Kajian persatuan genom (GWAS) bertujuan untuk mengenal pasti varian genetik (genotip) yang dikaitkan dengan ciri-ciri tertentu (fenotip). Kajian GWA menyiasat penanda genetik menyeberangi genom keseluruhan individu dan meramalkan persatuan genotip-fenotip oleh analisis statistik pada tahap penduduk. Resequencing keseluruhan-genom berpotensi dapat menemui semua varian genetik. Gandingan dengan data fenotip, GWA boleh diproses untuk mengenal pasti fenotip berkaitan SNP, QTL dan gen calon, yang sangat menyokong pembiakan haiwan/tumbuhan moden. SLAF adalah strategi penjujukan genom yang mudah dibangunkan sendiri, yang menemui penanda yang diedarkan di seluruh genom, SNP. SNP ini, sebagai penanda genetik molekul, boleh diproses untuk kajian persatuan dengan ciri -ciri yang disasarkan. Ia adalah strategi kos efektif dalam mengenal pasti ciri-ciri kompleks yang berkaitan dengan variasi genetik.
