●Pjattaforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Modi ta 'sekwenzar:PE150
●Trasferiment ta 'Libreriji Illumina għalMgi:Jippermetti sekwenzar ta 'volumi ta' dejta għoljin bi prezz baxx.
●Kontroll tal-kwalità tal-libreriji qabel is-sekwenzar.
●Dejta tas-sekwenzar QC u Kunsinna:Il-konsenja tar-rapport QC u d-dejta mhux maħduma f'format FASTQ wara d-demultiplexing u l-filtrazzjoni Q30 taqra.
●Versatilità tas-servizzi tas-sekwenzar:Il-klijent jista 'jagħżel li sekwenza permezz ta' karreġġjata jew ammont ta 'dejta.
●Output għoli tad-dejta:1500 GB / Lane
●Twassil tar-Rapport QC tas-Sekwenzar:b'metriċi ta 'kwalità, eżattezza tad-dejta u prestazzjoni ġenerali tal-proġett ta' sekwenzar.
●Proċess ta 'sekwenzar matur:bi żmien qasir ta 'dawran.
●Kontroll tal-kwalità rigoruż: Aħna nimplimentaw rekwiżiti QC stretti biex niggarantixxu l-konsenja ta 'riżultati ta' kwalità għolja b'mod konsistenti.
Ammont tad-dejta (x) | Konċentrazzjoni (qPCR / nm) | Volum | |
Karreġġjata parzjali
| X ≤ 10 GB | ≥ 1nm | ≥ 25 μl |
10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
X> 100 GB | ≥ 4 nm | ||
Karreġġjata waħda | Kull karreġġjata | ≥ 1.5 nm / ġabra tal-librerija | ≥ 25 μl / ġabra tal-librerija |
Minbarra l-konċentrazzjoni u l-ammont totali, huwa meħtieġ ukoll disinn tal-quċċata xierqa.
Nota: Is-sekwenzar tal-karreġġjata ta 'libreriji ta' diversità baxxa teħtieġ li Phix Spike-in biex tiżgura sejħa bażi robusta.
Nirrakkomandaw li tissottometti libreriji mgħottija minn qabel bħala kampjuni. Jekk teħtieġ bmkgene biex twettaq ġabra ta 'librerija, jekk jogħġbok irreferi għal
Rekwiżiti tal-librerija għal sekwenzar parzjali tal-karreġġjata.
Il-quċċata ewlenija għandha tkun fi ħdan 300-450 bp.
Il-libreriji għandu jkollhom quċċata ewlenija waħda, l-ebda kontaminazzjoni tal-adapter u l-ebda dimers tal-primer.
Rapport dwar il-kwalità tal-librerija huwa pprovdut qabel is-sekwenzar, il-valutazzjoni tal-ammont tal-librerija, u l-frammentazzjoni.
Tabella 1. Statistika dwar id-dejta tas-sekwenzar.
ID tal-kampjun | Bmkid | RAW jaqra | Dejta prima (BP) | Nadif jaqra (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuzzjoni tal-kwalità tul taqra f'kull kampjun
Figura 2. Distribuzzjoni tal-kontenut tal-bażi
Figura 3. Distribuzzjoni tal-kontenut tal-qari fid-dejta tas-sekwenzar