Sekwenzar tat-Traskriptome ta' tul sħiħ ibbażat fuq nanopori
Is-sekwenzjar tan-Nanopore jiddistingwi ruħu minn pjattaformi oħra ta 'sekwenzjar, peress li n-nukleotidi jinqraw direttament mingħajr sintesi tad-DNA u jiġġenera qari fit-tul f'għexieren ta' kilobases. Dan jagħti s-setgħa lill-qari dirett tat-traskrizzjonijiet full-length u l-indirizzar tal-isfidi fl-istudji traskrittomiċi.
√ Preġudizzju baxx speċifiku għas-sekwenza
√ Qari fit-tul sħiħ tas-cDNA għal studji tal-istruttura tal-ġeni
√ Inqas data meħtieġa biex tkopri l-istess numru ta’ traskrizzjonijiet
√ Identifikazzjoni ta 'iżoformi multipli għal kull ġene
√ Kwantifikazzjoni ta 'espressjoni fuq livell ta' isoform
Pipeline Tipiku tal-Bijoinformatika
L-aħħar Każijiet ta' Suċċess b'Teknoloġiji Biomarker
1. Analiżi komparattivi tat-traskriptomi full-length jiżvelaw id-dinamika tal-iżvilupp taz-zokk tal-Gnetum luofuense
Ġurnal: Fruntieri fil-Ġenetika
Ippubblikat: Marzu 2021
Kliem ewlieni: MinION | Splicing alternattiv | APA | lncRNA | Traskrizzjonijiet espressi b'mod differenti
Aqra t-test sħiħ
2. Moviment unidirezzjonali ta 'RNAs żgħar minn rimjiet għal għeruq f'eterografts interspeċifiċi
Ġurnal: Pjanti Natura
Ippubblikat: Jannar 2021
Kliem ewlieni: Nanopore | Illumina | sejbien tal-mRNA mobbli fit-tul sħiħ
3. L-analiżi tat-traskriptome fit-tul sħiħ tal-għeruq tal-ispraġ tiżvela l-mekkaniżmu molekulari tat-tolleranza tal-melħ indotta minn fungi mikorriziċi arbuskulari
Ġurnal: Botanika Ambjentali u Sperimentali
Ippubblikat: Jannar 2021
Kliem ewlieni: MinION | Traskrizzjonijiet espressi b'mod differenzjali | Fatturi ta' traskrizzjoni | Splicing alternattiv
4. Bidliet fil-Karatteristiċi Fiżjoloġiċi u Transcriptome ta' Tul Sħiħ tal-Għeruq u Weraq tal-Warda (Rosa chinensis) b'reazzjoni għall-istress tan-nixfa
Ġurnal: Fiżjoloġija tal-Pjanti u taċ-Ċelloli
Ippubblikat: Ottubru 2020
Kliem ewlieni: PromethION | Traskrizzjonijiet espressi b'mod differenzjali | Tbassir funzjonali | Isoformi mqabbda | TF u lncRNA
5. Analiżi u paragun komprensiv ta 'PacBio u sekwenzar ta' RNA bbażat fuq nanopori tat-traskriptoma Arabidopsis
Ġurnal: Metodu tal-Pjanti
Ippubblikat: April 2020
Kliem ewlieni: GridION | PromethION | PacBio Sequel | Illumina NovaSeq | Allinjament tal-ġenoma | Identifikazzjoni tat-traskrizzjoni | Splicing alternattiv | SSR | LncRNA | Kwantifikazzjoni isoform
Aħbarijiet u Highlights għandu l-għan li jaqsam l-aħħar każijiet ta’ suċċess mat-Teknoloġiji tal-Bijomarker, li jinqabad kisbiet xjentifiċi ġodda kif ukoll tekniki prominenti applikati matul l-istudju.
Ħin tal-post: Jan-08-2022