Analiżi tal-mRNA ewkarjotika (bbażati fuq referenza u għażliet de novo disponibbli)
Din il-pipeline tuża d-dejta NGS RNA-seq bħala input u tipproduċi riżultati minn analiżi multipli downstream inklużi iżda mhux limitati għal: sekwenzar ta 'valutazzjoni tal-kwalità tad-dejta,de novoAnnotazzjoni tas-sit tat-traskrizzjoni, analiżi ta 'splicing varjabbli, analiżi ta' espressjoni differenzjali, annotazzjoni tal-funzjoni u analiżi ta 'arrikkiment.
Analiżi twila tal-RNA li ma tikkodifikax
L-RNAs twal li ma jikkodifikawx (lncRNA) huma traskrizzjonijiet li ma jikkodifikawx b'tulijiet itwal minn 200 nt u magħrufa li għandhom rwoli fl-organizzazzjoni u r-regolamentazzjoni tal-kromatina. Teknoloġiji ta 'sekwenzar b'rendiment għoli u bijoinformatiċi taw is-setgħa tas-sekwenzi ta' lncRNA tagħna u pożizzjonament biex jidentifikaw lncRNAs b'funzjonijiet regolatorji kruċjali. Dan il-pipeline jipprovdi analiżi ta 'lncRNA minbarra l-analiżi msemmija fil-pipeline tal-analiżi tal-mRNA ewkarjotika.
16S / 18S / Is-sekwenzar tal-amplicon tiegħu
Il-pipeline tal-analiżi tad-diversità mikrobjali tas-sekwenzar tal-amplicon ġie żviluppat abbażi ta 'snin ta' esperjenza fl-analiżi tal-proġett tad-diversità mikrobjali. Il-pipeline fih analiżi bażika standardizzata, li tkopri l-kontenut ta 'analiżi mainstream ta' riċerka mikrobjali attwali u analiżi personalizzata. Ir-rapport tal-analiżi huwa rikk u komprensiv, bl-għażla li twettaq analiżi personali diversa. Barra minn hekk, kampjuni u gruppi jistgħu jiġu modifikati fuq il-fly għal personalizzazzjoni u kontroll addizzjonali.
Analiżi tal-Metagenomics Shotgun
Il-pipeline tal-analiżi metagenomika tas-senter juża dejta NGS minn materjali ġenomiċi mħallta estratti minn kampjuni ambjentali. Analiżijiet inklużi jipprovdu informazzjoni dettaljata dwar id-diversità u l-abbundanza tal-ispeċi, l-istruttura tal-popolazzjoni, ir-relazzjoni filogenetika, il-ġeni funzjonali, u n-netwerks ta 'korrelazzjoni ma' fatturi ambjentali.
Analiżi tal-varjanti NGS-WGS
L-analiżi tal-varjanti NGS-WGS hija pipeline integrat ta 'skoperta ta' varjanti li twettaq kontroll tal-kwalità tad-dejta, allinjament tas-sekwenza, annotazzjoni, u analiżi tal-mutazzjoni tal-ġeni. Il-pipeline isegwi l-aħjar prattiki tal-gatk għall-iskoperta SNP u indel u juża manta għal sejħa ta 'varjant strutturali.
Studju ta 'Assoċjazzjoni Wide Genome (GWAS)
Il-pipeline GWAS hija analiżi downstream li tieħu fajls VCF iġġenerati qabel u dejta tal-fenotip korrispondenti għal koorti ta 'individwi bħala input. Bl-użu ta 'metodoloġiji statistiċi speċifiċi, GWAS għandu l-għan li jiskopri varjazzjonijiet ta' nukleotidi kollha tal-ġenoma korrelati ma 'differenzi fenotipiċi. Huwa għandu rwol kruċjali fl-esplorazzjoni tal-ġeni funzjonali assoċjati ma 'mard kumpless tal-bniedem u karatteristiċi kkomplikati fil-pjanti u l-annimali.
Analiżi tas-Segregazzjoni Bulk (BSA)
L-analiżi tal-BSA tinvolvi l-ġabra ta 'individwi b'karatteristiċi fenotipiċi estremi minn popolazzjoni li tissepara. Billi tqabbel loci differenzjali bejn il-kampjuni miġbura, dan l-approċċ jidentifika malajr markers marbuta mill-qrib assoċjati mal-ġeni fil-mira. Użat ħafna fl-immappjar ġenetiku tal-pjanti u l-annimali, hija għodda siewja għat-tgħammir assistit mill-markatur.
Analiżi tal-ġenetika evoluzzjonarja
Il-fluss tax-xogħol tal-analiżi tal-ġenetika evoluzzjonarja jħaddem l-esperjenza estensiva ta 'BMKGene fi proġetti ta' evoluzzjoni ġenetika u jinkludi kostruzzjoni ta 'siġar filogenetiċi, analiżi ta' żbilanċ ta 'konnessjoni, valutazzjoni tad-diversità ġenetika, identifikazzjoni selettiva tal-knis, analiżi ta' parentela, analiżi tal-komponenti prinċipali, u karatterizzazzjoni ta 'struttura tal-popolazzjoni.
