Genom
Perhimpunan Skala Kromosom dan Analisis Tanaman Biomas Miscanthus Lutarioriparius Genome
Sequencing Nanopore | Illumina | Hi-c | RNA-Sequencing | Phylogeny
Dalam kajian ini, Biomarker Technologies menyediakan sokongan teknikal pada penjujukan nanopore, perhimpunan genom de novo, perhimpunan bantuan HI-C, dll.
Abstrak
Miscanthus, tumbuhan abadi rhizomatous, mempunyai potensi besar untuk pengeluaran bioenergi untuk biomas dan toleransi tekanan yang tinggi. Kami melaporkan perhimpunan skala kromosomMiscanthus lutarioripariusGenom dengan menggabungkan Oxford Nanopore Sequencing dan Hi-C Technologies. Perhimpunan 2.07-gb meliputi 96.64% daripada genom, dengan contig N50 sebanyak 1.71 MB. Urutan centromere dan telomere dipasang untuk semua 19 kromosom dan kromosom 10. Asal Allotetraploid M. lutarioriparius dikonfirmasi menggunakan ulangan satelit centromeric. Struktur genom tetraploid dan beberapa penyusunan semula kromosom berbanding dengan sorgum jelas ditunjukkan. Tandem gen pendua dariM. Lutarioripariusberfungsi diperkaya bukan sahaja dari segi yang berkaitan dengan tindak balas tekanan, tetapi biosintesis dinding sel. Keluarga gen yang berkaitan dengan rintangan penyakit, biosintesis dinding sel dan pengangkutan ion logam sangat berkembang dan berkembang. Perkembangan keluarga ini mungkin menjadi asas genomik penting untuk peningkatan ciri -ciri yang luar biasaM. Lutarioriparius.
Statistik utama perhimpunan genom
Rajah. Gambaran Keseluruhan Perhimpunan Genom M. Lutarioriparius
Berita dan sorotan Bertujuan untuk berkongsi kes -kes terkini dengan teknologi biomarker, menangkap pencapaian saintifik novel serta teknik -teknik yang terkenal yang digunakan semasa kajian.
Masa Post: Jan-05-2022