Penjujukan transkrip penuh berasaskan nanopore
Sequencing Nanopore membezakan dirinya dari platform penjujukan lain, di mana nukleotida dibaca secara langsung tanpa sintesis DNA dan menghasilkan bacaan panjang pada puluhan kilobase. Ini memberi kuasa kepada pembacaan langsung transkrip penuh dan menangani cabaran dalam kajian transkrip.
√ Bias spesifik urutan rendah
√ Pembacaan penuh cDNA untuk kajian struktur gen
√ kurang data yang diperlukan untuk menampung bilangan transkrip yang sama
√ Pengenalpastian pelbagai isoforms setiap gen
√ Kuantifikasi ekspresi pada tahap isoform
Paip bioinformatik biasa
Kes -kes terkini yang berjaya dengan Biomarker Technologies
1. Analisis perbandingan transkrip penuh panjang mendedahkan dinamik perkembangan batang gnetum luofuense
Jurnal: Frontiers dalam Genetik
Diterbitkan: Mac 2021
Kata kunci: Minion | Splicing Alternatif | Apa | lncRNA | Transkrip yang dinyatakan secara berbeza
Baca teks penuh
2. Pergerakan unidirectional RNA kecil dari pucuk ke akar di heterograf interspecific
Jurnal: Tanaman Alam
Diterbitkan: Jan. 2021
Kata kunci: Nanopore | Illumina | Pengesanan mRNA mudah alih penuh panjang
3. Analisis transkrip penuh panjang akar asparagus mendedahkan mekanisme molekul toleransi garam yang disebabkan oleh kulat mycorrhizal arbuskular
Jurnal: Botani Alam Sekitar dan Eksperimen
Diterbitkan: Jan. 2021
Kata kunci: Minion | Transkrip yang dinyatakan secara berbeza | Faktor transkripsi | Splicing alternatif
4. Perubahan ciri fisiologi dan transkrip penuh akar mawar (rosa chinensis) dan daun sebagai tindak balas kepada tekanan kemarau
Jurnal: Fisiologi Loji dan Sel
Diterbitkan: Okt. 2020
Kata kunci: Promethion | Transkrip yang dinyatakan secara berbeza | Ramalan Fungsian | Spliced isoforms | TF dan lncRNA
5. Analisis dan Perbandingan Komprehensif Pacbio dan Urutan RNA berasaskan Nanopore dari Transkrip Arabidopsis
Jurnal: Kaedah Loji
Diterbitkan: Apr. 2020
Kata kunci: Gridion | Promethion | Sequel Pacbio | Illumina Novaseq | Penjajaran Genome | Pengenalan Transkrip | Splicing Alternatif | SSR | LncRNA | Kuantifikasi isoform
Berita dan sorotan Bertujuan untuk berkongsi kes -kes terkini dengan teknologi biomarker, menangkap pencapaian saintifik novel serta teknik -teknik yang terkenal yang digunakan semasa kajian.
Masa Post: Jan-08-2022