-
Genomik Perbandingan
Genomik perbandingan melibatkan pemeriksaan dan perbandingan keseluruhan jujukan dan struktur genom antara spesies yang berbeza. Bidang ini bertujuan untuk mendedahkan evolusi spesies, menyahkod fungsi gen, dan menjelaskan mekanisme pengawalseliaan genetik dengan mengenal pasti struktur dan unsur jujukan yang dipelihara atau berbeza merentasi pelbagai organisma. Kajian genomik perbandingan komprehensif merangkumi analisis seperti keluarga gen, perkembangan evolusi, peristiwa penduaan genom keseluruhan dan kesan tekanan terpilih.
-
Genetik Evolusi
Platform analisis genetik populasi dan evolusi diwujudkan berdasarkan pengalaman besar yang terkumpul dalam pasukan R&D BMK selama bertahun-tahun. Ia adalah alat yang mesra pengguna terutamanya untuk penyelidik yang tidak mengambil jurusan bioinformatik. Platform ini membolehkan analisis asas berkaitan genetik evolusioner termasuk pembinaan pokok filogenetik, analisis ketidakseimbangan kaitan, penilaian kepelbagaian genetik, analisis sapuan terpilih, analisis persaudaraan, PCA, analisis struktur populasi, dsb.
-
Perhimpunan Genom Berasaskan Hi-C
Hi-C ialah kaedah yang direka untuk menangkap konfigurasi kromosom dengan menggabungkan interaksi berasaskan kedekatan menyelidik dan penjujukan throughput tinggi. Keamatan interaksi ini dipercayai berkorelasi negatif dengan jarak fizikal pada kromosom. Oleh itu, data Hi-C digunakan untuk membimbing pengelompokan, penyusunan dan orientasi jujukan terkumpul dalam draf genom dan menambatnya pada bilangan kromosom tertentu. Teknologi ini memperkasakan pemasangan genom peringkat kromosom tanpa adanya peta genetik berasaskan populasi. Setiap genom memerlukan Hi-C.
-
Penjujukan Genom Tumbuhan/Haiwan De Novo
De Novopenjujukan merujuk kepada pembinaan genom keseluruhan spesies menggunakan teknologi penjujukan tanpa ketiadaan genom rujukan. Pengenalan dan penggunaan meluas penjujukan generasi ketiga, yang menampilkan bacaan yang lebih panjang, telah meningkatkan pemasangan genom dengan ketara dengan meningkatkan pertindihan antara bacaan. Peningkatan ini amat penting apabila berurusan dengan genom yang mencabar, seperti yang menunjukkan heterozigositi tinggi, nisbah kawasan berulang yang tinggi, poliploid, dan kawasan dengan unsur berulang, kandungan GC yang tidak normal atau kerumitan tinggi yang biasanya tidak dipasang dengan baik menggunakan penjujukan bacaan pendek. bersendirian.
Penyelesaian sehenti kami menyediakan perkhidmatan penjujukan bersepadu dan analisis bioinformatik yang menyampaikan genom dipasang de novo berkualiti tinggi. Tinjauan genom awal dengan Illumina memberikan anggaran saiz dan kerumitan genom, dan maklumat ini digunakan untuk membimbing langkah seterusnya penjujukan bacaan lama dengan PacBio HiFi, diikuti dengande novoperhimpunan contigs. Penggunaan pemasangan HiC seterusnya membolehkan penambat contigs ke genom, mendapatkan pemasangan peringkat kromosom. Akhirnya, genom dianotasi oleh ramalan gen dan dengan penjujukan gen yang dinyatakan, menggunakan transkrip dengan bacaan pendek dan panjang.
-
Penjujukan Exome Seluruh Manusia
Penjujukan exome Seluruh Manusia (hWES) diakui secara meluas sebagai pendekatan penjujukan yang kos efektif dan berkuasa untuk menentukan mutasi yang menyebabkan penyakit. Walaupun hanya membentuk kira-kira 1.7% daripada keseluruhan genom, ekson memainkan peranan penting dengan secara langsung mencerminkan profil fungsi protein keseluruhan. Terutama, dalam genom manusia, lebih daripada 85% mutasi yang berkaitan dengan penyakit nyata dalam kawasan pengekodan protein. BMKGENE menawarkan perkhidmatan penjujukan keseluruhan exome manusia yang komprehensif dan fleksibel dengan dua strategi penangkapan exon berbeza yang tersedia untuk memenuhi pelbagai matlamat penyelidikan.
-
Penjujukan Fragmen Diperkuat-Lokus Khusus (SLAF-Seq)
Genotaip pemprosesan tinggi, terutamanya pada populasi berskala besar, adalah langkah asas dalam kajian persatuan genetik dan menyediakan asas genetik untuk penemuan gen berfungsi, analisis evolusi, dll. Daripada penjujukan semula keseluruhan genom yang mendalam,Penjujukan Genom Perwakilan Terkurang (RRGS)sering digunakan dalam kajian ini untuk meminimumkan kos penjujukan setiap sampel sambil mengekalkan kecekapan yang munasabah dalam penemuan penanda genetik. RRGS mencapai ini dengan mencerna DNA dengan enzim sekatan dan memfokuskan pada julat saiz serpihan tertentu, dengan itu menyusun hanya sebahagian kecil daripada genom. Di antara pelbagai metodologi RRGS, Penjujukan Fragmen Diperkuat Lokus Khusus (SLAF) ialah pendekatan yang boleh disesuaikan dan berkualiti tinggi. Kaedah ini, dibangunkan secara bebas oleh BMKGene, mengoptimumkan set enzim sekatan untuk setiap projek. Ini memastikan penjanaan sejumlah besar tag SLAF (400-500 bps kawasan genom yang dijujukan) yang diedarkan secara seragam merentas genom sambil mengelakkan kawasan berulang secara berkesan, sekali gus memastikan penemuan penanda genetik terbaik.
-
Perpustakaan pra-dibuat Illumina
Teknologi penjujukan Illumina, berdasarkan Sequencing by Synthesis (SBS), ialah inovasi NGS yang diterima pakai secara global, bertanggungjawab untuk menjana lebih 90% data penjujukan dunia. Prinsip SBS melibatkan pengimejan penamat boleh balik berlabel pendarfluor apabila setiap dNTP ditambah, dan kemudiannya dibelah untuk membenarkan penggabungan pangkalan seterusnya. Dengan kesemua empat dNTP terikat terminator boleh balik hadir dalam setiap kitaran penjujukan, persaingan semula jadi meminimumkan bias penggabungan. Teknologi serba boleh ini menyokong perpustakaan baca tunggal dan akhir berpasangan, memenuhi pelbagai aplikasi genomik. Keupayaan pemprosesan tinggi dan ketepatan penjujukan Illumina meletakkannya sebagai asas dalam penyelidikan genomik, memperkasakan saintis untuk membongkar selok-belok genom dengan perincian dan kecekapan yang tiada tandingan.
Perkhidmatan penjujukan perpustakaan pra-buatan kami membolehkan pelanggan menyediakan perpustakaan penjujukan daripada pelbagai sumber (mRNA, genom keseluruhan, amplikon, perpustakaan 10x, antara lain). Selepas itu, perpustakaan ini boleh dihantar ke pusat penjujukan kami untuk kawalan kualiti dan penjujukan dalam platform Illumina.
