16S / 18S / Amplicon-Sequencing-IS-NGs
Karatteristiċi tas-servizz
● Pjattaforma tas-sekwenzar: Illumina Novaseq.
● Amplifikazzjoni ta 'reġjuni qosra ta' 16S, 18S u ITS, fost miri oħra ta 'amplifikazzjoni.
● Għażliet flessibbli ta 'amplicon.
● Esperjenza ta 'proġett preċedenti b'miri ta' amplifikazzjoni multipli.
Vantaġġi tas-Servizz
●Ħieles mill-iżolament:Identifikazzjoni rapida tal-kompożizzjoni mikrobjali f'kampjuni ambjentali.
●Riżoluzzjoni għolja: F'komponenti ta 'abbundanti baxxi f'kampjuni ambjentali.
●Applikabbli ħafna: Studji differenti tal-komunità mikrobjali.
●Analiżi bijoinformatika komprensiva: L-aħħar pakkett QIIME2 (għarfien kwantitattiv fl-ekoloġija mikrobjali) b'analiżi differenti f'termini ta 'database, annotazzjoni, OTU / ASV.
●Kompetenza estensiva: B'150 elf proġett ta 'sekwenzar ta' amplicon imwettaq kull sena, BMKGene ġġib aktar minn għaxar snin ta 'esperjenza, tim ta' analiżi b'ħiliet għolja, kontenut komprensiv, u appoġġ eċċellenti ta 'wara l-bejgħ.
Speċifikazzjonijiet tas-Servizz
| Librerija | Strateġija ta 'sekwenzar | Dejta rakkomandata |
| Amplicon | Illumina PE250 | Tikketti 50/100 / 300K (aqra l-pari) |
Rekwiżiti tas-Servizz
| Konċentrazzjoni (ng / µl) | Ammont Totali (NG) | Volum (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Ħamrija / ħama: 1-2g
● Kontenut intestinali-annimali: 0.5-2g
● Kontenut intestinali-insett: 0.1-0.25g
● wiċċ tal-pjanti (sediment arrikkit): 0.1-0.5g
● Sediment arrikkit tal-brodu tal-fermentazzjoni): 0.1-0.5g
● Ħarġa (annimali kbar): 0.5-2g
● Frar (ġurdien): 3-5grains
● Fluwidu tal-ħasil alveolari pulmonari: karta tal-filtru
● Swab vaġinali: 5-6 tampuni
● Ġilda / swab ġenitali / bżieq / tessut artab orali / swab tal-farinġi / swab rettali: 2-3 tampuni
● Mikroorganiżmi tal-wiċċ: karta tal-filtru
● Waterbody / arja / bijofilm: karta tal-filtru
● Endofiti: 1-2g
● Plakka Dentali: 0.5-1g
Fluss tax-xogħol tas-servizz
Kunsinna tal-kampjun
Kostruzzjoni tal-librerija
Sekwenzar
Analiżi tad-Dejta
Servizzi ta 'wara l-bejgħ
Tinkludi l-analiżi li ġejja:
- Kontroll tal-kwalità tad-dejta mhux maħdum
- OTU Clustering / De-Noise (ASV)
- Annotazzjoni OTU
- Analiżi tad-Diversità Alpha: Indiċi multipli, inklużi Shannon, Simpson u Ace.
- Analiżi tad-Diversità Beta
- Analiżi bejn il-gruppi
- Analiżi tal-Korrelazzjoni: Bejn il-Fatturi Ambjentali u l-Kompożizzjoni u d-Diversità
- Tbassir tal-ġene funzjonali 16S
Istogramma tad-distribuzzjoni tassonomika
abbundanza tassonomika raggruppament mappa tas-sħana
Analiżi tad-Diversità Alpha: Kurva tar-razza
Analiżi tad-Diversità Beta: NMDs
Analiżi tal-Intergroup: Lefse Biomarker Discovery
Esplora l-avvanzi ffaċilitati mis-servizzi ta 'sekwenzar ta' Amplicon ta 'BMKGene ma' Illumina permezz ta 'ġabra kkurata ta' pubblikazzjonijiet.
Dong, C. et al. (2022) "Assemblaġġ, mikrobijota tal-qalba, u funzjoni tal-ħamrija tar-rizosfera u mikrobijota tal-qoxra fl-Eucommia Ulmoides", Frontiers in Microbiology, 13. DOI: 10.3389 / FMICB.2022222.855317 / sħiħ.
Li, Y. et al. (2023) "trapjant ta 'konsorzji batteriċi sintetiċi għat-trattament ta' vaginosis batterika indotta minn Gardnerella vaginalis fil-ġrieden", mikrobioma, 11 (1), pp. 1-14. doi: 10.1186 / s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. u Liu, H. (2022) "Mikrobiomi ta 'trab ta' l-arja miġbura waqt l-esperiment ta 'appoġġ bijoregenerattiv magħluq fuq l-art" Palazz Lunar 365 "", Mikrobiomi Ambjentali, 17 (1), pp. 1-20. doi: 10.1186 / s40793-022-00399-0 / figuri / 8.
Yin, S. et al. (2022) "Abbundanza li tiddependi fuq il-materja prima ta 'ġeni funzjonali relatati mat-trasformazzjoni tan-nitroġenu kkontrollata minn telf ta' nitroġenu fil-kompost", teknoloġija Bioresource, 361, p. 127678. Doi: 10.1016 / j.biortech.2022.127678.
