lncrna

RNAs twal mhux kodifikanti (lncRNA) huma RNAs itwal minn 200 nukleotide b'potenzjal baxx ta 'kodifikazzjoni iżda b'funzjonijiet regolatorji kritiċi. Il-pipeline tal-lncRNA BMKCloud huwa ddisinjat biex janalizza libreriji mdaħħla mill-rRNA b'ġenoma ta 'referenza ta' kwalità għolja u annotata sew, billi janalizza l-espressjoni tal-lncRNA u tal-mRNA flimkien. Wara t-tirqim tal-qari u l-kontroll tal-kwalità, il-qari huma allinjati mal-ġenoma ta 'referenza biex jinġabru traskrizzjonijiet, u l-analiżi sussegwenti tal-istruttura tal-ġeni tiżvela splicing alternattiv u ġeni ġodda. It-traskrizzjonijiet huma identifikati bħala mRNAs jew lncRNAs, u l-analiżi tal-espressjoni differenzjali tidentifika lncRNAs espressi b'mod differenzjali, il-miri tagħhom u l-ġeni espressi b'mod differenzjali (DEGS). Kemm DEGs kif ukoll miri lncRNA espressi b'mod differenzjat huma annotati funzjonalment biex isibu kategoriji funzjonali arrikkit.