● Il-preparazzjoni tal-librerija tinkludi pass tal-għażla tad-daqs
● Analiżi bijoinformatika ċċentrata madwar it-tbassir tal-miRNA u l-miri tagħhom
●Analiżi komprensiva tal-bijoinformatika:Jippermetti l-identifikazzjoni ta 'miRNAs magħrufa u ġodda, identifikazzjoni ta' miri miRNAs, u annotazzjoni funzjonali korrispondenti u arrikkiment ma 'bażijiet tad-dejta multipli (KEGG, GO)
●Kontroll tal-kwalità rigoruż: Aħna nimplimentaw punti ta 'kontroll tal-qalba fl-istadji kollha, mill-preparazzjoni tal-kampjun u l-librerija għal sekwenzar u bijoinformatika. Dan il-monitoraġġ metikoluż jiżgura t-twassil ta 'riżultati ta' kwalità għolja b'mod konsistenti.
●Appoġġ ta 'wara l-bejgħ: L-impenn tagħna jestendi lil hinn mit-tlestija tal-proġett b'perjodu ta 'servizz ta' 3 xhur wara l-bejgħ. Matul dan iż-żmien, noffru segwitu tal-proġett, assistenza ta 'soluzzjoni ta' problemi, u sessjonijiet ta 'Q&A biex nindirizzaw kwalunkwe mistoqsija relatata mar-riżultati.
●Kompetenza estensiva: B'rekord ta 'għeluq b'suċċess fuq proġetti ta' SRNA multipli li jkopru aktar minn 300 speċi f'diversi oqsma ta 'riċerka, it-tim tagħna jġib ħafna esperjenza għal kull proġett.
Librerija | Pjattaforma | Dejta rrakkomandata | QC tad-dejta |
Daqs magħżul | Illumina SE50 | 10m-20m jaqra | Q30≥85% |
Nukleotidi:
Conc. (Ng / μl) | Ammont (μg) | Purità | Integrità |
≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Kontaminazzjoni limitata jew l-ebda proteina jew DNA murija fuq ġel. | Rin≥6.0; 5.0≥28s / 18S≥1.0; Limitu jew l-ebda elevazzjoni tal-linja bażi |
● Pjanti:
Għerq, zokk jew petal: 450 mg
Werqa jew żerriegħa: 300 mg
Frott: 1.2 g
● Animal:
Qalb jew Intestina: 450 mg
Viscera jew moħħ: 240 mg
Muskolu: 600 mg
Għadam, xagħar jew ġilda: 1.5g
● Artropodi:
Insetti: 9g
Crustacea: 450 mg
● demm sħiħ: 2 tubi
● Ċelloli: 106 ċelloli
● Serum u plażma:6 ml
Kontenitur: 2 ml centrifuge tubu (fojl tal-landa mhux irrakkomandat)
Tikkettar tal-kampjun: Grupp + replika eż. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Ġarr:
1. Silġ niexef: Il-kampjuni jeħtieġ li jiġu ppakkjati f'boroż u midfuna f'iklejka niexfa.
2. Tubi Rnastable: Kampjuni ta 'l-RNA jistgħu jitnixxfu fit-tubu ta' stabbilizzazzjoni ta 'RNA (eż. RNastable®) u mibgħuta fit-temperatura tal-kamra.
Bijoinformatika
● Kontroll tal-kwalità tad-dejta mhux ipproċessat
● Klassifikazzjoni SRNA
● Allinjament ma 'ġenoma ta' referenza
● Identifikazzjoni ta 'miRNA magħruf u ġdid
● Analiżi tal-espressjoni miRNA differenzjali
● Annotazzjoni funzjonali tal-miri miRNA
Identifikazzjoni ta 'miRNA: struttura u fond
Espressjoni differenzjali ta 'miRNA - raggruppament hieschical
Annotazzjoni funzjonali tal-mira ta 'miRNAs espressi b'mod differenti
Esplora l-avvanzi tar-riċerka ffaċilitati mis-servizzi ta 'sekwenzar ta' BMKGene 'SRNA permezz ta' ġabra kkurata ta 'pubblikazzjonijiet.
Chen, H. et al. (2023) "Infezzjonijiet virali jinibixxu l-bijosintesi tas-saponin u l-fotosintesi f'Panax notoginseng", Fiżjoloġija tal-Pjanti u Bijokimika, 203, p. 108038. Doi: 10.1016 / j.plaphy.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) "L-impjant FYVE li fih il-proteina Free1 jassoċja ma 'komponenti ta' mikroproċessur biex jirrapressa l-bijoġenesi miRNA", rapporti EMBO, 24 (1). doi: 10.15252 / EMBR.202255037 / suppl_file / EMBR202255037-SUP-0004-sdatafig4.tif.
Yu, J. et al. (2023) "Il-MicroRNA AME-Bantam-3P tikkontrolla l-iżvilupp tal-pupali tal-larva billi jimmira lejn il-fattur ta 'tkabbir epidermiku multipli li jixbah il-ġene 8 ġene (MEGF8) fil-honeybee, Apis mellifera", Ġurnal Internazzjonali tax-Xjenzi Molekulari, 24 (6 (6), p - 5726. Doi: 10.3390 / ijms24065726 / s1.
Zhang, M. et al. (2018) "Analiżi integrata ta 'miRNA u ġeni assoċjati mal-kwalità tal-laħam tiżvela li GGA-MIR-140-5P jaffettwa d-deposizzjoni ta' xaħam intramuskolari fit-tiġieġ", fiżjoloġija ċellulari u bijokimika, 46 (6), pp. 2421-2433. doi: 10.1159 / 000489649.