရည်ရှိသည့် RNA-RNO133 ၏အခန်းကဏ် of ကိုဖော်ပြသည်။ 1-14 ။ DOI: 10.1186 / s424883-023-0188-8 / ကိန်းဂဏန်းများ / 6 ။
y, H. et al ။ (2023) 'CPSF3 သည် hepatocellular carcinoma တွင်မြို့ပတ်ရထားနှင့် linear မှတ်တမ်းများချိန်ခွင်လျှာကိုပြုပြင်သည်။ DOI: 10.21203 / rs.3.rs-2418311 / v1 ။
zhang, y. et al ။ (2023) အသည်းဖောက်ဖျက်မီနှင့်အပြီးတွင်အပြည်ပြည်ဆိုင်ရာ immunophargety, 114, 114, 109495 ။ DOI: 10.1016 / j..intimp.22.109495 ။
