संपूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण (WGBS)
संपूर्ण जीनोम बिसल्फाइट सिक्वेन्सिंग (WGBS) ही DNA मेथिलेशनच्या सखोल शोधासाठी सुवर्ण-मानक पद्धत आहे, विशेषत: सायटोसिन (5-mC) मधील पाचवे स्थान, जीन अभिव्यक्ती आणि सेल्युलर क्रियाकलापांचे मुख्य नियामक. WGBS च्या अंतर्निहित तत्त्वामध्ये बिसल्फाईट उपचारांचा समावेश आहे, मेथाइलेटेड सायटोसाइन अपरिवर्तित सोडताना, unmethylated cytosines चे uracil (C ते U) मध्ये रूपांतर करणे. हे तंत्र सिंगल-बेस रिझोल्यूशन ऑफर करते, संशोधकांना मेथिलोमची सर्वसमावेशकपणे तपासणी करण्यास आणि विविध परिस्थितींशी संबंधित असामान्य मेथिलेशन पॅटर्न उघड करण्यास अनुमती देते, विशेषत: कर्करोग. WGBS चा वापर करून, शास्त्रज्ञ जीनोम-व्यापी मेथिलेशन लँडस्केपमध्ये अतुलनीय अंतर्दृष्टी मिळवू शकतात, विविध जैविक प्रक्रिया आणि रोगांना अंतर्भूत असलेल्या एपिजेनेटिक यंत्रणेची सूक्ष्म माहिती प्रदान करतात.
सेवा वैशिष्ट्ये
● संदर्भ जीनोम आवश्यक आहे.
● बिसल्फाइट रूपांतरण कार्यक्षमतेचे परीक्षण करण्यासाठी Lambda DNA जोडले आहे.
● Illumina NovaSeq वर अनुक्रम.
सेवा फायदे
●डीएनए मेथिलेशन संशोधनासाठी सुवर्ण मानक: या परिपक्व मेथिलेशन रूपांतरण प्रक्रिया तंत्रज्ञानामध्ये उच्च अचूकता आणि चांगली पुनरुत्पादन क्षमता आहे.
●वाइड कव्हरेज आणि सिंगल-बेस रिझोल्यूशन:जीनोम-व्यापी स्तरावर मेथिलेशन साइट्सचा शोध.
●पूर्ण प्लॅटफॉर्म:नमुना प्रक्रिया, लायब्ररी बांधणी, बायोइन्फॉरमॅटिक्स विश्लेषणापर्यंत अनुक्रमे वन-स्टॉप उत्कृष्ट सेवा प्रदान करते.
●विस्तृत कौशल्य: विविध प्रजातींच्या विविध श्रेणींमध्ये यशस्वीरित्या पूर्ण झालेल्या WGBS अनुक्रम प्रकल्पांसह, BMKGENE एक दशकाहून अधिक अनुभव, एक अत्यंत कुशल विश्लेषण टीम, सर्वसमावेशक सामग्री आणि विक्रीनंतरचा उत्कृष्ट सपोर्ट आणते.
●ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स विश्लेषणासह सामील होण्याची शक्यता: RNA-seq सारख्या इतर omics डेटासह WGBS च्या एकात्मिक विश्लेषणास अनुमती देणे.
नमुना तपशील
| लायब्ररी | अनुक्रम धोरण | शिफारस केलेले डेटा आउटपुट | गुणवत्ता नियंत्रण |
| Bisulfite उपचार | Illumina PE150 | 30x खोली | Q३० ≥ ८५% बिसल्फाइट रूपांतरण > 99% |
नमुना आवश्यकता
| एकाग्रता (ng/µL) | एकूण रक्कम (µg) | अतिरिक्त आवश्यकता | |
| जीनोमिक डीएनए | ≥ ५ | ≥ 400 ng | मर्यादित ऱ्हास किंवा दूषितता |
सेवा कार्य प्रवाह
नमुना वितरण
डीएनए काढणे
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
डेटा वितरण
खालील विश्लेषणाचा समावेश आहे:
● कच्चा अनुक्रम गुणवत्ता नियंत्रण;
● संदर्भ जीनोमसाठी मॅपिंग;
● 5mC मिथाइलेटेड बेस शोधणे;
● मेथिलेशन वितरण आणि भाष्य यांचे विश्लेषण;
● डिफरेंशियल मेथिलेटेड क्षेत्रांचे विश्लेषण (DMRs);
● DMR शी संबंधित जनुकांचे कार्यात्मक भाष्य.
5mC मेथिलेशन डिटेक्शन: मेथिलेटेड साइट्सचे प्रकार
मेथिलेशन नकाशा. 5mC मेथिलेशन जीनोम-व्यापी वितरण
उच्च मिथाइलेटेड प्रदेशांचे भाष्य
भिन्न मेथिलेटेड क्षेत्रे: संबंधित जीन्स
डिफरेंशियल मेथिलेटेड क्षेत्रे: संबंधित जीन्सचे भाष्य (जीन ऑन्टोलॉजी)
BMKGene च्या संपूर्ण जीनोम बिसल्फाईट सिक्वेन्सिंग सेवांद्वारे प्रकाशनांच्या क्युरेट केलेल्या संग्रहाद्वारे सुलभ संशोधन प्रगती एक्सप्लोर करा.
फॅन, वाय. इत्यादी. (2020) 'पूर्ण-जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रम वापरून मेंढीच्या कंकाल स्नायूंच्या विकासादरम्यान डीएनए मेथिलेशन प्रोफाइलचे विश्लेषण',बीएमसी जीनोमिक्स, 21(1), pp. 1-15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
झाओ, एक्स आणि इतर. (2022) 'विनाइल क्लोराईडच्या संपर्कात असलेल्या कामगारांमध्ये कादंबरी डीऑक्सीरिबोन्यूक्लिक ॲसिड मेथिलेशन विकृती',विषशास्त्र आणि औद्योगिक आरोग्य, ३८(७), पृ. ३७७–३८८. doi: 10.1177/07482337221098600
झुओ, जे. आणि इतर. (2020) 'जीनोम मेथिलेशन, नॉन-कोडिंग RNAs, mRNAs आणि टोमॅटो फळ पिकवताना मेटाबोलाइट्सची पातळी यांच्यातील संबंध',प्लांट जर्नल, 103(3), pp. 980-994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
