Illumina libreriji magħmula minn qabel
Karatteristiċi
●Pjattaformi:Illumina Novaseq 6000 u Novaseq X Plus
●Modi ta 'sekwenzar:PE150 u PE250
●Kontroll tal-kwalità tal-libreriji qabel is-sekwenzar
●Dejta tas-sekwenzar QC u Kunsinna:Kunsinna ta 'rapport QC u dejta mhux maħduma f'format FASTQ wara d-demultiplexing u l-filtrazzjoni Q30 Reads
Vantaġġi tas-Servizz
●Versatilità tas-servizzi tas-sekwenzar:Il-klijent jista 'jagħżel li jsegwi permezz ta' karreġġjata, ċellola tal-fluss, jew b'ammont ta 'dejta meħtieġa (sekwenzar parzjali tal-karreġġjata).
●Esperjenza estensiva fuq pjattaforma ta 'sekwenzar Illumina:B'eluf ta 'proġetti magħluqa b'diversi speċi.
●Twassil tar-Rapport QC tas-Sekwenzar:b'metriċi ta 'kwalità, eżattezza tad-dejta u prestazzjoni ġenerali tal-proġett ta' sekwenzar.
●Proċess ta 'sekwenzar matur:bi żmien qasir ta 'dawran.
●Kontroll tal-kwalità rigoruż: Aħna nimplimentaw rekwiżiti QC stretti biex niggarantixxu l-konsenja ta 'riżultati ta' kwalità għolja b'mod konsistenti.
Pjattaformi tal-kampjun
| Pjattaforma | Ċellola tal-fluss | Mod ta 'sekwenzar | Unità | Output stmat |
| Novaseq x | 10b (8 karreġġjati) | PE150 | Karreġġjata waħda Karreġġjata parzjali | 375GB / Lane |
| 25b (8 karreġġjati) | PE150 | Karreġġjata waħda Karreġġjata parzjali | 1000 GB / karreġġjata | |
| Novaseq 6000 | Ċellola tal-fluss SP (2 karreġġjati) | PE250 | Ċellola tal-fluss Karreġġjata waħda Karreġġjata parzjali | 325-400 m jaqra / karreġġjata |
| Ċellola tal-fluss S4 (4 karreġġjati) | PE150 | Ċellola tal-fluss Karreġġjata waħda Karreġġjata parzjali | ~ 800 GB / Lane |
Rekwiżiti tal-kampjun
| Ammont tad-dejta (x) | Konċentrazzjoni (qPCR / nm) | Volum | |
| Sekwenzar parzjali tal-karreġġjata
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Sekwenzar tal-karreġġjata | Kull karreġġjata | ≥ 1.5 nm / ġabra tal-librerija | ≥ 25 μl / ġabra tal-librerija |
Minbarra l-konċentrazzjoni u l-ammont totali, huwa meħtieġ ukoll disinn tal-quċċata xierqa.
Nota: Is-sekwenzar tal-karreġġjata ta 'libreriji ta' diversità baxxa teħtieġ li Phix Spike-in biex tiżgura sejħa bażi robusta.
Nirrakkomandaw li tissottometti libreriji mgħottija minn qabel bħala kampjuni. Jekk teħtieġ bmkgene biex twettaq ġabra ta 'librerija, jekk jogħġbok irreferi għal
Ir-rekwiżiti tal-librerija għal sekwenzar parzjali tal-karreġġjata.
Daqs tal-Librerija (mappa tal-quċċata)
Il-quċċata ewlenija għandha tkun fi ħdan 300-450 bp.
Il-libreriji għandu jkollhom quċċata ewlenija waħda, l-ebda kontaminazzjoni tal-adapter u l-ebda dimers tal-primer.
Jekk jogħġbok aqbad lilna jekk il-kampjuni tiegħek ma jissodisfawx ir-rekwiżiti tal-materjal tal-bidu.
Fluss tax-xogħol tas-servizz
Kontroll tal-kwalità tal-librerija
Sekwenzar
Kontroll tal-kwalità tad-dejta
Kunsinna tal-proġett
Rapport tal-Librerija QC
Rapport dwar il-kwalità tal-librerija huwa pprovdut qabel is-sekwenzar, il-valutazzjoni tal-ammont tal-librerija, u l-frammentazzjoni.
RAPPORT QC SEKENZJAR
Tabella 1. Statistika dwar id-dejta tas-sekwenzar.
| ID tal-kampjun | Bmkid | RAW jaqra | Dejta prima (BP) | Nadif jaqra (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuzzjoni tal-kwalità tul taqra f'kull kampjun
Figura 2. Distribuzzjoni tal-kontenut tal-bażi
Figura 3. Distribuzzjoni tal-kontenut tal-qari fid-dejta tas-sekwenzar
