Studju ta 'assoċjazzjoni mal-ġenoma kollu (GWAS) għandu l-għan li jidentifika varjanti ġenetiċi (ġenotip) li assoċjati ma' karatteristiċi speċifiċi (fenotip). Studji tal-GWA jinvestigaw markaturi ġenetiċi jaqsmu l-ġenoma kollu ta 'numru kbir ta' individwi u jbassru assoċjazzjonijiet ġenotip-fenotip permezz ta 'analiżi statistika fil-livell tal-popolazzjoni. Ir-risekwenzjar tal-ġenoma kollu jista' potenzjalment jiskopri l-varjanti ġenetiċi kollha. Flimkien ma 'dejta fenotipika, GWAS jista' jiġi pproċessat biex jidentifika SNPs, QTLs u ġeni kandidati relatati mal-fenotip, li jappoġġa bil-qawwa t-tnissil modern ta 'annimali/pjanti. SLAF hija strateġija ta 'sekwenzjar tal-ġenoma simplifikata żviluppata minnha nnifisha, li tiskopri markaturi distribwiti mal-ġenoma kollu, SNP. Dawn l-SNPs, bħala markaturi ġenetiċi molekulari, jistgħu jiġu pproċessati għal studji ta 'assoċjazzjoni b'karatteristiċi mmirati. Hija strateġija kost-effettiva fl-identifikazzjoni ta 'karatteristiċi kumplessi assoċjati varjazzjonijiet ġenetiċi.