Exclusive Agency for Korea

Bmkcloud log in

Prodotti

Sekwenzar metatranscriptome

Metatranscriptome sekwenzar immaġni dehru

Infissru t-teknoloġija tas-sekwenzar tal-Illumina, is-servizz ta 'sekwenzar metatranscriptome ta' BMKGene jiżvela l-espressjoni tal-ġene dinamika ta 'firxa diversa ta' mikrobi, mifruxa ewkarjoti għal prokarioti u viruses, f'ambjenti naturali bħal ħamrija, ilma, ilma, baħar, ippurgar, u l-imsaren. Is-servizz komprensiv tagħna jagħti s-setgħa lir-riċerkaturi biex jidħlu fi profili kompluti ta 'espressjoni tal-ġeni mikrobjali kumplessi. Lil hinn mill-analiżi tassonomika, is-servizz tas-sekwenzar metatranscriptome tagħna jiffaċilita l-esplorazzjoni f'arrikkiment funzjonali, jitfa 'dawl fuq ġeni espressi b'mod differenti u r-rwoli tagħhom. Skopri numru kbir ta 'għarfien bijoloġiku waqt li tinnaviga l-pajsaġġi kumplessi ta' espressjoni tal-ġeni, diversità tassonomika, u dinamika funzjonali f'dawn in-niċeċ ambjentali differenti.

Ikkuntattjana

Dettalji tas-Servizz

Bijoinformatika

Riżultati demo

Pubblikazzjonijiet dehru

Karatteristiċi tas-servizz

● Tnaqqis ta 'rRNA segwit minn preparazzjoni direzzjonali tal-librerija mRNA.

● Sekwenzar fuq Illumina Novaseq.

Vantaġġi tas-Servizz

●Studja l-bidliet ta 'komunitajiet mikrobjali kumplessi:Dan jiġri fil-livell traskrizzjonali u jesplora ġeni ġodda potenzjali.

●Li tispjega l-interazzjonijiet tal-komunità mikrobjali mal-ospitanti jew l-ambjent.

●Analiżi bijoinformatika komprensiva: Dan jipprovdi għarfien dwar kompożizzjonijiet tassonomiċi u funzjonali tal-komunità, kif ukoll analiżi ta 'espressjoni tal-ġeni differenzjali.

●Annotazzjoni estensiva tal-ġeni:Uża databases tal-funzjoni tal-ġene aġġornati għal informazzjoni informattiva għall-espressjoni tal-ġene tal-komunitajiet mikrobjali.

●Appoġġ ta 'wara l-bejgħ:L-impenn tagħna jestendi lil hinn mit-tlestija tal-proġett b'perjodu ta 'servizz ta' 3 xhur wara l-bejgħ. Matul dan iż-żmien, noffru segwitu tal-proġett, assistenza ta 'soluzzjoni ta' problemi, u sessjonijiet ta 'Q&A biex nindirizzaw kwalunkwe mistoqsija relatata mar-riżultati.

Speċifikazzjonijiet tas-Servizz

Pjattaforma tas-sekwenzar	Strateġija ta 'sekwenzar	Dejta rakkomandata	Kontroll tal-kwalità tad-dejta
Illumina Novaseq	PE150	12GB	Q30≥85%

Rekwiżiti tal-kampjun

Konċentrazzjoni (ng / µl)	Ammont totali (µg)	Volum (µL)	OD260 / 280	OD260 / 230	Rin
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Fluss tax-xogħol tas-servizz

Kunsinna tal-kampjun

Kostruzzjoni tal-librerija

Sekwenzar

Analiżi tad-Dejta

Servizzi ta 'wara l-bejgħ

Preċedenti: Assemblea tal-ġenoma fungali de novo

Li jmiss: Sekwenzar ta 'RNA prokarijot

Tinkludi l-analiżi li ġejja:

● Sekwenzar tal-Kontroll tal-Kwalità tad-Dejta

● Assemblea tat-traskrizzjoni

● Annotazzjoni u abbundanza tassonomika

● Annotazzjoni u abbundanza funzjonali

● Kwantifikazzjoni tal-espressjoni u analiżi differenzjali

Distribuzzjoni tassonomika ta 'kull kampjun:

Analiżi tad-Diversità Beta: UPGMA

Annotazzjoni funzjonali - mur abbundanza

Abbundanza ta 'Tassonomija Differenzjali - Lefse

Esplora l-avvanzi ffaċilitati mis-servizzi ta 'sekwenzar ta' meta transcriptomics ta 'BMKGene permezz ta' ġabra kkurata ta 'pubblikazzjonijiet.

Lu, Z. et al. (2023) "It-tolleranza tal-aċidu ta 'batterji li jużaw il-lactate ta' l-ordni batterojdi tikkontribwixxi għall-prevenzjoni ta 'aċidożi ruminali fil-mogħoż adattati għal dieta b'konċentrata għolja",Nutrizzjoni tal-Annimali, 14, pp. 130–140. doi: 10.1016 / j.aninu.2023.05.006.

Kanzunetta, Z. et al. (2017) "jinħallu l-mikrobijota funzjonali tal-qalba fil-fermentazzjoni tradizzjonali ta 'stat solidu permezz ta' amplikoni ta 'throughput għoli u sekwenzar ta' metatranscriptomics",Fruntieri fil-mikrobijoloġija, 8 (Jul). doi: 10.3389 / fmicb.2017.01294 / sħiħ.

Wang, W. et al. (2022) "Mycoviruses ġodda skoperti minn stħarriġ metatranscriptomics tal-fungus alternaria fitopatogeniku",Viruses, 14 (11), p. 2552. Doi: 10.3390 / v14112552 / s1.

Wei, J. et al. (2022) "Analiżi parallela ta 'metatranscriptome tiżvela degradazzjoni ta' metaboliti sekondarji tal-pjanti mill-ħanfus u s-simbionts tal-musrana tagħhom",Molekulari Ekoloġija, 31 (15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111 / mec.16557.