
Metagenomik (NGS)
Metagenomik senapang patah dengan Illumina ialah alat popular untuk mengkaji mikrobiom dengan menyusun DNA secara terus daripada sampel kompleks, membolehkan kajian kepelbagaian taksonomi dan fungsian. Talian paip metagenomik (NGS) BMKCloud bermula dengan kawalan kualiti dan pemasangan metagenom, dari mana gen diramalkan dan dikelompokkan ke dalam set data tidak berlebihan yang diberi anotasi untuk fungsi dan taksonomi menggunakan berbilang pangkalan data. Maklumat ini digunakan untuk menganalisis kepelbagaian taksonomi dalam sampel (kepelbagaian alfa) dan kepelbagaian antara sampel (kepelbagaian beta). Analisis pembezaan antara kumpulan menemui OTU dan fungsi biologi yang berbeza antara kedua-dua kumpulan menggunakan kedua-dua ujian parametrik dan bukan parametrik, manakala analisis korelasi mengaitkan perbezaan ini dengan faktor persekitaran.
Aliran Kerja Bioinformatik
