Ġenetika Evoluttiva

Studji ġenetiċi evoluzzjonarji għandhom l-għan li jifhmu t-trajettorja evoluzzjonarja tal-popolazzjonijiet li jużaw informazzjoni dwar il-polimorfiżmu f'sekwenzi ġenomiċi. Il-pipeline BMKCloud Evolutionary Genetics huwa ddisinjat biex janalizza dejta tal-WGS jew tal-Framment Ammplifikat tal-Locus Specific (SLAF) minn popolazzjonijiet kbar. Wara l-kontroll tal-kwalità tad-dejta mhux ipproċessata, il-qari huma allinjati mal-ġenoma ta 'referenza u jissejħu varjanti. Il-pipeline jinkludi kostruzzjoni ta 'siġar filoġenetika, analiżi tal-komponenti prinċipali (PCA), analiżi tal-istruttura tal-popolazzjoni, diżequilibri ta' rabta (LD), analiżi selettiva tal-knis, u analiżi tal-ġeni kandidati.