Penjujukan mRNA eukariotik-NGS
Ciri-ciri
● Tangkapan poli mRNA sebelum penyediaan perpustakaan
● Penyediaan perpustakaan mRNA berarah pilihan untuk membolehkan mendapatkan data penjujukan khusus helai
● Analisis bioinformatik ekspresi gen dan struktur transkrip
Kelebihan
●Kepakaran Luas: Pasukan kami telah memproses lebih 600,000 sampel di BMKgene, merangkumi pelbagai jenis sampel seperti kultur sel, tisu dan cecair badan. Kami membawa banyak pengalaman kepada setiap projek dan telah berjaya menyelesaikan lebih 100,000 projek mRNA-Seq dalam pelbagai domain penyelidikan.
●Kawalan Kualiti yang Teguh: Kami melaksanakan titik kawalan teras merentas semua peringkat, daripada penyediaan sampel dan perpustakaan kepada penjujukan dan bioinformatik. Pemantauan yang teliti ini memastikan penyampaian hasil yang konsisten berkualiti tinggi, memastikan anda bahawa projek anda berada di tangan yang boleh dipercayai.
●Anotasi Komprehensif: Kami menggunakan berbilang pangkalan data untuk menganotasi Gen Berbeza (DEG) secara fungsi dan melaksanakan analisis pengayaan yang sepadan. Pendekatan komprehensif ini memberikan pandangan tentang proses selular dan molekul yang mendasari tindak balas transkrip, memastikan anda dimaklumkan sepenuhnya tentang hasil projek anda.
●Sokongan Selepas Jualan: Komitmen kami melangkaui penyiapan projek dengan tempoh perkhidmatan selepas jualan selama 3 bulan. Pada masa ini, kami menawarkan susulan projek, bantuan penyelesaian masalah dan sesi Soal Jawab untuk menangani sebarang pertanyaan yang berkaitan dengan keputusan.
Keperluan Sampel dan Penghantaran
| Perpustakaan | Strategi urutan | Data disyorkan | Kawalan Kualiti |
| Poli A diperkaya | Illumina PE150 DNSSEQ-T7 | 6 -10 Gb | S30≥85% |
Keperluan Sampel:
Nukleotida:
| Conc.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kesucian | Integriti | |
| Perpustakaan Standard | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pencemaran protein atau DNA terhad atau tiada ditunjukkan pada gel. | Untuk tumbuhan: RIN≥4.0; Untuk haiwan: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; terhad atau tiada ketinggian garis dasar |
| Perpustakaan Berarah | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pencemaran protein atau DNA terhad atau tiada ditunjukkan pada gel. | Untuk tumbuhan: RIN≥4.0; Untuk haiwan: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; terhad atau tiada ketinggian garis dasar |
● Tumbuhan:
Akar, Batang atau Kelopak: 450 mg
Daun atau Biji: 300 mg
Buah: 1.2 g
●Haiwan:
Jantung atau Usus: 300 mg
Viscera atau Otak: 240 mg
Otot: 450 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1g
● Artropod:
Serangga: 6g
Crustacea: 300 mg
● Darah penuh: 1 tiub
● Sel: 106 sel
Penghantaran Sampel yang Disyorkan
Bekas: 2 ml tiub empar (Kerajang timah tidak disyorkan)
Pelabelan sampel: Kumpulan+replikasi cth A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Penghantaran:
1. Ais kering: Sampel perlu dibungkus dalam beg dan dikebumikan dalam ais kering.
2. Tiub meja RNA: Sampel RNA boleh dikeringkan dalam tiub penstabilan RNA (cth RNAstable®) dan dihantar dalam suhu bilik.
Aliran Kerja Perkhidmatan
Reka bentuk eksperimen
Contoh penghantaran
Pengekstrakan RNA
Pembinaan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
Perkhidmatan selepas jualan
Bioinformatik
Eukariotik aliran kerja analisis penjujukan mRNA
Bioinformatik
ØKawalan kualiti data mentah
ØPenjajaran genom rujukan
ØAnalisis struktur transkrip
ØKuantifikasi ungkapan
ØAnalisis ungkapan perbezaan
ØAnotasi fungsi dan pengayaan
Rujukan Penjajaran Genom
Ketepuan Data
Sampel korelasi dan penilaian replika biologi
Gen Berbeza (DEGs)
Anotasi Fungsional DEG
Pengayaan Fungsional DEG
Terokai kemajuan yang difasilitasi oleh perkhidmatan penjujukan mRNA NGS eukariotik BMKGene melalui koleksi penerbitan yang dipilih susun.
Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan dan triclocarban melemahkan kapasiti penciuman ikan mas dengan mengekang pengecaman bau, mengganggu transduksi isyarat penciuman, dan mengganggu pemprosesan maklumat penciuman', Water Research, 233, hlm. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus merampas p11 manusia untuk mengubah hala fagosom yang mengandungi kulat ke laluan tidak merosot', Hos Sel & Mikrob, 31(3), ms 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'Faktor Transkripsi TCP yang Terlibat dalam Pembangunan Rebung Ma Buluh (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers dalam Sains Tumbuhan, 13, hlm. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) 'Genom Chrysanthemum lavandulifolium dan mekanisme molekul yang mendasari pelbagai jenis kapitulum', Penyelidikan Hortikultur, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) 'Sebuah nanoreaktor lata untuk meningkatkan terapi sonodinamik pada kanser kolorektal melalui penambahan ROS sinergistik dan penyumbatan autophagy', Nano Today, 49, p. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
