
mRNA-seq (NGS) dengan genom rujukan
RNA-seq ialah alat standard merentasi sains hayat dan tanaman, merapatkan jurang antara genom dan proteom. Kekuatannya terletak pada penemuan transkrip baharu dan mengukur ekspresinya dalam satu ujian. Ia digunakan secara meluas untuk kajian transkriptik perbandingan, memberi penerangan tentang gen yang berkaitan dengan pelbagai sifat atau fenotip, seperti membandingkan mutan dengan jenis liar atau mendedahkan ekspresi gen dalam keadaan tertentu. APP mRNA(Rujukan) BMKCloud menyepadukan kuantifikasi ekspresi, analisis ekspresi pembezaan (DEG) dan analisis struktur jujukan ke dalam saluran paip bioinformatik mRNA-seq(NGS) dan menggabungkan kekuatan perisian serupa, memastikan kemudahan dan kemesraan pengguna. Pengguna boleh memuat naik data RNA-seq mereka ke awan, di mana App menawarkan penyelesaian analisis bioinformatik sehenti yang komprehensif. Selain itu, ia mengutamakan pengalaman pelanggan, menawarkan operasi diperibadikan yang disesuaikan dengan keperluan khusus pengguna. Pengguna boleh menetapkan parameter dan menyerahkan misi saluran paip dengan sendiri, menyemak laporan interaktif, melihat data/rajah dan melengkapkan perlombongan data, seperti: pemilihan gen sasaran, pengelompokan berfungsi, penggambaran, dsb.
Platform:Illumina, MGI
Strategi:RNA-Seq
Susun atur: Data berpasangan, bersih.
Jenis perpustakaan:fr-unstrand, fr-firststrand atau fr-secondstrand
Panjang bacaan:150 bp
Jenis fail:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz atau *.fq.gz. Sistem akansecara automatik memasangkan fail .fastq mengikut nama fail mereka,cth *_1.fastq dipasangkan dengan *._2.fastq.
Bilangan sampel:Tiada sekatan pada bilangannyasampel, tetapi masa analisis akan meningkat sebagai bilangansampel tumbuh.
Jumlah Data yang Disyorkan:6G setiap sampel