
Circrna
L-RNA ċirkulari (circRNAs) huma RNAs li ma jikkodifikawx li jiffurmaw strutturi ċirkulari u għandhom rwoli regolatorji multipli, inkluż li jikkompetu ma 'miRNA għal ġeni fil-mira u li jorbtu l-proteini. Il-pipeline BMKCloud circRNA huwa ddisinjat għall-analiżi tal-libreriji mdgħajfa ta 'rRNA b'ġenoma ta' referenza ta 'kwalità għolja u ta' kwalità għolja. L-analiżi tibda bit-tirqim tal-qari u l-kontroll tal-kwalità, segwit minn allinjament tal-qari mal-ġenoma ta 'referenza u t-tbassir ta' circRNAs ġodda, flimkien ma 'l-identifikazzjoni ta' circRNAs magħrufa minn databases. Sussegwentement il-miri korrispondenti tal-miRNA u l-ospiti taċ-circRNA huma identifikati. Analiżi tal-espressjoni differenzjali tiżvela circRNAs espressi b'mod differenti, u l-ospiti korrispondenti huma annotati funzjonalment biex jiġu estratti funzjonijiet bijoloġiċi arrikkiti.
Bijoinformatika
