●Platform:Illumina Novaseq 6000 dan Novaseq X Plus
●Mod penjujukan:PE150 dan PE250
●Kawalan kualiti perpustakaan sebelum penjujukan
●Urutan data QC dan penghantaran:Penghantaran laporan QC dan data mentah dalam format FASTQ selepas demultiplexing dan penapisan Q30 dibaca
●Fleksibiliti perkhidmatan penjujukan:Pelanggan boleh memilih untuk urutan oleh lorong, sel aliran, atau dengan jumlah data yang diperlukan (jujukan lorong separa).
●Pengalaman yang luas di platform penjujukan Illumina:dengan beribu -ribu projek tertutup dengan pelbagai spesies.
●Penghantaran Laporan QC Sequencing:dengan metrik yang berkualiti, ketepatan data dan prestasi keseluruhan projek penjujukan.
●Proses penjujukan matang:dengan masa giliran yang singkat.
●Kawalan kualiti yang ketat: Kami melaksanakan keperluan QC yang ketat untuk menjamin penghantaran hasil yang berkualiti tinggi secara konsisten.
Platform | Sel aliran | Mod penjujukan | Unit | Anggaran output |
Novaseq x | 10B (8 lorong) | PE150 | Lorong tunggal Lorong separa | 375GB / LANE |
25b (8 lorong) | PE150 | Lorong tunggal Lorong separa | 1000 GB/LANE | |
Novaseq 6000 | Sel aliran SP (2 lorong) | PE250 | Sel aliran Lorong tunggal Lorong separa | 325-400 m dibaca / lorong |
Sel aliran s4 (4 lorong) | PE150 | Sel aliran Lorong tunggal Lorong separa | ~ 800 gb / lorong |
Jumlah data (x) | Konsentrasi (qPCR/nm) | Kelantangan | |
Penjujukan lorong separa
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
Penjujukan lorong | Per lorong | ≥ 1.5 nm / kolam perpustakaan | ≥ 25 μl / kolam perpustakaan |
Sebagai tambahan kepada kepekatan dan jumlah keseluruhan, corak puncak yang sesuai juga diperlukan.
NOTA: Penjejakan lorong perpustakaan kepelbagaian yang rendah memerlukan phix spike-in untuk memastikan panggilan asas yang mantap.
Kami mengesyorkan mengemukakan perpustakaan pra-pooled sebagai sampel. Sekiranya anda memerlukan bmkgene untuk melakukan penyatuan perpustakaan, sila rujuk
Keperluan perpustakaan untuk penjujukan lorong separa.
Puncak utama harus berada dalam 300-450 bp.
Perpustakaan harus mempunyai puncak utama tunggal, tiada pencemaran penyesuai dan tidak ada dimer primer.
Laporan mengenai kualiti perpustakaan disediakan sebelum penjujukan, menilai jumlah perpustakaan, dan pemecahan.
Jadual 1. Statistik mengenai data penjujukan.
Contoh ID | Bmkid | Bacaan mentah | Data mentah (BP) | Bacaan Bersih (%) | Q20 (%) | S30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Rajah 1. Pengagihan kualiti di sepanjang bacaan dalam setiap sampel
Rajah 2. Pengagihan kandungan asas
Rajah 3. Pengagihan kandungan baca dalam data penjujukan