-
BMKMANU S3000_Transkriptom Spatial
Transkriptomi spatial berdiri di barisan hadapan dalam inovasi saintifik, memperkasakan penyelidik untuk menyelidiki corak ekspresi gen yang rumit dalam tisu sambil mengekalkan konteks spatial mereka. Di tengah-tengah pelbagai platform, BMKGene telah membangunkan Cip Transkriptom Spatial BMKManu S3000, yang mempunyai resolusi dipertingkatkan sebanyak 3.5µm, mencapai julat subselular dan mendayakan tetapan resolusi berbilang peringkat. Cip S3000, yang menampilkan kira-kira 4 juta tompok, menggunakan perigi mikro berlapis dengan manik yang dimuatkan dengan probe tangkapan berkod bar ruang. Perpustakaan cDNA, diperkaya dengan kod bar spatial, disediakan daripada cip S3000 dan seterusnya disusun pada platform Illumina NovaSeq. Gabungan sampel berkod bar ruang dan UMI memastikan ketepatan dan kekhususan data yang dijana. Cip BMKManu S3000 sangat serba boleh, menawarkan tetapan resolusi berbilang peringkat yang boleh ditala dengan halus kepada tisu yang berbeza dan tahap perincian yang dikehendaki. Kebolehsuaian ini meletakkan cip sebagai pilihan yang cemerlang untuk kajian transkriptomi spatial yang pelbagai, memastikan pengelompokan spatial yang tepat dengan bunyi yang minimum. Penggunaan teknologi pembahagian sel dengan BMKManu S3000 membolehkan persempadanan data transkrip kepada sempadan sel, menghasilkan analisis yang mempunyai makna biologi langsung. Tambahan pula, resolusi S3000 yang dipertingkatkan menghasilkan bilangan gen dan UMI yang lebih tinggi yang dikesan setiap sel, membolehkan analisis yang lebih tepat bagi corak transkripsi spatial dan pengelompokan sel.
-
Penjujukan RNA nukleus tunggal
Perkembangan teknik penangkapan sel tunggal dan pembinaan perpustakaan tersuai, ditambah dengan penjujukan pemprosesan tinggi, telah merevolusikan kajian ekspresi gen pada peringkat sel. Kejayaan ini membolehkan analisis yang lebih mendalam dan lebih komprehensif tentang populasi sel yang kompleks, mengatasi batasan yang berkaitan dengan purata ekspresi gen ke atas semua sel dan memelihara heterogeniti sebenar dalam populasi ini. Walaupun penjujukan RNA sel tunggal (scRNA-seq) mempunyai kelebihan yang tidak dapat dinafikan, ia menghadapi cabaran dalam tisu tertentu di mana penciptaan penggantungan sel tunggal terbukti sukar dan memerlukan sampel segar. Di BMKGene, kami menangani halangan ini dengan menawarkan penjujukan RNA nukleus tunggal (snRNA-seq) menggunakan teknologi 10X Genomics Chromium yang terkini. Pendekatan ini meluaskan spektrum sampel yang boleh diterima oleh analisis transkrip pada peringkat sel tunggal.
Pengasingan nukleus dicapai melalui cip Kromium 10X Genomics Chromium yang inovatif, menampilkan sistem mikrofluidik lapan saluran dengan lintasan berganda. Dalam sistem ini, manik gel yang menggabungkan kod bar, primer, enzim, dan nukleus tunggal dikapsulkan dalam titisan minyak bersaiz nanoliter, membentuk Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Berikutan pembentukan GEM, lisis sel dan pelepasan kod bar berlaku dalam setiap GEM. Selepas itu, molekul mRNA menjalani transkripsi terbalik ke dalam cDNA, menggabungkan kod bar 10X dan Pengecam Molekul Unik (UMI). CDNA ini kemudiannya tertakluk kepada pembinaan perpustakaan penjujukan standard, memudahkan penerokaan profil ekspresi gen yang mantap dan komprehensif pada peringkat sel tunggal.
Platform: 10× Genomics Chromium dan Platform Illumina NovaSeq
-
10x Transkriptom Spatial Visium Genomics
Transkriptomi spatial ialah teknologi canggih yang membolehkan penyelidik menyiasat corak ekspresi gen dalam tisu sambil mengekalkan konteks spatialnya. Satu platform berkuasa dalam domain ini ialah 10x Genomics Visium ditambah dengan penjujukan Illumina. Prinsip 10X Visium terletak pada cip khusus dengan kawasan tangkapan yang ditetapkan di mana bahagian tisu diletakkan. Kawasan tangkapan ini mengandungi tempat berkod bar, setiap satu sepadan dengan lokasi spatial yang unik dalam tisu. Molekul RNA yang ditangkap daripada tisu kemudiannya dilabelkan dengan pengecam molekul unik (UMI) semasa proses transkripsi terbalik. Tempat berkod bar dan UMI ini membolehkan pemetaan spatial dan kuantifikasi ekspresi gen yang tepat pada resolusi sel tunggal. Gabungan sampel berkod bar ruang dan UMI memastikan ketepatan dan kekhususan data yang dijana. Dengan menggunakan teknologi Spatial Transcriptomics ini, penyelidik boleh memperoleh pemahaman yang lebih mendalam tentang organisasi ruang sel dan interaksi molekul kompleks yang berlaku dalam tisu, menawarkan pandangan yang tidak ternilai tentang mekanisme yang mendasari proses biologi dalam pelbagai bidang, termasuk onkologi, neurosains, biologi perkembangan, imunologi. , dan kajian botani.
Platform: 10X Genomics Visium dan Illumina NovaSeq
