Is-sekwenzar tal-mRNA ewkarjotiku-INGs
Karatteristiċi
● Qbid ta 'Poly mRNA qabel il-preparazzjoni tal-librerija
● Preparazzjoni tal-librerija mRNA direzzjonali mhux obbligatorja biex tippermetti li tinkiseb dejta tas-sekwenzar speċifika għall-linja
● Analiżi bijoinformatika tal-espressjoni tal-ġeni u l-istruttura tat-traskrizzjoni
Vantaġġi
●Kompetenza estensiva: It-tim tagħna pproċessa aktar minn 600,000 kampjun fi BMKGene, mifrux tipi ta 'kampjuni differenti bħal kulturi taċ-ċelloli, tessuti, u fluwidi tal-ġisem. Aħna nġibu rikkezza ta 'esperjenza għal kull proġett u tlestew b'suċċess aktar minn 100,000 proġett mRNA-seq f'diversi oqsma ta' riċerka.
●Kontroll tal-kwalità rigoruż: Aħna nimplimentaw punti ta 'kontroll tal-qalba fl-istadji kollha, mill-preparazzjoni tal-kampjun u l-librerija għal sekwenzar u bijoinformatika. Dan il-monitoraġġ metikoluż jiżgura l-konsenja ta 'riżultati ta' kwalità għolja b'mod konsistenti, u jiżgura li l-proġett tiegħek jinsab f'idejn affidabbli.
●Annotazzjoni komprensiva: Aħna nużaw bażijiet tad-dejta multipli biex jannotaw funzjonalment il-ġeni espressi b'mod differenti (DEGs) u jwettqu analiżi ta 'arrikkiment korrispondenti. Dan l-approċċ komprensiv jipprovdi għarfien dwar il-proċessi ċellulari u molekulari li fuqhom huma bbażati r-rispons tat-traskrizzjoni, li jiżgura li int infurmat bis-sħiħ dwar ir-riżultati tal-proġett tiegħek.
●Appoġġ ta 'wara l-bejgħ: L-impenn tagħna jestendi lil hinn mit-tlestija tal-proġett b'perjodu ta 'servizz ta' 3 xhur wara l-bejgħ. Matul dan iż-żmien, noffru segwitu tal-proġett, assistenza ta 'soluzzjoni ta' problemi, u sessjonijiet ta 'Q&A biex nindirizzaw kwalunkwe mistoqsija relatata mar-riżultati.
Rekwiżiti tal-kampjun u kunsinna
| Librerija | Strateġija ta 'sekwenzar | Dejta rakkomandata | Kontroll tal-kwalità |
| Poly A arrikkit | Illumina PE150 DnbSeq-T7 | 6 -10 GB | Q30≥85% |
Rekwiżiti tal-Kampjun:
Nukleotidi:
| Conc. (Ng / μl) | Ammont (μg) | Purità | Integrità | |
| Librerija standard | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Kontaminazzjoni limitata jew l-ebda proteina jew DNA murija fuq ġel. | Għall-pjanti: Rin≥4.0; Għall-annimali: Rin≥4.5; 5.0≥28s / 18S≥1.0; Limitu jew l-ebda elevazzjoni tal-linja bażi |
| Librerija direzzjonali | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Kontaminazzjoni limitata jew l-ebda proteina jew DNA murija fuq ġel. | Għall-pjanti: Rin≥4.0; Għall-annimali: Rin≥4.5; 5.0≥28s / 18S≥1.0; Limitu jew l-ebda elevazzjoni tal-linja bażi |
● Pjanti:
Għerq, zokk jew petal: 450 mg
Werqa jew żerriegħa: 300 mg
Frott: 1.2 g
●Annimal:
Qalb jew Intestina: 300 mg
Viscera jew moħħ: 240 mg
Muskolu: 450 mg
Għadam, Xagħar jew Ġilda: 1G
● Artropodi:
Insetti: 6g
Crustacea: 300 mg
● demm sħiħ: 1 tubu
● ċelloli: 106 ċelloli
Twassil tal-kampjun rakkomandat
Kontenitur: 2 ml centrifuge tubu (fojl tal-landa mhux irrakkomandat)
Tikkettar tal-kampjun: Grupp + replika eż. A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Ġarr:
1. Silġ niexef: Il-kampjuni jeħtieġ li jiġu ppakkjati f'boroż u midfuna f'iklejka niexfa.
2. Tubi tal-mejda RNAs: Kampjuni ta 'l-RNA jistgħu jitnixxfu fit-tubu ta' stabbilizzazzjoni ta 'RNA (eż. RNastable®) u mibgħuta fit-temperatura tal-kamra.
Fluss tax-xogħol tas-servizz
Disinn ta 'Esperiment
Kunsinna tal-kampjun
Estrazzjoni tal-RNA
Kostruzzjoni tal-librerija
Sekwenzar
Analiżi tad-Dejta
Servizzi ta 'wara l-bejgħ
Bijoinformatika
Ewkarjotiku Analiżi tas-Sekwenzar tal-MRNA Fluss tax-Xogħol
Bijoinformatika
ØKontroll tal-kwalità tad-dejta mhux maħdum
ØAllinjament tal-ġenoma ta 'referenza
ØAnaliżi tal-istruttura tat-traskrizzjoni
ØKwantifikazzjoni tal-espressjoni
ØAnaliżi tal-espressjoni differenzjali
ØFunzjoni ta 'annotazzjoni u arrikkiment
Allinjament tal-ġenoma ta 'referenza
Saturazzjoni tad-dejta
Korrelazzjoni tal-kampjun u valutazzjoni tar-repliki bijoloġiċi
Ġeni espressi b'mod differenti (DEGs)
Annotazzjoni funzjonali ta 'DEGs
Arrikkiment funzjonali ta 'DEGs
Esplora l-avvanzi ffaċilitati mis-servizzi ta 'sekwenzar ta' mRNA NGS ta 'BMKGene permezz ta' kollezzjoni kkurata ta 'pubblikazzjonijiet.
Huang, L. et al. (2023) "Triclosan u Triclocarban idgħajfu l-kapaċità li tinxtamm ta 'goldfish billi tillimita r-rikonoxximent ta' l-odorant, tfixkel it-transduzzjoni ta 'sinjal li jinxtamm, u tfixkel l-ipproċessar ta' informazzjoni li tinxtamm", riċerka dwar l-ilma, 233, p. 119736. Doi: 10.1016 / j.watres.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) "Aspergillus fumigatus hijacks umana p11 biex tidderieġi l-fagożomi li fihom fungali għal mogħdija mhux degradattiva", Cell Host & Microbe, 31 (3), pp. 373-388.e10. doi: 10.1016 / j.chom.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) "Fatturi ta 'traskrizzjoni TCP involuti fl-iżvilupp ta' rimja ta 'MA bambu (Dendrocalamus latiflorus Munro)", Frontiers in Plant Science, 13, p. 884443. Doi: 10.3389 / fpls.2022.884443 / bibtex.
Wen, X. et al. (2022) "Il-ġenoma tal-chrysanthemum lavandulifolium u l-mekkaniżmu molekulari sottostanti għal tipi ta 'kapitulum differenti", Ortikultura Riċerka, 9. DOI: 10.1093 / hr / uhab022.
Zhang, Yujie et al. (2023) "Nanoreatur tal-kaskata għat-titjib tat-terapija sonodinamika fuq il-kanċer tal-kolorektum permezz ta 'Ros Sinerġistika u l-imblukkar tal-awtofagija", Nano Today, 49, p. 101798. Doi: 10.1016 / j.nantod.2023.101798.
