CircRNA Sequencing-Illumina
Karatteristiċi
● Tnaqqis ta 'rRNA segwit minn preparazzjoni ta' librerija direzzjonali, li tippermetti data ta 'sekwenzar speċifika għall-linja.
● Il-fluss tax-xogħol bijoinformatiku jippermetti tbassir taċ-ċirku u kwantifikazzjoni tal-espressjoni
Vantaġġi tas-Servizz
●Libreriji RNA aktar komprensivi:Aħna nużaw it-tnaqqis tal-rRNA minflok it-tnaqqis tal-RNA lineari fil-preparazzjoni pre-librarja tagħna, billi niżguraw li d-dejta tas-sekwenzar tinkludi mhux biss circRNA iżda wkoll mRNA u lncRNA, li tippermetti analiżi konġunta ta 'dawn is-settijiet tad-dejta
●Analiżi fakultattiva ta 'netwerks ta' RNA endoġenu kompetittiv (CERNA): Provvista ta 'għarfien aktar profond dwar mekkaniżmi regolatorji ċellulari
●Kompetenza estensiva: B'rekord ta 'proċessar ta' aktar minn 20,000 kampjun f'BMKGene, mifruxa ta 'tipi ta' kampjuni differenti u proġetti ta 'lncRNA, it-tim tagħna jġib numru kbir ta' esperjenza għal kull proġett.
●Kontroll tal-kwalità rigoruż: Aħna nimplimentaw punti ta 'kontroll tal-qalba fl-istadji kollha, mill-preparazzjoni tal-kampjun u l-librerija għal sekwenzar u bijoinformatika. Dan il-monitoraġġ metikoluż jiżgura t-twassil ta 'riżultati ta' kwalità għolja b'mod konsistenti.
● Appoġġ ta 'wara l-bejgħ: L-impenn tagħna jestendi lil hinn mit-tlestija tal-proġett b'perjodu ta 'servizz ta' 3 xhur wara l-bejgħ. Matul dan iż-żmien, noffru segwitu tal-proġett, assistenza ta 'soluzzjoni ta' problemi, u sessjonijiet ta 'Q&A biex nindirizzaw kwalunkwe mistoqsija relatata mar-riżultati.
Rekwiżiti tal-kampjun u kunsinna
| Librerija | Pjattaforma | Dejta rrakkomandata | QC tad-dejta |
| RRNA Librerija Direzzjonali mdgħajfa | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Rekwiżiti tal-Kampjun:
Nukleotidi:
| Conc. (Ng / μl) | Ammont (μg) | Purità | Integrità |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Kontaminazzjoni limitata jew l-ebda proteina jew DNA murija fuq ġel. | Rin≥6.0; 5.0≥28s / 18S≥1.0; Limitu jew l-ebda elevazzjoni tal-linja bażi |
● Pjanti:
Għerq, zokk jew petal: 450 mg
Werqa jew żerriegħa: 300 mg
Frott: 1.2 g
● Animal:
Qalb jew Intestina: 450 mg
Viscera jew moħħ: 240 mg
Muskolu: 600 mg
Għadam, xagħar jew ġilda: 1.5g
● Artropodi:
Insetti: 9g
Crustacea: 450 mg
● demm sħiħ:2 tubi
● Ċelloli: 106 ċelloli
● Serum u plażma: 6 ml
Twassil tal-kampjun rakkomandat
Kontenitur: 2 ml centrifuge tubu (fojl tal-landa mhux irrakkomandat)
Tikkettar tal-kampjun: Grupp + replika eż. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Ġarr:
1. Silġ niexef: Il-kampjuni jeħtieġ li jiġu ppakkjati f'boroż u midfuna f'iklejka niexfa.
2. Tubi Rnastable: Kampjuni ta 'l-RNA jistgħu jitnixxfu fit-tubu ta' stabbilizzazzjoni ta 'RNA (eż., RNastable®) u mibgħuta f'temperatura tal-kamra.
Fluss tax-xogħol tas-servizz
Disinn ta 'Esperiment
Kunsinna tal-kampjun
Estrazzjoni tal-RNA
Kostruzzjoni tal-librerija
Sekwenzar
Analiżi tad-Dejta
Servizzi ta 'wara l-bejgħ
Bijoinformatika
Tbassir taċ-circRNA: distribuzzjoni kromożomika
CircRNAs espressi b'mod differenti - plott tal-vulkan
CircRNAs espressi b'mod differenti - raggruppament ġerarkiku
Arrikkiment funzjonali tal-ġeni ospitanti taċ-circRNA
Esplora l-avvanzi tar-riċerka ffaċilitati mis-servizzi ta 'sekwenzar ta' circRNA BMKGene permezz ta 'kollezzjoni kkurata ta' pubblikazzjonijiet.
Wang, X. et al. (2021) "CPSF4 jirregola l-formazzjoni ta 'circRNA u s-silenzju tal-ġene medjat mill-microRNA fil-karċinoma epatoċellulari", Oncogene 2021 40:25, 40 (25), pp. 4338-4351. doi: 10.1038 / s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) "X traskriżomi li jirrispondu OO jiżvela r-rwol ta 'l-RNA133 ċirkolari fir-reżistenza għall-marda billi tirregola l-espressjoni ta' esarab fir-ross", riċerka tal-fitopatoloġija, 5 (1), pp. 1-14. doi: 10.1186 / s42483-023-00188-8 / figuri / 6.
Y, H. et al. (2023) "CPSF3 jimmodula l-bilanċ ta 'traskrizzjonijiet ċirkulari u lineari f'karċinoma epatoċellulari". doi: 10.21203 / rs.3.rs-2418311 / v1.
Zhang, Y. et al. (2023) "Evalwazzjoni komprensiva ta 'circRNAs fil-kardjomijopatija ċirrotika qabel u wara t-trapjant tal-fwied", Immunofarmakoloġija Internazzjonali, 114, p. 109495. Doi: 10.1016 / j.intimp.2022.109495.
