Long Non-coding Sequencing-Illumina
Kelebihan Perkhidmatan
●Analisis bersama mRNA dan lncRNA: dengan menggabungkan kuantifikasi transkrip mRNA dengan kajian lncRNA dan sasarannya, adalah mungkin untuk mendapatkan gambaran keseluruhan yang mendalam tentang mekanisme pengawalseliaan yang mendasari tindak balas selular.
●Kepakaran Luas: Pasukan kami membawa banyak pengalaman kepada setiap projek, dengan rekod prestasi memproses lebih 23,000 sampel di BMK merangkumi pelbagai jenis sampel dan projek lncRNA.
●Kawalan Kualiti yang Teguh: Kami melaksanakan titik kawalan teras merentas semua peringkat, daripada penyediaan sampel dan perpustakaan kepada penjujukan dan bioinformatik. Pemantauan yang teliti ini memastikan penyampaian hasil yang berkualiti tinggi secara konsisten.
●Sokongan Selepas Jualan: Komitmen kami melangkaui penyiapan projek dengan tempoh perkhidmatan selepas jualan selama 3 bulan. Pada masa ini, kami menawarkan susulan projek, bantuan penyelesaian masalah dan sesi Soal Jawab untuk menangani sebarang pertanyaan yang berkaitan dengan keputusan.
Keperluan Sampel dan Penghantaran
| Perpustakaan | Platform | Data yang disyorkan | QC Data |
| perpustakaan arah kehabisan rRNA | Illumina PE150 | 10-16 Gb | S30≥85% |
Nukleotida:
| Conc.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kesucian | Integriti |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pencemaran protein atau DNA terhad atau tiada ditunjukkan pada gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; terhad atau tiada ketinggian garis dasar |
● Tumbuhan:
Akar, Batang atau Kelopak: 450 mg
Daun atau Biji: 300 mg
Buah: 1.2 g
● Haiwan:
Jantung atau Usus: 450 mg
Viscera atau Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1.5g
● Artropod:
Serangga: 9g
Crustacea: 450 mg
● Seluruh darah:2 tiub
● Sel: 106 sel
● Serum dan Plasma: 6 mL
Penghantaran Sampel yang Disyorkan
Bekas: 2 ml tiub empar (Kerajang timah tidak disyorkan)
Pelabelan sampel: Kumpulan+replikasi cth A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Penghantaran:
1. Ais kering: Sampel perlu dibungkus dalam beg dan dikebumikan dalam ais kering.
2. Tiub RNAstable: Sampel RNA boleh dikeringkan dalam tiub penstabilan RNA (cth RNAstable®) dan dihantar dalam suhu bilik.
Aliran Kerja Perkhidmatan
Reka bentuk eksperimen
Contoh penghantaran
Pengekstrakan RNA
Pembinaan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
Perkhidmatan selepas jualan
Bioinformatik
Analisis Ekspresi Gen Berbeza (DEGs).
Kuantifikasi ekspresi lncRNA - pengelompokan
Pengayaan gen sasaran lncRNA
Analisis kedudukan mRNA dan lncRNA bersama - Plot Circos (bulatan tengah ialah mRNA dan lingkaran dalam ialah lncRNA)
Terokai kemajuan yang difasilitasi oleh perkhidmatan penyamaan lncRNA BMKGene melalui koleksi penerbitan yang dipilih susun.
Ji, H. et al. (2020) 'Pengenalpastian, ramalan kefungsian dan pengesahan lncRNA utama bagi lncRNA berkaitan tekanan sejuk dalam hati tikus', Laporan Saintifik 2020 10:1, 10(1), ms 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Analisis Transkriptif Integratif Mendedahkan Mekanisme Imun untuk Terikan Ikan Mas Biasa Tahan CyHV-3', Frontiers dalam Imunologi, 12, hlm. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Keutamaan Berasaskan Integrasi Multi-Omics bagi Rangkaian Peraturan RNA Endogen Bersaing dalam Kanser Paru Sel Kecil: Ciri Molekul dan Calon Dadah', Frontiers in Onkologi, 12, hlm. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Pembedahan genetik rangkaian ekspresi bersama gen yang mendasari fotosintesis dalam Populus', Jurnal Bioteknologi Tumbuhan, 18(4), ms. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Rangkaian Pengawalseliaan Global untuk Ekspresi Gen Disregulasi dan Isyarat Metabolik Tidak Normal dalam Sel Imun dalam Persekitaran Mikro Penyakit Graves dan Tiroiditis Hashimoto', Frontiers in Immunology, 13, hlm. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
