
Pacbio penuh transkrip
Pacbio penjujukan transkrip penuh Pacbio, ISOSEQ, membolehkan pengenalpastian yang tepat terhadap isoforms transkrip, memberi penerangan tentang polyadenylation dan splicing alternatif, dan membawa kepada analisis ekspresi gen yang lebih tepat. Pipeline transkrip penuh BMKCloud Pacbio direka untuk menganalisis perpustakaan cDNA yang disusun dalam mod urutan konsensus pekeliling (CCS) dan mengenal pasti urutan penuh bukan chimer (FLNC), yang kemudian dikelompokkan ke dalam transkrip bukan redundan. Analisis BUSCO berikutnya menilai kesempurnaan perhimpunan transkrip. Dari transkrip yang dipasang, pelbagai analisis dilakukan: splicing alternatif, urutan urutan mudah (SSR), ramalan lncRNA dan gen sasaran yang sepadan, ramalan gen novel, analisis keluarga gen, analisis faktor transkripsi, dan anotasi fungsi transkrip.
Bioinformatik
