lncrna

RNA bukan pengekodan yang panjang (lncRNA) ialah RNA yang lebih panjang daripada 200 nukleotida dengan potensi pengekodan yang rendah tetapi dengan fungsi pengawalseliaan yang kritikal. Saluran paip lncRNA BMKCloud direka untuk menganalisis perpustakaan yang habis rRNA dengan genom rujukan beranotasi yang berkualiti tinggi, dengan menganalisis lncRNA dan ekspresi mRNA bersama-sama. Selepas pemangkasan bacaan dan kawalan kualiti, bacaan diselaraskan dengan genom rujukan untuk memasang transkrip, dan analisis struktur gen seterusnya mendedahkan penyambungan alternatif dan gen novel. Transkrip dikenal pasti sebagai mRNA atau lncRNA, dan analisis ekspresi pembezaan mengenal pasti lncRNA yang dinyatakan secara berbeza, sasarannya dan gen yang dinyatakan secara berbeza (DEGS). Kedua-dua DEG dan sasaran lncRNA yang dinyatakan secara berbeza dianotasi secara fungsional untuk mencari kategori fungsi yang diperkaya.