Penjujukan RNA Kecil-Illumina
Ciri-ciri
● Penyediaan perpustakaan termasuk langkah pemilihan saiz
● Analisis bioinformatik tertumpu pada ramalan miRNA dan sasarannya
Kelebihan Perkhidmatan
●Analisis bioinformatik yang komprehensif:Mendayakan pengenalpastian kedua-dua miRNA yang diketahui dan baru, pengenalpastian sasaran miRNA, dan anotasi dan pengayaan fungsi yang sepadan dengan pelbagai pangkalan data (KEGG, GO)
●Kawalan Kualiti yang Teguh: Kami melaksanakan titik kawalan teras merentas semua peringkat, daripada penyediaan sampel dan perpustakaan kepada penjujukan dan bioinformatik. Pemantauan yang teliti ini memastikan penyampaian hasil yang berkualiti tinggi secara konsisten.
●Sokongan Selepas Jualan: Komitmen kami melangkaui penyiapan projek dengan tempoh perkhidmatan selepas jualan selama 3 bulan. Pada masa ini, kami menawarkan susulan projek, bantuan penyelesaian masalah dan sesi Soal Jawab untuk menangani sebarang pertanyaan yang berkaitan dengan keputusan.
●Kepakaran Luas: Dengan rekod prestasi berjaya menutup beberapa projek sRNA yang meliputi lebih 300 spesies dalam pelbagai domain penyelidikan, pasukan kami membawa banyak pengalaman kepada setiap projek.
Keperluan Sampel dan Penghantaran
| Perpustakaan | Platform | Data yang disyorkan | QC Data |
| Saiz dipilih | Illumina SE50 | Bacaan 10M-20M | S30≥85% |
Keperluan Sampel:
Nukleotida:
| Conc.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kesucian | Integriti |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pencemaran protein atau DNA terhad atau tiada ditunjukkan pada gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; terhad atau tiada ketinggian garis dasar |
● Tumbuhan:
Akar, Batang atau Kelopak: 450 mg
Daun atau Biji: 300 mg
Buah: 1.2 g
● Haiwan:
Jantung atau Usus: 450 mg
Viscera atau Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1.5g
● Artropod:
Serangga: 9g
Crustacea: 450 mg
● Darah penuh: 2 tiub
● Sel: 106 sel
● Serum dan Plasma:6 mL
Penghantaran Sampel yang Disyorkan
Bekas: 2 ml tiub empar (Kerajang timah tidak disyorkan)
Pelabelan sampel: Kumpulan+replikasi cth A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Penghantaran:
1. Ais kering: Sampel perlu dibungkus dalam beg dan dikebumikan dalam ais kering.
2. Tiub RNAstable: Sampel RNA boleh dikeringkan dalam tiub penstabilan RNA (cth RNAstable®) dan dihantar dalam suhu bilik.
Aliran Kerja Perkhidmatan
Reka bentuk eksperimen
Contoh penghantaran
Pengekstrakan RNA
Pembinaan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
Perkhidmatan selepas jualan
Bioinformatik
● Kawalan kualiti data mentah
● klasifikasi sRNA
● Penjajaran kepada genom rujukan
● Pengenalpastian miRNA yang diketahui dan baru
● Analisis ekspresi miRNA pembezaan
● Anotasi fungsi sasaran miRNA
Pengenalpastian miRNA: struktur dan kedalaman
Ekspresi pembezaan miRNA - pengelompokan hiearchical
Anotasi fungsional sasaran miRNA yang dinyatakan secara berbeza
Terokai kemajuan penyelidikan yang difasilitasi oleh perkhidmatan penjujukan sRNA BMKGene melalui koleksi penerbitan yang dipilih susun.
Chen, H. et al. (2023) 'Jangkitan virus menghalang biosintesis saponin dan fotosintesis dalam Panax notoginseng', Fisiologi Tumbuhan dan Biokimia, 203, hlm. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) ' Tumbuhan FYVE domain yang mengandungi protein FREE1 mengaitkan dengan komponen mikropemproses untuk menindas biogenesis miRNA ', laporan EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p Mengawal Perkembangan Pupal Larva dengan Menyasarkan Domain 8 Faktor Pertumbuhan Epidermis Berbilang Domain 8 (megf8) dalam Lebah Madu, Apis mellifera', Jurnal Antarabangsa Sains Molekul, 24(6), p . 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Analisis Bersepadu MiRNA dan Gen Berkaitan dengan Kualiti Daging Mendedahkan bahawa Gga-MiR-140-5p Mempengaruhi Pemendapan Lemak Intramuskular dalam Ayam', Fisiologi Selular dan Biokimia, 46(6), ms 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
