CircRNA Sequencing-Illumina
Ciri -ciri
● Penurunan rRNA diikuti oleh penyediaan perpustakaan arah, membolehkan data penjujukan khusus.
● Aliran kerja bioinformatik membolehkan ramalan circRNA dan kuantifikasi ekspresi
Kelebihan perkhidmatan
●Perpustakaan RNA yang lebih komprehensif:Kami menggunakan pengurangan rRNA dan bukannya pengurangan RNA linear dalam penyediaan pra-perpustakaan kami, memastikan data penjujukan termasuk bukan sahaja circRNA tetapi juga mRNA dan lncRNA, membolehkan analisis bersama dataset ini
●Analisis pilihan rangkaian RNA endogen (CERNA) yang kompetitif: Memberikan pandangan yang lebih mendalam ke dalam mekanisme pengawalseliaan selular
●Kepakaran yang luas: Dengan rekod prestasi pemprosesan lebih 20,000 sampel di BMKGene, merangkumi pelbagai jenis sampel dan projek lncRNA, pasukan kami membawa banyak pengalaman kepada setiap projek.
●Kawalan kualiti yang ketat: Kami melaksanakan titik kawalan teras di semua peringkat, dari persediaan sampel dan perpustakaan untuk penjujukan dan bioinformatik. Pemantauan yang teliti ini memastikan penghantaran hasil yang berkualiti tinggi secara konsisten.
● Sokongan selepas jualan: Komitmen kami melangkaui siap projek dengan tempoh perkhidmatan selepas jualan selama 3 bulan. Pada masa ini, kami menawarkan susulan projek, bantuan penyelesaian masalah, dan sesi Q & A untuk menangani sebarang pertanyaan yang berkaitan dengan hasilnya.
Keperluan dan penghantaran sampel
| Perpustakaan | Platform | Data yang disyorkan | Data QC |
| rRNA habis perpustakaan arah | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Keperluan sampel:
Nukleotida:
| Conc. (Ng/μl) | Jumlah (μg) | Kesucian | Integriti |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Terhad atau tiada protein atau pencemaran DNA yang ditunjukkan pada gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ketinggian asas terhad atau tiada |
● Tumbuhan:
Akar, batang atau kelopak: 450 mg
Daun atau benih: 300 mg
Buah: 1.2 g
● Haiwan:
Jantung atau usus: 450 mg
Viskera atau otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, rambut atau kulit: 1.5g
● Arthropods:
Serangga: 9g
Crustacea: 450 mg
● Seluruh darah:2 tiub
● Sel: 106 sel
● Serum dan plasma: 6 ml
Penghantaran sampel yang disyorkan
Bekas: 2 ml tiub centrifuge (timah timah tidak disyorkan)
Pelabelan sampel: kumpulan+meniru EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Penghantaran:
1. Dry-ice: Sampel perlu dibungkus dalam beg dan dikebumikan dalam ais kering.
2. Tiub rnastable: Sampel RNA boleh dikeringkan dalam tiub penstabilan RNA (contohnya, RNASTable®) dan dihantar pada suhu bilik.
Aliran kerja perkhidmatan
Reka bentuk eksperimen
Penghantaran sampel
Pengekstrakan RNA
Pembinaan Perpustakaan
Urutan
Analisis data
Perkhidmatan selepas jualan
Bioinformatik
Ramalan CircRNA: Pengagihan Kromosom
CIRCRNA yang berbeza - Plot Gunung Berapi
CIRCRNA yang berbeza - kluster hierarki
Pengayaan fungsional gen tuan rumah CircRNA
Terokai kemajuan penyelidikan yang difasilitasi oleh perkhidmatan penjujukan circRNA bmkgene melalui koleksi penerbitan yang dikendalikan.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 mengawal pembentukan circRNA dan microRNA yang diselaraskan gen dalam karsinoma hepatoselular', Oncogene 2021 40:25, 40 (25), ms 4338-4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/angka/6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 memodulasi keseimbangan transkrip pekeliling dan linear dalam karsinoma hepatoselular'. doi: 10.21203/rs.3.RS-2418311/v1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'Penilaian komprehensif circRNA dalam kardiomiopati cirrhotic sebelum dan selepas pemindahan hati', Immunopharmacology Antarabangsa, 114, ms. 109495. DOI: 10.1016/j.Indimp.2022.109495.
