RNA żgħir

L-RNAs żgħar huma RNAs qosra li ma jikkodifikawx b'tul medju ta '18-30 nt, inklużi miRNA, siRNA u piRNA, li għandhom rwoli importanti fi proċessi regolatorji. Il-pipeline BMKCloud SRNA jipprovdi kemm analiżi standard kif ukoll apposta għall-identifikazzjoni tal-miRNA. Wara li tinqara t-tirqim u l-kontroll tal-kwalità, il-qari huma allinjati kontra bażijiet tad-dejta multipli biex jikklassifikaw l-SRNAs u jagħżlu miRNAs u mmappjati mal-ġenoma ta 'referenza. Il-miRNAs huma identifikati abbażi ta 'bażijiet tad-dejta magħrufa tal-miRNA, li jipprovdu informazzjoni dwar struttura sekondarja, familja miRNA u ġeni fil-mira. Analiżi tal-espressjoni differenzjali tidentifika miRNAs espressi b'mod differenti u l-ġeni fil-mira korrispondenti huma annotati funzjonalment biex isibu kategoriji arrikkiti.