● Dengan dua pilihan yang mungkin untuk dipilih bergantung pada tahap kesempurnaan genom yang dikehendaki.
● Draf Pilihan Genome: Sequencing Short-Read dengan Illumina Novaseq PE150.
● Lengkapkan 0 Gap Genome.
● Penjujukan panjang pada Nanopore Promethion 48 atau Pacbio Revio untuk Perhimpunan Genom.
● Penjujukan pendek dibaca pada Illumina Novaseq untuk pengesahan genom dan pembetulan ralat (nanopore) atau untuk menghasilkan genom draf.
●Genome sifar-jurang dijamin: Ini disebabkan oleh integrasi penjujukan Illumina dengan penjujukan baca panjang (Nanopore atau Pacbio).
●Aliran kerja bioinformatik lengkap:Ini termasuk pemasangan genom dan ramalan pelbagai elemen genom, anotasi gen berfungsi, dan visualisasi genom seperti plot circos.
●Kepakaran yang luas: Dengan lebih daripada 20,000 genom mikrob yang dipasang, BMKGene membawa lebih dari satu dekad pengalaman, pasukan analisis yang sangat mahir, kandungan komprehensif, dan sokongan pasca jualan yang sangat baik.
●Sokongan selepas jualan:Komitmen kami melangkaui siap projek dengan tempoh perkhidmatan selepas jualan selama 3 bulan. Pada masa ini, kami menawarkan susulan projek, bantuan penyelesaian masalah, dan sesi Q & A untuk menangani sebarang pertanyaan yang berkaitan dengan hasilnya.
●Strategi penjujukan berganda yang tersedia:Untuk matlamat penyelidikan yang berbeza dan keperluan kesempurnaan genom.
Perkhidmatan | Strategi penjujukan |
Draf genom | Illumina PE150 100x |
0 jurang genom | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio Hifi 30x + Illumina PE150 100x (Pilihan) |
Kepekatan (ng/μl) | Jumlah Jumlah (μg) | Kelantangan (μl) | OD260/280 | OD260/230 | |
Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bakteria: ≥3.5x1010 sel
Termasuk analisis berikut:
● Mengurangkan kawalan kualiti data
● Perhimpunan Genom
● Analisis komponen genom: Ramalan CD dan pelbagai elemen genomik
● Anotasi berfungsi dengan pelbagai pangkalan data umum (GO, KEGG, dll) dan pangkalan data lanjutan (kad, VFDB, dll)
● Visualisasi genom
Kami menyediakan genom dalam format FASTA yang mudah diakses dan fail anotasi genom (GFF).
Anotasi Gen - Pergi
Anotasi Gen - Karbohidrat Cazy
Visualisasi Genom - Circos Plot
Terokai kemajuan yang difasilitasi oleh perkhidmatan pemasangan genom bakteria BMKGene melalui koleksi penerbitan yang dikendalikan.
Dai, W. et al. (2023) 'Penemuan Bacteroides Uniformis F18-22 sebagai bakteria probiotik yang selamat dan novel untuk rawatan kolitis ulseratif dari kolon manusia yang sihat',Jurnal Antarabangsa Sains Molekul, 24 (19), ms. 14669. DOI: 10.3390/IJMS241914669/S1.
Kang, Q. et al. (2021) 'Multidrug-resistant proteus mirabilis isolates yang membawa Blaoxa-1 dan Blandm-1 dari hidupan liar di China: meningkatkan risiko kesihatan awam',Zoologi Integratif, 16 (6), ms 798-809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
Wang, TT et al. (2017) 'Urutan genom lengkap endophyte bacillus flexus KLBMP 4941 mendedahkan mekanisme promosi pertumbuhan tumbuhan dan asas genetik untuk toleransi garam',Jurnal Bioteknologi, 260, ms 38-41. doi: 10.1016/j.jbiotec.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'Plasmid rintangan multipon Klebsiella menengah penyebaran luas gen antimikrob',Frontiers in Microbiology, 12, ms. 754931. Doi: 10.3389/fmicb.2021.754931/bibtex.